Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP6_0007000

Sequence Length

1635 nt

GC Content

0.4765

GUUCCAACCCCUGUGCUGAGGAAAACGGGGGAUGUAGCCAUCUCUGCCUCUAUAGACCUCAGGGCCUUCGCUGUGCUUGCCCUAUUGGCUUUGAACUCAUCAGUGACAUGAAGACCUGCAUUGUCCCAGAGGCUUUCCUUUUGUUUUCACGGAGAGCAGAUAUCAGACGAAUUUCUCUGGAAACAAACAAUAAUAAUGUGGCUAUUCCACUCACUGGUGUCAAAGAAGCUUCUGCUUUGGAUUUUGAUGUGACAGACAACCGAAUUUAUUGGACUGAUAUAUCACUCAAGACCAUCAGCAGAGCCUUUAUGAAUGGCAGUGCACUGGAACAUGUGGUAGAAUUCGGCUUAGAUUAUCCAGAAGGCAUGGCAGUAGACUGGCUUGGGAAGAACUUGUACUGGGCAGACACAGGAACGAAUCGAAUUGAGGUGUCAAAGUUGGAUGGGCAGCACCGACAAGUUUUGGUGUGGAAAGACCUAGAUAGUCCCAGAGCUCUCGCGUUGGACCCUGCCGAAGGAUUUAUGUAUUGGACUGAAUGGGGUGGAAAACCUAAGAUAGACAGAGCUGCAAUGGAUGGAAGUGAACGUACUACCUUAGUUCCAAAUGUGGGGCGGGCAAACGGCCUAACUAUUGAUUAUGCUAAAAGGAGGCUUUAUUGGACAGACCUGGACACCAACUUAAUAGAAUCUUCAAAUAUGCUUGGGCUCAACCGUGAAGUUAUAGCAGAUGACUUGCCUCAUCCUUUUGGCUUAACUCAGUACCAAGAUUAUAUCUACUGGACGGACUGGAGCCGACGCAGCAUUGAGCGUGCCAACAAAACCAGUGGCCAAAACCGCACCAUCAUUCAGGGCCAUUUGGAUUAUGUGAUGGACAUCCUCGUCUUUCACUCAUCUCGACAGUCAGGGUGGAAUGAAUGUGCUUCCAGCAAUGGGCACUGCUCCCACCUCUGCUUGGCUGUGCCAGUUGGGGGUUUUGUUUGUGGAUGCCCUGCCCACUACUCUCUUAAUGCUGACAACAGGACUUGUAGUGCUCCUACGACUUUCCUGCUCUUCAGUCAAAAGAGUGCCAUCAACCGCAUGGUGAUUGAUGAACAACAGAGCCCCGACAUCAUCCUUCCCAUCCACAGCCUUCGGAAUGUCCGGGCCAUUGACUAUGACCCACUGGACAAGCAACUCUAUUGGAUUGACUCACGACAAAACAUGAUCCGAAAGGCACAAGAAGAUGGCAGCCAGGGCUUUACUGUGGUUGUGAGCUCAGUUCCGAGUCAGAACCUGGAAAUACAACCCUAUGACCUCAGCAUUGAUAUUUACAGCCGCUACAUCUACUGGACUUGUGAGGCUACCAAUGUCAUUAAUGUGACAAGAUUAGAUGGGAGAUCAGUUGGAGUGGUGCUGAAAGGCGAGCAGGACAGACCUCGAGCCGUUGUGGUAAACCCAGAGAAAGGGUAUAUGUAUUUUACCAAUCUUCAGGAAAGGUCUCCUAAAAUUGAACGGGCUGCUUUGGAUGGGACAGAACGGGAGGUCCUCUUUUUCAGUGGCUUAAGUAAACCAAUUGCUUUAGCCCUUGAUAGCAGGCUGGGCAAGCUCUUUUGGGCUGAUUCAGAUCUCCGGCGAAUUGAAAGCAGUGAUCUCUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-491.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -523.74

