Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP6_0009100
Sequence Length
1815 nt
GC Content
0.4628
GUGCCACAGAAUUAUUGCUUUUAGCUCGAAGGACAGACUUGAGACGCAUUUCUUUGGAUACACCAGAUUUUACAGACAUUGUUCUGCAGUUAGAAGACAUCCGUCAUGCCAUUGCCAUAGAUUACGAUCCUGUGGAAGGCUACAUCUACUGGACUGAUGAUGAAGUGAGGGCCAUACGCCGUUCAUUUAUAGAUGGAUCUGGCAGUCAGUUUGUGGUCACUGCUCAAAUUGCCCAUCCUGAUGGUAUUGCUGUGGACUGGGUUGCACGAAAUCUUUAUUGGACAGACACUGGCACUGAUCGAAUAGAAGUGACAAGGCUCAAUGGGACCAUGAGGAAGAUCUUGAUUUCAGAGGACUUAGAGGAACCCCGGGCUAUUGUGUUAGAUCCCAUGGUUGGGUACAUGUAUUGGACUGACUGGGGAGAAAUUCCGAAAAUUGAGCGAGCAGCUCUGGAUGGUUCUGACCGUGUAGUAUUGGUUAACACUUCUCUUGGUUGGCCAAAUGGUUUAGCCUUGGAUUAUGAUGAAGGCAAAAUAUACUGGGGAGAUGCCAAAACAGACAAGAUUGAGGUUAUGAAUACUGAUGGCACUGGGAGACGAGUACUAGUGGAAGACAAAAUUCCUCACAUAUUUGGAUUUACUUUGUUGGGUGACUAUGUUUACUGGACUGACUGGCAGAGGCGUAGCAUUGAAAGAGUUCAUAAACGAAGUGCAGAGAGGGAAGUGAUCAUAGAUCAGCUGCCUGACCUCAUGGGCCUAAAGGCUACAAAUGUUCAUCGAGUGAUUGGUUCCAACCCCUGUGCUGAGGAAAACGGGGGAUGUAGCCAUCUCUGCCUCUAUAGACCUCAGGGCCUUCGCUGUGCUUGCCCUAUUGGCUUUGAACUCAUCAGUGACAUGAAGACCUGCAUUGUCCCAGAGGCUUUCCUUUUGUUUUCACGGAGAGCAGAUAUCAGACGAAUUUCUCUGGAAACAAACAAUAAUAAUGUGGCUAUUCCACUCACUGGUGUCAAAGAAGCUUCUGCUUUGGAUUUUGAUGUGACAGACAACCGAAUUUAUUGGACUGAUAUAUCACUCAAGACCAUCAGCAGAGCCUUUAUGAAUGGCAGUGCACUGGAACAUGUGGUAGAAUUCGGCUUAGAUUAUCCAGAAGGCAUGGCAGUAGACUGGCUUGGGAAGAACUUGUACUGGGCAGACACAGGAACGAAUCGAAUUGAGGUGUCAAAGUUGGAUGGGCAGCACCGACAAGUUUUGGUGUGGAAAGACCUAGAUAGUCCCAGAGCUCUCGCGUUGGACCCUGCCGAAGGAUUUAUGUAUUGGACUGAAUGGGGUGGAAAACCUAAGAUAGACAGAGCUGCAAUGGAUGGAAGUGAACGUACUACCUUAGUUCCAAAUGUGGGGCGGGCAAACGGCCUAACUAUUGAUUAUGCUAAAAGGAGGCUUUAUUGGACAGACCUGGACACCAACUUAAUAGAAUCUUCAAAUAUGCUUGGGCUCAACCGUGAAGUUAUAGCAGAUGACUUGCCUCAUCCUUUUGGCUUAACUCAGUACCAAGAUUAUAUCUACUGGACGGACUGGAGCCGACGCAGCAUUGAGCGUGCCAACAAAACCAGUGGCCAAAACCGCACCAUCAUUCAGGGCCAUUUGGAUUAUGUGAUGGACAUCCUCGUCUUUCACUCAUCUCGACAGUCAGGGUGGAAUGAAUGUGCUUCCAGCAAUGGGCACUGCUCCCACCUCUGCUUGGCUGUGCCAGUUGGGGGUUUUGUUUGUGGAUGCCCUGCCCACUACUCUCUUAAUGCUGACAACAGGACUUGUAGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-524.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -560.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 725.36
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((............(((((((((.(.(((((((.(((((((........(((((.....)))))))))).))...))))))).)))))))))).((((((...((.((((..((..((((.((.(((((((((.(((((((((...(((((((((((((((((((((((.....))).))))).....((.((.((.((((((..(((((((((((((.(((.....((((((((..(((((...)))))))).)))))(((((......((((((.(((((.........))).)).))))))........(((((...))).)).(((((((....(((.(((((..((((((...(....(((((((((((..(((((.(((((((........))))....))))))))(.((((....)))).).....((((.....)))).(.(((((....))))).)((((((.((.(((.(((.(((((..((......((((.(..((((((..(((..((....))..)))..))))))..).))))...))..)))))..)))))))).)))))))))))).)))))...))))).))..)))))..)))..)))))))....((((.....(((((.((.((((.((((((((.(((..........))))))))))))))).))))))).......)))))))))....))).)))))))))))))..)))))).))))))...