Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP6_0008200
Sequence Length
1449 nt
GC Content
0.4727
GUUAUGAAUACUGAUGGCACUGGGAGACGAGUACUAGUGGAAGACAAAAUUCCUCACAUAUUUGGAUUUACUUUGUUGGGUGACUAUGUUUACUGGACUGACUGGCAGAGGCGUAGCAUUGAAAGAGUUCAUAAACGAAGUGCAGAGAGGGAAGUGAUCAUAGAUCAGCUGCCUGACCUCAUGGGCCUAAAGGCUACAAAUGUUCAUCGAGUGAUUGGUUCCAACCCCUGUGCUGAGGAAAACGGGGGAUGUAGCCAUCUCUGCCUCUAUAGACCUCAGGGCCUUCGCUGUGCUUGCCCUAUUGGCUUUGAACUCAUCAGUGACAUGAAGACCUGCAUUGUCCCAGAGGCUUUCCUUUUGUUUUCACGGAGAGCAGAUAUCAGACGAAUUUCUCUGGAAACAAACAAUAAUAAUGUGGCUAUUCCACUCACUGGUGUCAAAGAAGCUUCUGCUUUGGAUUUUGAUGUGACAGACAACCGAAUUUAUUGGACUGAUAUAUCACUCAAGACCAUCAGCAGAGCCUUUAUGAAUGGCAGUGCACUGGAACAUGUGGUAGAAUUCGGCUUAGAUUAUCCAGAAGGCAUGGCAGUAGACUGGCUUGGGAAGAACUUGUACUGGGCAGACACAGGAACGAAUCGAAUUGAGGUGUCAAAGUUGGAUGGGCAGCACCGACAAGUUUUGGUGUGGAAAGACCUAGAUAGUCCCAGAGCUCUCGCGUUGGACCCUGCCGAAGGAUUUAUGUAUUGGACUGAAUGGGGUGGAAAACCUAAGAUAGACAGAGCUGCAAUGGAUGGAAGUGAACGUACUACCUUAGUUCCAAAUGUGGGGCGGGCAAACGGCCUAACUAUUGAUUAUGCUAAAAGGAGGCUUUAUUGGACAGACCUGGACACCAACUUAAUAGAAUCUUCAAAUAUGCUUGGGCUCAACCGUGAAGUUAUAGCAGAUGACUUGCCUCAUCCUUUUGGCUUAACUCAGUACCAAGAUUAUAUCUACUGGACGGACUGGAGCCGACGCAGCAUUGAGCGUGCCAACAAAACCAGUGGCCAAAACCGCACCAUCAUUCAGGGCCAUUUGGAUUAUGUGAUGGACAUCCUCGUCUUUCACUCAUCUCGACAGUCAGGGUGGAAUGAAUGUGCUUCCAGCAAUGGGCACUGCUCCCACCUCUGCUUGGCUGUGCCAGUUGGGGGUUUUGUUUGUGGAUGCCCUGCCCACUACUCUCUUAAUGCUGACAACAGGACUUGUAGUGCUCCUACGACUUUCCUGCUCUUCAGUCAAAAGAGUGCCAUCAACCGCAUGGUGAUUGAUGAACAACAGAGCCCCGACAUCAUCCUUCCCAUCCACAGCCUUCGGAAUGUCCGGGCCAUUGACUAUGACCCACUGGACAAGCAACUCUAUUGGAUUGACUCACGACAAAACAUGAUCCGAAAGGCACAAGAAGAUGGCAGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-423.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -454.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 471.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((........))))).((((((..((((((...(.((((.......)))).)...))))))..))...((((((((((.(((.((((((.((((((..((..(((.(......).)))..)))))))))))))).))))).((((((.(..(((((...)))))..).)))...)))...((((....))))....(((((((....(((.(((((((((..((..((.((((((.....((((((((....))))....))))......)))))).))....((((((((((((((((.((((((.....(((((((((...(((...(((((((((.(((((((..((((((((((((((...)))))))))....))..)))..)))))))............)))))))))...)))...))))))))).....))))))((((((.(((.((((((.(((((((....((((.....)))).))).....)))))))))))))..))))))(((.........))).......((((((.((.(((((.((...((((...(((((((.........(((((...(((((((((............)))))).(((((.....(((......)))..)))))...(((((.((.....)))))))..(((((((.((.......((((..(((((((((.((....)).))))..(((.....)))............)))))..)))).......)))))))))...))).)))))..)))))))))))....)).))))).))))))))...)))))))))))..))))).....(((((((((.(((((((((((((.....((..((....))..)).................(((....((((..((((((....)).))))..))))..)))...)))...)))))))))).))).))))))(((((((...))))..)))..))..)))))))))))).....))))))).))))))))....((((......)))).(((((.(((..((((.((((((((((((((.((((......)))).)).......(((..(((((((((((.......((((..(((....))))))).....)))))((((...(((((((...(((((((.(((((((.((((..((...))))))..(.(((((...(((((...(((((.((((((.....))))))...)))))....)))))...))))).).((((((.(((...))).))))))...))))))))))))))...............)))))))..)))).((((((((.(((.....))).)))...)))))...............))))))..)))....)))))))))))).))).)..))))))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((......,.))))).((((..,.((((.,..{(((((((((....,((((((((({,||,,....,,((({(({((((,(({(((((,{((,,{,..,,..|||}|}}}}}))}))},.}}}))}}},,,}}}.}|}{|{((((((,,,,(((((...))))).,).)))..,|}}.,|((((....)))}....,,{{{((,...|||,{(((((,((.(((((((..,.......))))))).}|.}}})},}}}}|}}|,{{{{{((((((({{({.,(((,((((((((((..,,(((((({,.,.({((((({,...,,,..{(((,,((({{(((((({{(((((.{((((((((,.|||||},.{,........},,,})))))))}}}}}},.....,,,,}||||...,})}},}|||||,||{{,.,||}|||((((((.(((.((((((.((((,{,.,,.((((.....)))).,)).....)))))))))))))..))))))||{}}}.},,.,),)}|||,.(((((..{(.{(((.,....,.))},}.}}..))))).,{{(,.(.{,,....)}}})}}}|}}}}..}},,,.)))))))).,,)))}..,,,,....}))))})},))}}}}}||},,}}})}})}),{{..,{{{||(({,{,,....,}),,.,..,}}}}}}}||}.,.))|,,)).}||}|,,,.}|}.|}||}|..,{{{,((({,{{((((.....,))},...,}}.|,|.|||||,.||,,|({,{|{{,..,},}},}},}}|}))||...,||||||{{,,...},))))..,{{{{({(((.(((((((((((((..,.,{(,.,{....||,.,,}}}.,.....,|,....,|.....,{{|,|{{{{{,.,,.,}|{|||{{,,,,.})))}},))),..}))))))))).))).)))))}{{|{({{...))))..))).|}}..,}),})))}})).,,..}}}))}},)}}}}}},.{||||||||....,,,}.||.,|.|||.,||))}||}|)|,})))))}.))}.......))))))))))...)))),,(({((((((((...,...((((..(((....)))))))...,.))))),}}},,|||||}}|}},((({(((((((((((.((((..{{...}})))),{({((,((...(((((..,(((((.((((((.....))))))...))))).,..))))).,.,))))}).((((((.(((...))).))))))...))))))))))))))..........{{{({,...(((((((({.((((((((.(((.....))).)))...))))).,{{,.{{....}}.})).}}...,......},}},)))))),)))....},.))))),..))))
Back