Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0046700
Sequence Length
490 nt
GC Content
0.3184
GCAACACAACCCUAAUGGAGCACCUUUGACACCCAGUAACUCACAAAAGCAUGCAGGUUUAAAAACUCUCAGAUCUAACAGUGUGGGCCACAGCUUAUGAUAUGGAAUGGAAUCUCCUAUCACAAAGAGGAAGAAACACCAUUCAUUUCAAAUAUAUGCAUCCAAAACCAUCAUUUCUCCUUUCCUAAUCCCUUUGUAGAAAAUGUCUUCUUCAAGCAUUUGAAUUUAGAUAUUGAAUAUAAAAUAUUAGAAGGACUUUUAAAUGCAUCCUGAAAUUCUAUUCUAGCAAGAGCUCCCGAGUUUUCAUCUUCUGCUUACAUUACCUUUUUCUUUAAUUUAUCUAAGGAAAGGUAAAAUGUUUCCAAACACAUGAUAUAAAAAGGUUAAUACAUUUUUAUAAAUGUGGUUAAGGCAUUCAACACUCUAAAUAAACUUUAUUCAACUAUGUACUUAACACAUAAGUAAAUAUUUUGAUGAUUUCAAGAAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-83.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -92.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 97.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...........((((((((((....(((........(((((......((((..((((((..........))))))....))))(((....(((((.((...(((((((((((.((((.........)))).(((......)))..((((.....((((((..((((..........(((((..(((((...((((((...(((((((..(((((....)))))...)))))))...))))))..)))))))))).))))..))))))..))))))))))))))).)).))))))))))))).))).....))))).))))))(((((((((.((.(((((...(((((.((...)).)))))...(((((..((((((((.((....)).)))))))).)))))((((((((((.............................)))).)))))).................))))).)).)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.........,,...,||,{,....,{{.......}...,,,....{{{{{.(.((({...(((((((..,.,,......,,,|(((....(((((.((...((((((((({(,((((.........)))}.||,......}}},{{(({.....((((((..((((..........(((((..(((((...((((((...(((((((..(((((....)))))...)))))))...))))))..)))))))))).))))..))))))..)))}))))))))))).)).)))))}}}))))))).}}}},)))))}...,|,)(((((((((.({.(((((.,,(((((.({...}).)))))...(((((..((((((((.((....)).)))))))).))))){{{{(({{{{...........,,......,,,.......||}|.||||}}...,,,}}......,,.))))).}).)))))))))
Back