Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP6_0007900

Sequence Length

1232 nt

GC Content

0.4789

GUUCCAACCCCUGUGCUGAGGAAAACGGGGGAUGUAGCCAUCUCUGCCUCUAUAGACCUCAGGGCCUUCGCUGUGCUUGCCCUAUUGGCUUUGAACUCAUCAGUGACAUGAAGACCUGCAUUGUCCCAGAGGCUUUCCUUUUGUUUUCACGGAGAGCAGAUAUCAGACGAAUUUCUCUGGAAACAAACAAUAAUAAUGUGGCUAUUCCACUCACUGGUGUCAAAGAAGCUUCUGCUUUGGAUUUUGAUGUGACAGACAACCGAAUUUAUUGGACUGAUAUAUCACUCAAGACCAUCAGCAGAGCCUUUAUGAAUGGCAGUGCACUGGAACAUGUGGUAGAAUUCGGCUUAGAUUAUCCAGAAGGCAUGGCAGUAGACUGGCUUGGGAAGAACUUGUACUGGGCAGACACAGGAACGAAUCGAAUUGAGGUGUCAAAGUUGGAUGGGCAGCACCGACAAGUUUUGGUGUGGAAAGACCUAGAUAGUCCCAGAGCUCUCGCGUUGGACCCUGCCGAAGGAUUUAUGUAUUGGACUGAAUGGGGUGGAAAACCUAAGAUAGACAGAGCUGCAAUGGAUGGAAGUGAACGUACUACCUUAGUUCCAAAUGUGGGGCGGGCAAACGGCCUAACUAUUGAUUAUGCUAAAAGGAGGCUUUAUUGGACAGACCUGGACACCAACUUAAUAGAAUCUUCAAAUAUGCUUGGGCUCAACCGUGAAGUUAUAGCAGAUGACUUGCCUCAUCCUUUUGGCUUAACUCAGUACCAAGAUUAUAUCUACUGGACGGACUGGAGCCGACGCAGCAUUGAGCGUGCCAACAAAACCAGUGGCCAAAACCGCACCAUCAUUCAGGGCCAUUUGGAUUAUGUGAUGGACAUCCUCGUCUUUCACUCAUCUCGACAGUCAGGGUGGAAUGAAUGUGCUUCCAGCAAUGGGCACUGCUCCCACCUCUGCUUGGCUGUGCCAGUUGGGGGUUUUGUUUGUGGAUGCCCUGCCCACUACUCUCUUAAUGCUGACAACAGGACUUGUAGUGCUCCUACGACUUUCCUGCUCUUCAGUCAAAAGAGUGCCAUCAACCGCAUGGUGAUUGAUGAACAACAGAGCCCCGACAUCAUCCUUCCCAUCCACAGCCUUCGGAAUGUCCGGGCCAUUGACUAUGACCCACUGGACAAGCAACUCUAUUGGAUUGACUCACGACAAAACAUGAUCCGAAAGGCACAAGAAGAUGGCAGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-366.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -391.73

Frequency: 0.0000

Diversity: 290.08

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.((.(((((((..........))))))).)).)))(....((((((((....(((((((..(.(((((((((.((((((....((((((.....(((((((((...(((...(((((((((.(((((((..((((((((((((((...)))))))))....))..)))..)))))))............)))))))))...)))...))))))))).....))))))((((((.(((.((((((.(((((((....((((.....)))).))).....)))))))))))))..))))))(((.........)))(((((((((((..((.((((........)).)).))..)))))....((.(.(((....))).).)).........)))))))))))).)))))...))))..)..)))))))........(((((((((((((((((......))))))......(((.......)))((((.((....)).))))...)))))(((((((..((((..((..(((....((((.....))))....))).))..(((.((.....(((((.(((..........))).)))))....)).)))((((.....))))...(((((((((.(((((((((((((.....((..((....))..)).................(((....((((..((((((....)).))))..))))..)))...)))...)))))))))).))).))))))(((((((...))))..)))...((((((((((((.((((....(((((((((.......(((((((((....................))))).)))).....((((.((((......)))).))))((((.((.((.......)).))))))...((((...))))...))))).))))......))))))))))...)))))).(((((((((((.((((..((...))))))..(.(((((...(((((...(((((.((((((.....))))))...)))))....)))))...))))).).((((((.(((...))).))))))...))))))))))).)))).))))))).))))))..(((((((((.((((((((.(((.....))).)))...)))))(((((.((....)).))).))...............)))).)))))......))).)))))...)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.((.(((((((..........))))))).)).)))(....((((((((..,.(((((((..{.(((((((((.((((((....((((((.....(((((((((...(((...(((((((((.((((((({{((((.,,((,,,,|,.}))))))}||..,,....))}..}))))))............}))))))))...)))...))))))))).....))))))((((((.(((.((((((.((((,{,.,,.((((.....)))).,)).....)))))))))))))..))))))(((.........))){((((,(((((..((.((((.,....,.))},}.))..)))))..,|||.(.{{{....)}),)}}|{......},}})})})))))).)))))...))))..}..))))))).}....{,{((((((({{(((((((......})))))|{{....,|}..,,..{{{({((.((....)).)))),,,|||||(,{((((.,({({.{(({,((({.{{((((.....,))},...,||.,,,.((({{,.{{{,{((,({{{,..,}.}},,,,}}|||}||...,||||||((,,...},})))..,{{{{({(((.(((((((((((((..,.,((,.,{....||,.,,}}|.......,|,....,|.....,{{{,|({,{{,.,,.,}|{|||{{,,,,.})))}},))),..}))))))))).))).)))))}||||{{{...))))..))).|}|{(((({(((((.((((....(((((((((.......(((((((((.............,......)))))}}})).,...((((.((((......)))).)))){{{{|{,,{,.,,|,||||||,,.,,..,((({.,,}}},.,,))))).))))..,...))))))))))...)))))}.(((((((((((.((((..{{...}})))),{({((,((...(((((..,(((((.((((((.....))))))...))))).,..))))).,.,))))}).((((((.(((...))).))))))...))))))))))).}},,.,}}))}))))))))}.(((((((((.((((((((.(((.....))).)))...))))).,{{{.{{....}}.}}}.,},,...,,,..},,},))))}}})))......))).)))))...)