Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP6_0010300
Sequence Length
1405 nt
GC Content
0.4534
GCAGGCAGUGGUUAAAGGUUCCCUUCCACAUCCUUUUGCCUUGACGUUAUUUGAGGACAUAUUGUACUGGACUGACUGGAGCACACACUCCAUUUUGGCUUGCAACAAGUAUACUGGUGAGGGUCUGCGUGAAAUCCAUUCUGACAUCUUCUCUCCCAUGGAUAUACAUGCCUUCAGCCAACAGAGGCAGCCAAAUGCCACAAAUCCAUGUGGAAUUGACAAUGGGGGUUGUUCCCAUUUGUGUUUGAUGUCUCCAGUCAAGCCUUUUUAUCAGUGUGCUUGCCCCACUGGGGUCAAACUCCUGGAGAAUGGAAAAACCUGCAAAGAUGGUGCCACAGAAUUAUUGCUUUUAGCUCGAAGGACAGACUUGAGACGCAUUUCUUUGGAUACACCAGAUUUUACAGACAUUGUUCUGCAGUUAGAAGACAUCCGUCAUGCCAUUGCCAUAGAUUACGAUCCUGUGGAAGGCUACAUCUACUGGACUGAUGAUGAAGUGAGGGCCAUACGCCGUUCAUUUAUAGAUGGAUCUGGCAGUCAGUUUGUGGUCACUGCUCAAAUUGCCCAUCCUGAUGGUAUUGCUGUGGACUGGGUUGCACGAAAUCUUUAUUGGACAGACACUGGCACUGAUCGAAUAGAAGUGACAAGGCUCAAUGGGACCAUGAGGAAGAUCUUGAUUUCAGAGGACUUAGAGGAACCCCGGGCUAUUGUGUUAGAUCCCAUGGUUGGGUACAUGUAUUGGACUGACUGGGGAGAAAUUCCGAAAAUUGAGCGAGCAGCUCUGGAUGGUUCUGACCGUGUAGUAUUGGUUAACACUUCUCUUGGUUGGCCAAAUGGUUUAGCCUUGGAUUAUGAUGAAGGCAAAAUAUACUGGGGAGAUGCCAAAACAGACAAGAUUGAGGUUAUGAAUACUGAUGGCACUGGGAGACGAGUACUAGUGGAAGACAAAAUUCCUCACAUAUUUGGAUUUACUUUGUUGGGUGACUAUGUUUACUGGACUGACUGGCAGAGGCGUAGCAUUGAAAGAGUUCAUAAACGAAGUGCAGAGAGGGAAGUGAUCAUAGAUCAGCUGCCUGACCUCAUGGGCCUAAAGGCUACAAAUGUUCAUCGAGUGAUUGGUUCCAACCCCUGUGCUGAGGAAAACGGGGGAUGUAGCCAUCUCUGCCUCUAUAGACCUCAGGGCCUUCGCUGUGCUUGCCCUAUUGGCUUUGAACUCAUCAGUGACAUGAAGACCUGCAUUGUCCCAGAGGCUUUCCUUUUGUUUUCACGGAGAGCAGAUAUCAGACGAAUUUCUCUGGAAACAAACAAUAAUAAUGUGGCUAUUCCACUCACUGGUGUCAAAGAAGCUUCUGCUUUGGAUUUUGAUGUGACAGACAACCGAAUUUAUUGGACUGAUAUAUCACUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-408.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -435.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 463.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..((((...((((...))))))))..))...)))(((((.((((.((.((.(((...))).)).)).))))(((((......)))))....(((..(((.(((((((((((((((((((..((((((.((((((...((.......))....)))))).).))))).....)))......((((......)))).(((.(((....))).)))((((..((((....))))..))))(((((((.......)))))))...))))))))))))))))((((...))))......(((........))).....(((.((((.((((((((.((((....(((((((((.((........)).)))))).))).)))).)))...)))))..)))).))).(((((((.(.((((.(((.(((....)))..(((.((.((((((.........)))))))))))....))))))).)..))))))).((((((((((.(((((((((((((....)))))))(((.(((((((((((((((((((...((((.......((((.(((((....(..(((.((..(((((........((((((.(((((.........))).)).)))))).)))))..)).)))..)..))))).))))((((((.(((....(((((......(((((((((((((.(((((((((.(((((((........))))....))))))))(.((((....)))).).......))))..))).))))..))))))..((((.(((((((.((.(((.(((.(((((..((......((((.(..((((((..(((..((....))..)))..))))))..).))))...))..)))))..)))))))).)))))))))))((((((..........))))))...........)))))....))).))))))..))))...))))))))).......)))))))))).))).)))))).........(((.(((((...((.(.(((((((((.(..(((((...)))))..).)))..((....))(((....))).........((((...)))).(((((.((.(((((((..........))))))).)).))))).)))))))))))).)).)))..)))))))))).)))..))).......((((((...(((((((((...(((...(((((((((.(((((((..((((((((((((((...)))))))))....))..)))..)))))))............)))))))))...)))...)))))))))))))))((((....)))).......(((((((.(((....((((.....)))).))).))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..((((...((((...))))))))..)),..}))(((((.(((({(({(((((({.{{({,..{{..{(({(((((.{{{,,|,,||.,{{(((,,({..{,,((,,..((((((((({.,{,(((..((((({...({.......}},,..}))))),}.)}}))}}}}|,}}}}}.|.,))}}}}}}}},(((((......))))).....((((,,((({....)))),,))))},.}}.}}|}}}}})))).,)|....,,.,,||||||||{{(((,.((((((({..,,,({{.{{{{{||,.....(((.(((,.((((((((.((({..,.(((((((((,((...,....}},)))))}.))).}))).)))...)))))..))),.)))...}}))))).))),,,},|{{.,((((((..(((.{{.((((((,,....,,.))))))}})))..((((.........)}})|||((((((((((.....))).}))))))...)))))))||({((((,,(((((((((((((.{{(.....((((((((..{((((...}))}}))).))))){{{{{....,,((((((.(((((.........))).)).)))))).}},,|,.(({((...||}.}}.{((({{(..,,({{.{{{{{.,{{{{{{...|,..,(((((((({({,,((({{.((({{((,.,,,...))}},,..))})))))|,{{{{....}))).,.....((((.....)))){{.(((({....})))).}|(((((,({{(((.({{.{((((.|{{,||,..{|||.,.,(((({{..,,{..|{,,}})}..)))..))})))..}.}))}...)),.)))))..}})))})}.)))))})))))),}}}|}...}}}}}.)).,))}}}..,,,..)))))),....,,|},,,..{{{{{,{{.{(((.((((((((.(((..|.....}.))))))))))))))}.},}}}}}||,.....}|||}|||{,{{||}.}}|||||}}}))),,}))})))}}}}}}},}|||{...,)))}}}},}})}}}.}}}}))))}(((((.((.(((((((..........))))))).)).))))).,||||,,,...}})}{|,,{||||},,}||,,,)}..)}|},...))|(((((...(((((((((...(((...(((((((((.((((((({{((((,,,((,,,,|,.}))))))}||..,,....))}.,}))))))............)))))))))...)))...))))))))))))))}((((....)))),......(((((((.(((....((((.....)))).))).))))))).)))))
Back