Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP6_0004200
Sequence Length
1802 nt
GC Content
0.4678
AUUUAUGUAUUGGACUGAAUGGGGUGGAAAACCUAAGAUAGACAGAGCUGCAAUGGAUGGAAGUGAACGUACUACCUUAGUUCCAAAUGUGGGGCGGGCAAACGGCCUAACUAUUGAUUAUGCUAAAAGGAGGCUUUAUUGGACAGACCUGGACACCAACUUAAUAGAAUCUUCAAAUAUGCUUGGGCUCAACCGUGAAGUUAUAGCAGAUGACUUGCCUCAUCCUUUUGGCUUAACUCAGUACCAAGAUUAUAUCUACUGGACGGACUGGAGCCGACGCAGCAUUGAGCGUGCCAACAAAACCAGUGGCCAAAACCGCACCAUCAUUCAGGGCCAUUUGGAUUAUGUGAUGGACAUCCUCGUCUUUCACUCAUCUCGACAGUCAGGGUGGAAUGAAUGUGCUUCCAGCAAUGGGCACUGCUCCCACCUCUGCUUGGCUGUGCCAGUUGGGGGUUUUGUUUGUGGAUGCCCUGCCCACUACUCUCUUAAUGCUGACAACAGGACUUGUAGUGCUCCUACGACUUUCCUGCUCUUCAGUCAAAAGAGUGCCAUCAACCGCAUGGUGAUUGAUGAACAACAGAGCCCCGACAUCAUCCUUCCCAUCCACAGCCUUCGGAAUGUCCGGGCCAUUGACUAUGACCCACUGGACAAGCAACUCUAUUGGAUUGACUCACGACAAAACAUGAUCCGAAAGGCACAAGAAGAUGGCAGCCAGGGCUUUACUGUGGUUGUGAGCUCAGUUCCGAGUCAGAACCUGGAAAUACAACCCUAUGACCUCAGCAUUGAUAUUUACAGCCGCUACAUCUACUGGACUUGUGAGGCUACCAAUGUCAUUAAUGUGACAAGAUUAGAUGGGAGAUCAGUUGGAGUGGUGCUGAAAGGCGAGCAGGACAGACCUCGAGCCGUUGUGGUAAACCCAGAGAAAGGGUAUAUGUAUUUUACCAAUCUUCAGGAAAGGUCUCCUAAAAUUGAACGGGCUGCUUUGGAUGGGACAGAACGGGAGGUCCUCUUUUUCAGUGGCUUAAGUAAACCAAUUGCUUUAGCCCUUGAUAGCAGGCUGGGCAAGCUCUUUUGGGCUGAUUCAGAUCUCCGGCGAAUUGAAAGCAGUGAUCUCUCAGGUGCUAACCGGAUAGUAUUAGAAGACUCCAAUAUCUUGCAGCCUGUGGGACUUACUGUGUUUGAAAACUGGCUCUAUUGGAUUGAUAAACAGCAGCAAAUGAUUGAAAAAAUUGACAUGACAGGUCGAGAGGGUAGAACCAAAGUCCAAGCUCGAAUUGCCCAGCUUAGUGACAUUCAUGCAGUAAAGGAGCUGAACCUUCAAGAAUACAGACAGCACCCUUGUGCUCAGGAUAAUGGUGGCUGUUCACAUAUUUGUCUUGUAAAGGGGGAUGGUACUACAAGGUGUUCUUGCCCCAUGCACCUGGUUCUACUUCAAGAUGAGCUAUCAUGUGGAGAACCUCCAACAUGUUCUCCUCAGCAGUUUACUUGUUUCACGGGGGAAAUUGACUGUAUCCCUGUGGCUUGGCGGUGCGAUGGGUUUACUGAAUGUGAAGACCACAGUGAUGAACUCAAUUGUCCUGUAUGCUCAGAGUCCCAGUUCCAGUGUGCCAGUGGGCAGUGUAUUGAUGGUGCCCUCCGAUGCAAUGGAGAUGCAAACUGCCAGGACAAAUCAGAUGAGAAGAACUGUGAAGUGCUUUGUUUAAUUGAUCAGUUCCGCUGUGCCAAUGGUCAGUGCAUUGGAAAGCACAAGAAGUGUGAUCAUAAUGUGGAUUGCAGUGACAAGUCAGAUGAACUGGAUUGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-539.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -580.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 468.21
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...((((..(((((((...((((.....))))....((((((((((((((.((((.((.((((....)))).))...((((((....))))))((((.....))))...(((((((((.(((((((((((((.....((..((....))..)).................(((....((((..((((((....)).))))..))))..)))...)))...)))))))))).))).))))))...((((...))))(((((.((.((((((((.(((.(.....(((((((((........(((((((((....................))))).)))).....((((.((((......)))).))))...(((((((.((((((((((.......((((..(((....))))))).....)))))).((((..((((((((((((.(((((((((((.((((..((...))))))..(.(((((...(((((...(((((.((((((.....))))))...)))))....)))))...))))).).((((((.(((...))).))))))...)))))))))))...........(((((((((((((((...(..((((((((.(((.....))).)))...)))))..).((((....(((((((((((((((...((((((.((....(((.((......))...)))..))..))).))).)))))))).))))))).))))(((...)))