Frequency: 0.0000

Diversity: 531.12

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.((.(((((((..........))))))).)).)))(....(((((((((...(((((((..(.(((((((((.((((((....((((((.....(((((((((...(((...(((((((((.(((((((..((((((((((((((...)))))))))....))..)))..)))))))............)))))))))...)))...))))))))).....))))))((((((.(((.((((((.(((((((....((((.....)))).))).....)))))))))))))..))))))(((.........)))(((((((((((..((.((((........)).)).))..)))))....((.(.(((....))).).)).........)))))))))))).)))))...))))..)..)))))))........))))..)))))((((((......)))))).((.....))......((((((((((((..(((((((..((.((((.((....((((..(((((((((...((((.....))))..........((((((...((((((........))).)))...))))))(((..((.((((.(.....).)))).))..))).(((.(((((((((((((.....((..((....))..)).................(((....((((..((((((....)).))))..))))..)))...)))...)))))))))).))).))))).))))...))))....))...))).).))..))))))).((((.....))))...........((((......)))).(((((.(((..((((.((((((((((((((.((((......)))).)).......(((..(((((((((((.......((((..(((....))))))).....)))))((((...(((((((...(((((((.(((((((.((((..((...))))))..(.(((((...(((((...(((((.((((((.....))))))...)))))....)))))...))))).).((((((.(((...))).))))))...))))))))))))))...............)))))))..)))).((((((((.(((.....))).)))...)))))...............))))))..)))....)))))))))))).))).)..))))))))((((((.((.....)).)))))).))))))...((((((.(((..(((((((((((((((((...(((.((((...........((((.(((((.((((((((.(((.(....(((....((((((....))))))....)))..).))).)))).)))))))))))))...(((..(.(((.....))))..))))))).)))............)))))...))))))))..((((.((.((((......)))))).))))..))))))).)))))))))))).....(((((((((((((((((((.((((.((((((.....)))))).)))).))))..((.(((((((..(((((....)))))..)))))....)).)).....))))).)).)))))))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((,((.(((((((..,...,...})}))}}.||.}||(,,,{({({{{,,,,,,{((((((,,(,(((((((((,((((((....((((((.....(((((((((...(((..,(((((((((.((((((({{((((.{{(({{{{{,.|)))))),|,..,,....}},,,)))))))..,,,.......}}}))))))...)))...))))))))).....)))))}((((((.(((.((((((.((((,{,.,,.((((.....)))).,)).....)))))))))))))..))))))(((.,.......)})|{{{{,(((((..{(.{(((.,....,.))},}.}}..))))).,,|{,.(.{{{....)}}})}}||,.,,..}}}}},}})))))).}}))),..}}}}..,..))))})).}}...||||||{|||}}||||{({...,,,}}|||}|,{..,,||}..,|,.{{{{{{{.((,...||{||||.,{{||{{{.,{|{{,{{{{,.{{{{{{({{.,|(({{.....}))),...,,|.,,,.{{{|{,.{{{{{({{{{{{,..,}.}},,,.}}||||||...,|}||}|{{{{...},))))..,{{{{{{(((.(((((((((((((..,.,((,.,{....||,.,,}}|.......,|,....,|.....,{{{,|({,{{,.,,.,}|{|||{{,,,,.})))}},))),..}))))))))).))).))))),||||{{{...))))..))).}}|{{{||{{||||,||{(....{{({(((((..,....(((((((((....................)))))}}})).},..{{({.{(((......)))).))})|||||{|||,,,.|,||||||.,.,,..,((({.,,|,},.,,))))).}})),,,,,.)))))}|||}..,)))|||,(((((((((((.((((..{{...}})))),{({((,((...(((((..,(((((.((((((.....))))))...))))).,..))))).,.,))))}).((((((.(((...))).))))))...))))))))))),},....||},{{{{{{{|||,(((({({({.((((((((.(((.....))).)))...)))))..{,,.{{...,||||||.||,,.,.|....},,}})))},,,))).......,,}|||{{((,,{|,,,,,||||{||||||||{||||,.|.))|}||,,,,}||{{{{{{||,||||.,.|||}||||,,.,...,||.(((||(((((.(({(((({.(((.{,...(({....((((((....))))))....))).||.))).})))||))}))))))))).,,(((..(.(((.....))))..))),}}},|||..{{{{......,))))...}}}}}})),}}|,,,||,||{,..},,,)))),..,,}}...,)))))}}.))))))))),.},..(((((((({{{{{{{((((.((((.((((((.....)))))).)))).})))..|,||{(((((..(((((....))))),.})))).}},}}.}}....,})})).)).)))))))).)