Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP6_0010100

Sequence Length

1830 nt

GC Content

0.4530

GUUCAUGUACUGGACAGACUGGGGAGAAGUGCCAAAGAUAGAACGUGCUGGAAUGGAUGGUUCAAGUCGCUUCAUUAUAAUAAACAGUGAAAUUUACUGGCCAAAUGGACUGACUUUGGAUUAUGAAGAACAAAAGCUUUAUUGGGCAGAUGCAAAACUUAAUUUCAUCCACAAAUCAAAUCUGGAUGGAACAAAUCGGCAGGCAGUGGUUAAAGGUUCCCUUCCACAUCCUUUUGCCUUGACGUUAUUUGAGGACAUAUUGUACUGGACUGACUGGAGCACACACUCCAUUUUGGCUUGCAACAAGUAUACUGGUGAGGGUCUGCGUGAAAUCCAUUCUGACAUCUUCUCUCCCAUGGAUAUACAUGCCUUCAGCCAACAGAGGCAGCCAAAUGCCACAAAUCCAUGUGGAAUUGACAAUGGGGGUUGUUCCCAUUUGUGUUUGAUGUCUCCAGUCAAGCCUUUUUAUCAGUGUGCUUGCCCCACUGGGGUCAAACUCCUGGAGAAUGGAAAAACCUGCAAAGAUGGUGCCACAGAAUUAUUGCUUUUAGCUCGAAGGACAGACUUGAGACGCAUUUCUUUGGAUACACCAGAUUUUACAGACAUUGUUCUGCAGUUAGAAGACAUCCGUCAUGCCAUUGCCAUAGAUUACGAUCCUGUGGAAGGCUACAUCUACUGGACUGAUGAUGAAGUGAGGGCCAUACGCCGUUCAUUUAUAGAUGGAUCUGGCAGUCAGUUUGUGGUCACUGCUCAAAUUGCCCAUCCUGAUGGUAUUGCUGUGGACUGGGUUGCACGAAAUCUUUAUUGGACAGACACUGGCACUGAUCGAAUAGAAGUGACAAGGCUCAAUGGGACCAUGAGGAAGAUCUUGAUUUCAGAGGACUUAGAGGAACCCCGGGCUAUUGUGUUAGAUCCCAUGGUUGGGUACAUGUAUUGGACUGACUGGGGAGAAAUUCCGAAAAUUGAGCGAGCAGCUCUGGAUGGUUCUGACCGUGUAGUAUUGGUUAACACUUCUCUUGGUUGGCCAAAUGGUUUAGCCUUGGAUUAUGAUGAAGGCAAAAUAUACUGGGGAGAUGCCAAAACAGACAAGAUUGAGGUUAUGAAUACUGAUGGCACUGGGAGACGAGUACUAGUGGAAGACAAAAUUCCUCACAUAUUUGGAUUUACUUUGUUGGGUGACUAUGUUUACUGGACUGACUGGCAGAGGCGUAGCAUUGAAAGAGUUCAUAAACGAAGUGCAGAGAGGGAAGUGAUCAUAGAUCAGCUGCCUGACCUCAUGGGCCUAAAGGCUACAAAUGUUCAUCGAGUGAUUGGUUCCAACCCCUGUGCUGAGGAAAACGGGGGAUGUAGCCAUCUCUGCCUCUAUAGACCUCAGGGCCUUCGCUGUGCUUGCCCUAUUGGCUUUGAACUCAUCAGUGACAUGAAGACCUGCAUUGUCCCAGAGGCUUUCCUUUUGUUUUCACGGAGAGCAGAUAUCAGACGAAUUUCUCUGGAAACAAACAAUAAUAAUGUGGCUAUUCCACUCACUGGUGUCAAAGAAGCUUCUGCUUUGGAUUUUGAUGUGACAGACAACCGAAUUUAUUGGACUGAUAUAUCACUCAAGACCAUCAGCAGAGCCUUUAUGAAUGGCAGUGCACUGGAACAUGUGGUAGAAUUCGGCUUAGAUUAUCCAGAAGGCAUGGCAGUAGACUGGCUUGGGAAGAACUUGUACUGGGCAGACACAGGAACGAAUCGAAUUGAGGUGUCAAAGUUGGAUGGGCAGCACCGACAAGUUUUGGUGUGGAAAGACCUAGAUAGUCCCAGAGCUCUCGCGUUGGACCCUGCCGAAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-532.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -569.17