(((((((((((((...(((.((((...........((((.(((((.((((((((.(((.(....(((....((((((....))))))....)))..).))).)))).)))))))))))))...(((..(.(((.....))))..))))))).)))............)))))...))))))))..((((.((.((((......)))))).))))...))))))...)))))))))((((((((..((((((.....((((.((((.((((((.....)))))).)))).))))..(((((((..(((((.....(((((((((...(((((.(..((.........)).).))))).))))((((((......))))))........)))))...))))))))))))))))))..)))).))))..)))))))................)))))))))...((((.....))))....))))..)))))))(((((((((((..(((((((((.(......).))))).).))).......((((......))))......(((((((((((((....(((((.....((((((((..(((........)))..))))))))...)))))....)).)).....)))))))))...........)))))))))))((((.((((((....((.(((((((.........))))))).))..)))))))))).......((((.((((((...((((.(((((((((.(((((((.....))..)))....)).))).)))))).))))...)))))).)))))))))))))).)))...)))))))).)))))))(((((.(((....))).))))))))).)))).((......)).(((.((((..(...((....))...)..))).).))))))))))))).....)))))))(((((.(((...))))))))(((((((..((((.....))))..)).))))).....))))))(((((.((((.....)))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...{(({,,(((((({.{{((((,,,,.,}}}....((((((((((((((.{{{,,(({(,((,...,,,,.},}}},|||||...,||||||({,,...},})))..,,{{((((((.(((((((((((((..,.,((,.,{....||,.,,}}|.......,|,....,|.....,{{{,|({,{{,.,,.,}|{|||{{,,,,.})))}},))),..}))))))))).))).)))|||{{{.,(.{{{{{{{(((((.((.((((((((.(,,.,.,,.{(((((((((........(((((((((......,.............)))))}}})).,...((((.((((......)))).))))...(((((((.((((((((((...,...((((..(((....)))))))...,.)))))).((((..((((((((((((.(((((((((((.((((..{,...}})))),{({((,((...(((((..,(((((.((((((.....))))))...))))).,..))))).,,,))))}).((((((.(((...))).))))))...))))))))))).......,,..(((((((((,,(((((((({.((((((((.(((.....))).)))...)))))..|,,.{(...,||{|||,|{{{,{,{....,.,|,}}}},,,)}|.........,|({{{{{.,||{{||,{,||{||||||||.|||||.|.||||{|.,..,|{({{{{{{{{{{{{.,,|{{,|{|,,,,,,..,||,||||||{(((.(({{{{{{.{{{,||,,,|{{....((((((....))))))....}}}.||,|||,|}}}|||||}}}}}}}}}.,.(((..(.(((.....))))..))),}}}.)}}..,{{{......,))))...)}}}}}}}.}||,,,||}||{{..,,,,)))),..,}}}...,)))))},.))))))))).,}}.(,((((((((({{...((((.((((.((((((.....)))))).)))).)))).}|.}}|(((((,.(((((....))))),.}))))}})))).|,...{{,{,.(((((((((((.(((((((.....{({{{,,.,..,....,},...}}})},)))})))).)))).))))))).}))),.))))))),{,...,,...,,...)))))))))...{{{(.....}}}}....))))..))))))){((((((((((..(({{(((((.{....,,,.}}}}}.|,|}}..,|,,||{||....|,)))}..,{{,{{{{{,,,..{((((((((.(({{.{.,,|,||||.}|||,}}}}}.,|,,..,}))))))...,||{{,,.{{,{{,....|}}}},)}}.}}}}.,}},..))))))))))}((((.((((((....((.(((((((.........))))))).))..))))))))))...{{{{((({,{{{,,,...|,|))||)))|{||,||({,{{{,{{{{{{{{,,...{||{,,,.,)))),.}}))}}}))}}))}))),)))))))))).))}...)))))))).)))))))}||,,,|||}.}..))}))),|||||.,,,,.,|}}}.,}}}.(({.{(((..{...((....))...}..))).}.))))))))))))).,,..}}}})))}|||{.,||,.,)))))))||||{{{{..{(((.....))})..}}.}}}}}}.,,,))))))(((((.{(((.....)))}.)))))
Back