Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP6_0008100
Sequence Length
2545 nt
GC Content
0.4609
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-748.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -799.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 869.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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