((((....)))).......)))))).....))))).))))..((((((..........))))))))))))))).))(((((((.(((((..((((((.((.(((((((...((((.....((((((.....(((((((((...(((...(((((((((.(((((((..((((((((((((((...)))))))))....))..)))..)))))))............)))))))))...)))...))))))))).....))))))((((((.(((.((((((.(((((((....((((.....)))).))).....)))))))))))))..))))))(((.........)))......(((((..((.((((........)).)).))..)))))..))))..))))).))..))))))))......)))))..)))))))))))))).))))))....)).)))).))....)))))))))).(((..((((((((((.(((.(.....((((..(((((((((.((....)).))))..(((.....)))............)))))..)))).(((((...(((((.(((((...(((............)))....)).))).))))))))))...(((((..(((((..((((((...(((((((((.(((((((((((((.....((..((....))..)).................(((....((((..((((((....)).))))..))))..)))...)))...)))))))))).))).))))))(((((((...))))..))).(.((((((((((((.((((....(((((((((.......(((((((((....................))))).)))).....((((.((((......)))).))))((((.((.((.......)).))))))...((((...))))...))))).))))......))))))))))...)))))).)))))........))..)))))..)))))..............).))).)))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((({(((...{{(((((((((((.,.(((((({.{||{{{{......}}{((((.....))))},,}},.||...})))))).,)))))))}|,,{(((({(..(((.{{.(((((({{.....|,|)))))|,)))..((((.....,,.,|||}|||((((((((((.....))).})))))}...))))))}|,|}||||.,,|||||||,|||({((({,...{{,,,((({{,((((,,{|,,{{||,,,|||{{,((({{{,{{((((,,.{{{,,..{{{{{{{|,|.||{|,||||.{{{{{{{(((((...({{.{{.((((,,,..({({{.,.,||,}||||||,..}}..}||{|||||,||}}({(((.,(((((,{{(({{{{||{.{{{{,,,|||||({,,(({{..,|||,,.....((((.....))))|||{{((({{{,|||||.{((((((,(({(((.({,.{{{{|,|||}|},..,{((,{.{((((,{..,,,..|,}}}}),,,)),.,|||||}..|.||||,..}}..}}}}}.,|||||}}}.}}}}}}}}}}}|{||||,...|,}}}.)),|}||||.......)))),}.,,,||||||{,,,{{{{{{{(,((((.((((((((.(((,.{,....,.)))}))))))))}}},,.,|||}||,,,..,|,||}||{({({((,,,|(((((...))))).}).))},,||,}.,|((((....)))}.,....,,||||,..},}},{((({.((.(((((((..........))))))).)).))))}})}))}}||,,,|||,,|||{{|||||{{{{{(((({(((((.,,.((((((,....(((((((((...({{..,((({{((({,((((((({(((((.{{(({{{{{,.|||||}},|,...,....}},,,))))))),,,,,,......,}}})))))...}}),,.}}||||}}},,,..||}||}((((((.(((.((((((.((((,{,.,,.((((.....)))).,)).....)))))))))))))..))))))|{{,,,.,....)}),}||..(((((..{(.{(((.{....,.}}|,,.}}..)))))..||||.{|||{,.,.},}})|||||,,}..}}|||.}})))}}},||)))},.}},},,..,}}}}})}}})},,||||},}}}}))}|||||||,,{{{||({{,{.,..,.}}),,,,,.|||||||,||,.,,)),||||.,(({{{{,.}|}.,,{{,,,.{{{||{{{,.||{({{,....,))),.,.|||.|,,.|||||,.|||,|||||}||,..,}.))}}},))}))))}...|||||||{{||...}|})}}..,{{{||,{{{.(((((((((((({,,,..{(,.{{....}},.},}}},}....,,}}....}},,,,,||{|||(,,,,..}},,}{{|||{{..,..))))}}})))},.,))))))))).)}},)))))}|||{{{{...)))).,)),.|}|.|,}}||))}||(({{,...,,|}||||{..,....{{{(((({{......,,.,.......,,,)))))})})).....((((.((((......)))).))))..,})}}..}})))}),,},,}}}}.}}}}||..}}))).,)))),,)})},..})}.}))).))))).}})))))))))}))))}}}}}}))).,.)))).},))))..,.....}}}}})},,},.))))),}))}))))
Back