Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP6_0009700
Sequence Length
2224 nt
GC Content
0.4483
CGGCCCCUUUGUUGCUUUAUGCAAACAGACGGGACUUGCGAUUGGUUGAUGCUACAAAUGGCAAAGAGAAUGCUACGAUUGUAGUUGGAGGCUUGGAGGAUGCAGCUGCGGUGGACUUUGUGUUUAGUCAUGGCUUGAUAUACUGGAGUGAUGUCAGCGAAGAAGCCAUUAAACGAACAGAAUUUAACAAAACUGAGAGUGUGCAGAAUGUUGUUGUUUCUGGAUUAUUGUCCCCCGAUGGGCUGGCAUGUGAUUGGCUUGGAGAAAAAUUGUACUGGACAGAUUCUGAAACUAAUCGGAUUGAAGUUUCUAAUUUAGAUGGAUCUUUACGAAAAGUUUUAUUUUGGCAAGAGUUGGAUCAACCCAGAGCUAUUGCCUUAGAUCCUUCAAGUGGGUUCAUGUACUGGACAGACUGGGGAGAAGUGCCAAAGAUAGAACGUGCUGGAAUGGAUGGUUCAAGUCGCUUCAUUAUAAUAAACAGUGAAAUUUACUGGCCAAAUGGACUGACUUUGGAUUAUGAAGAACAAAAGCUUUAUUGGGCAGAUGCAAAACUUAAUUUCAUCCACAAAUCAAAUCUGGAUGGAACAAAUCGGCAGGCAGUGGUUAAAGGUUCCCUUCCACAUCCUUUUGCCUUGACGUUAUUUGAGGACAUAUUGUACUGGACUGACUGGAGCACACACUCCAUUUUGGCUUGCAACAAGUAUACUGGUGAGGGUCUGCGUGAAAUCCAUUCUGACAUCUUCUCUCCCAUGGAUAUACAUGCCUUCAGCCAACAGAGGCAGCCAAAUGCCACAAAUCCAUGUGGAAUUGACAAUGGGGGUUGUUCCCAUUUGUGUUUGAUGUCUCCAGUCAAGCCUUUUUAUCAGUGUGCUUGCCCCACUGGGGUCAAACUCCUGGAGAAUGGAAAAACCUGCAAAGAUGGUGCCACAGAAUUAUUGCUUUUAGCUCGAAGGACAGACUUGAGACGCAUUUCUUUGGAUACACCAGAUUUUACAGACAUUGUUCUGCAGUUAGAAGACAUCCGUCAUGCCAUUGCCAUAGAUUACGAUCCUGUGGAAGGCUACAUCUACUGGACUGAUGAUGAAGUGAGGGCCAUACGCCGUUCAUUUAUAGAUGGAUCUGGCAGUCAGUUUGUGGUCACUGCUCAAAUUGCCCAUCCUGAUGGUAUUGCUGUGGACUGGGUUGCACGAAAUCUUUAUUGGACAGACACUGGCACUGAUCGAAUAGAAGUGACAAGGCUCAAUGGGACCAUGAGGAAGAUCUUGAUUUCAGAGGACUUAGAGGAACCCCGGGCUAUUGUGUUAGAUCCCAUGGUUGGGUACAUGUAUUGGACUGACUGGGGAGAAAUUCCGAAAAUUGAGCGAGCAGCUCUGGAUGGUUCUGACCGUGUAGUAUUGGUUAACACUUCUCUUGGUUGGCCAAAUGGUUUAGCCUUGGAUUAUGAUGAAGGCAAAAUAUACUGGGGAGAUGCCAAAACAGACAAGAUUGAGGUUAUGAAUACUGAUGGCACUGGGAGACGAGUACUAGUGGAAGACAAAAUUCCUCACAUAUUUGGAUUUACUUUGUUGGGUGACUAUGUUUACUGGACUGACUGGCAGAGGCGUAGCAUUGAAAGAGUUCAUAAACGAAGUGCAGAGAGGGAAGUGAUCAUAGAUCAGCUGCCUGACCUCAUGGGCCUAAAGGCUACAAAUGUUCAUCGAGUGAUUGGUUCCAACCCCUGUGCUGAGGAAAACGGGGGAUGUAGCCAUCUCUGCCUCUAUAGACCUCAGGGCCUUCGCUGUGCUUGCCCUAUUGGCUUUGAACUCAUCAGUGACAUGAAGACCUGCAUUGUCCCAGAGGCUUUCCUUUUGUUUUCACGGAGAGCAGAUAUCAGACGAAUUUCUCUGGAAACAAACAAUAAUAAUGUGGCUAUUCCACUCACUGGUGUCAAAGAAGCUUCUGCUUUGGAUUUUGAUGUGACAGACAACCGAAUUUAUUGGACUGAUAUAUCACUCAAGACCAUCAGCAGAGCCUUUAUGAAUGGCAGUGCACUGGAACAUGUGGUAGAAUUCGGCUUAGAUUAUCCAGAAGGCAUGGCAGUAGACUGGCUUGGGAAGAACUUGUACUGGGCAGACACAGGAACGAAUCGAAUUGAGGUGUCAAAGUUGGAUGGGCAGCACCGACAAGUUUUGGUGUGGAAAGACCUAGAUAGUCCCAGAGCUCUCGCGUUGGACCCUGCCGAAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-651.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -693.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 496.58
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.((((((((.....)).)))))).))).).))(..(((((.(..(((((((.(((((.......)))))...)))))))..((((((((..((.(((.(((....(.(((((((((((((...(((((((......((((.......)))).....)))))))))))))..(((((..((((((..(((........)))....)))))).))))).........((((((.(((((((.(.(.((.((((((.((((.......((.(((..(((((..(((.....(((.(.((((((..(((((...(((((((.((((....)))).))))))).(((((.((((((......)))..))).))))))))))..)))))).).)))))).)).)))..))))).(((((((((...............(((.(((((((((((((((((((((.((((((........((((((...))))))....)))))).)))).)))))))((((((........)))))).(.((((((.(...(((...(((((((((...........)))))))))......((((((..((((...((((...))))))))..))...)))).....((((.((.((.(((...))).)).)).))))(((((......))))).....(((((...))))).....)))..).)))))).)...)))))))))).))))))))))))((((......)))).)))))))))))).)).))))).(((.(((((......))))).)))..)).))))))(((((((....((((((((.....((((((((((.((((((((((((.((((.(((((...))))).......(((.(((((((......(((.((((.((((((((.((((....(((((((((.((........)).)))))).))).)))).)))