Frequency: 0.0000

Diversity: 626.34

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((...(((....((((((....((((((..((.((((.(((.(((((((((((((((((((((.((((((........((((((...))))))....)))))).)))).)))))))((((((........)))))).(.((((((.(...(((...(((((((((...........)))))))))......((((((..((((...((((...))))))))..))...)))).....((((.((.((.(((...))).)).)).))))(((((......))))).....(((((...))))).....)))..).)))))).)...)))))))))).))).)))).))...))).)))...(((((....(((((...((((.((.(((.(((((......))))).)))..((((..((.(((((((....((((((((.....((((((((((.((((((((((((.((((.(((((...))))).......(((.(((((((......(((.((((.((((((((.((((....(((((((((.((........)).)))))).))).)))).)))...)))))..)))).)))...))))))).))).............((((((((((((((((..((((((.(((.(((((.(....).))))).))).)).))))..((((((((((.(((((((((((((....)))))))(((.(((((((((((((((((((...((((.......((((.(((((....(..(((.((..(((((........((((((.(((((.........))).)).)))))).)))))..)).)))..)..))))).))))((((((.(((....(((((......(((((((((((((.(((((((((.(((((((........))))....))))))))(.((((....)))).).......))))..))).))))..))))))..((((.(((((((.((.(((.(((.(((((..((......((((.(..((((((..(((..((....))..)))..))))))..).))))...))..)))))..)))))))).)))))))))))((((((..........))))))...........)))))....))).))))))..))))...))))))))).......)))))))))).))).)))))).........(((.(((((...((.(.(((((((((.(..(((((...)))))..).)))..((....))(((....))).........((((...)))).(((((.((.(((((((..........))))))).)).))))).)))))))))))).)).)))..))))))))))......(((.....)))(((((...(((((((((...(((...(((((((((.(((((((..((((((((((((((...)))))))))....))..)))..)))))))............)))))))))...)))...))))))))))))))((((.(((((((.(((.((((((.(((((((....((((.....)))).))).....)))))))))))))..))))))).))))....))))))))...(((((..((.((((........)).)).))..)))))..)))))))))))).)))))..)))))))..)))).))))))))))))))))))))).))..)))).))))))...)))))..)))))(((((((......)))))))((.....)).......))))))...))).))).)))))(((.....)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((.{{((((...((((((({.(((((((.{(({.{,,(,(((((({.{(,(((((((...((((((((((((......{((((.,{{{||,||((..{((((..{({{..,({{{.{(({((........})))}}.,,(((({.{{,........(((((((((...........)))))))))......((((((..((((...((((...))))))))..)),..}))){{,.{{{{.,{{,(({{(((((((,...((..(((((((((,(((,{,.,{{,{{(((({{((..{..((....((((((((({.,{,(({..((((((...({.......}}....)))))).}.))}))))))}.)))}}.,..))))))))}}}(((((......))))).....(((({{((({....)))),,)}))},.}}.))}))))))))).,))....,,.))))))),{{(((((...)))),}},..}}|},}}||}}),.,....(((.(((,.((((((((.((({....(((((((((.((........)).)))))).))).)))).)))...)))))..))),.)))...}))))))}),|,,....|||}}}})))}.,))))})))}}})}}}.,,.{((.(((((.(....).))))).))),}}})))))))))))}})))}}.|,{{{(({{{,....))))),}}))))||}},|}}},)}),)))}.)))....{((((((((..{{{{(.,,|||||||},|||||,{{,{|...||{{{{{{,,,{{{.,,.,|,||}}}.|}.,,}}},,|{|,{,{((({(..{(((.{({{(({{{{,.{{{{{.,,|||{|({,||{,,,{{..,(((((((((({,,(((((.(((((((..,.....))}}....)))))))){.((((....}))).,.....((((.....)))){{,{{(({,,,.}))}}.|{(((((.({{(((.(((.(((((.,((,,,...{{((.{.,(((({(..{{{..{{,,,,)}..))}..))))}}..,.})))...))..)))))..)))))))).)))))))))))).))}}}...{{|||,,,.|}|{{{.......)))),}...,}}}})..,.,((((({{{.{(((,((((((((.(((..|.....,.))))))))))))})},|,,}}}}||,,.,,}}}}|}|((({((((,{.,(((((...))))).,).)))..||}},,||(((....)))}.,....},||||,.,},}}.(((((.((.(((((((..........))))))).)).)))))})))))))))},.}),|}))|})}})}}}||||||,,,{{||..,,|||{({|.,,.(((((((((...({{...(((((((({,((((((({{((((.,{(({{{{|,.|)))))),|,..,,....}},,,)))))))..,,,.......,}}))))))...))),,.})))))))){{{.,||||||((((((.(((.((((((.((((,{,.,,.((((.....)))).,)).....)))))))))))))..))))))|||}}}.},,.,),)}}||,.(((((..{{.{(({.|....}.)),.}.}}..)))))..,||}}|}}}}},.,)}}||||||,,,}..}}},,,))))))}},}}))),..}},..,...}))}}))})),..},,)))))))))|((((((......))))))}.......))}}}...})))))).,,},}.))},}))))(((.....)))