...)))))..)))).)))...))))))).))).............((((((((((((((((..((((((.(((.(((((.(....).))))).))).)).))))..((((((((((.(((((((((((((....)))))))(((.(((((((((((((((((((...((((.......((((.(((((....(..(((.((..(((((........((((((.(((((.........))).)).)))))).)))))..)).)))..)..))))).))))((((((.(((....(((((......(((((((((((((.(((((((((.(((((((........))))....))))))))(.((((....)))).).......))))..))).))))..))))))..((((.(((((((.((.(((.(((.(((((..((......((((.(..((((((..(((..((....))..)))..))))))..).))))...))..)))))..)))))))).)))))))))))((((((..........))))))...........)))))....))).))))))..))))...))))))))).......)))))))))).))).)))))).........(((.(((((...((.(.(((((((((.(..(((((...)))))..).)))..((....))(((....))).........((((...)))).(((((.((.(((((((..........))))))).)).))))).)))))))))))).)).)))..))))))))))......(((.....)))(((((...(((((((((...(((...(((((((((.(((((((..((((((((((((((...)))))))))....))..)))..)))))))............)))))))))...)))...))))))))))))))((((.(((((((.(((.((((((.(((((((....((((.....)))).))).....)))))))))))))..))))))).))))....))))))))...(((((..((.((((........)).)).))..)))))..)))))))))))).)))))..)))))))..)))).)))))))))))))))))))))(((.......)))..))))))).)...))).)))))..))))))))(((.(....).)))......((((.((.((....)).)))))).).)))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.((((((((.....))}}})))).))).)}})(..(((((.{..(((((((.(((((.......)))))...)))))))..((((((((..((.(((.(((.{{.(.((((((({((((({..{(((((({{{,,.({,,.,,.,}})))}.....}))))))))))),..(((((..((((((..(((........)))....)))))).))))).........((((((.(((((((.(.(.((.((((({{((((.......((.(((..(((,,..(((,.{,..{{,,.((((((..(((((...{((((((.((((....)))).))))))}.(((((.((((((......)))..))).))))))))))..)))))).},)})))).,,.)))..))))).(((((((((...............(((.{((((((((((((((((((((.((((((........((((((...))))))....)))))).))))}}}))))){(((((........)))))|{(.((((((.(...{{{...{((((((((...........))))))))}......((((((..((((...((((...))))))))..)),..}))).....((((.((.((.{({...})}.)).)).))))(((((......))))).....(((((...))))).....}))..).)))))).)},.)))))))))}.))))))))))))((((......)))).)))))))))))).)).))))).{{,.(((((......))))).,}}..)).))))))(((((((....((((((((.....((((((((((.((((((((((((.(((({(((((...)))),}},..,.(((.((((({{......(((.(((,.((((((((.((({....(((((((((.((........)).)))))).))).)))).)))...)))))..)))}.)))...}}))))).)))...,..({{....})).{(((({{(((,,.,{{,,,,.{{{.(((((,({{,,|,||}}|.|||{||{|||,..((((((((((.((((((,((((((....))))))|(((.(((((((((((((((((((...((({..((((((((..(((((...})}}}))).))))},{{,,......((((((.(((((.........))).)).)))))).))},},.{{{{{...}}}.)),{((((((..,,({{.({(({.,((({({...{,..,(((((((((((,.(((((.(((((((..,,....))}}....)))))))){.((((....)))).,.....((((.....)))),|.{{(({,,..})))}.|{(((((.({{(((.(((.(((((.,((.,,...{{((.{.,(((({(..{{{..{{,,,,)}..))}..))))}}..,.})))...))..)))))..)))))))).)))))))))))).)))))...}}))}.))..))}}}..},,..))))))}......}),.,,,..})))...))))))))).......}))))))))).)))})))))).........(((,({{{{...{,{(.(((((((((,,,,(((((...))))).,).))}..{{.,.,||(((....)))}.,....,.|||{...},}}.(((((.((.(((((((..........))))))).)).)))))})))))))))},}.)).)))..)))))))))){{{{,,(((.....}}|{{{{,..,|||||||((,,,(,,...{{{||{{||,((((((({{((((.,,((,,,,|,.})))))),|,..,,.,..}},.,}))))))............,,,)))))),,.)))}},}|||||}|||||,||{,({{((((((.(((.((((((.((((,{,.,,.((((.....)))).,)).....)))))))))))))..)))))))},)}}.}},,})}))))),.(((((..{(.((((.,....,.))},}.))..)))))..)))))))))))).)))))..)))))))..)))).))))))))))))))))))))){{{....,,,},,..))))))).).},))).)))))..))))))))(((.(....}.)))......(({({((.((....)).)))))).}.)))))..)
Back