Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP6_0010600
Sequence Length
786 nt
GC Content
0.4478
GUGCCACAGAAUUAUUGCUUUUAGCUCGAAGGACAGACUUGAGACGCAUUUCUUUGGAUACACCAGAUUUUACAGACAUUGUUCUGCAGUUAGAAGACAUCCGUCAUGCCAUUGCCAUAGAUUACGAUCCUGUGGAAGGCUACAUCUACUGGACUGAUGAUGAAGUGAGGGCCAUACGCCGUUCAUUUAUAGAUGGAUCUGGCAGUCAGUUUGUGGUCACUGCUCAAAUUGCCCAUCCUGAUGGUAUUGCUGUGGACUGGGUUGCACGAAAUCUUUAUUGGACAGACACUGGCACUGAUCGAAUAGAAGUGACAAGGCUCAAUGGGACCAUGAGGAAGAUCUUGAUUUCAGAGGACUUAGAGGAACCCCGGGCUAUUGUGUUAGAUCCCAUGGUUGGGUACAUGUAUUGGACUGACUGGGGAGAAAUUCCGAAAAUUGAGCGAGCAGCUCUGGAUGGUUCUGACCGUGUAGUAUUGGUUAACACUUCUCUUGGUUGGCCAAAUGGUUUAGCCUUGGAUUAUGAUGAAGGCAAAAUAUACUGGGGAGAUGCCAAAACAGACAAGAUUGAGGUUAUGAAUACUGAUGGCACUGGGAGACGAGUACUAGUGGAAGACAAAAUUCCUCACAUAUUUGGAUUUACUUUGUUGGGUGACUAUGUUUACUGGACUGACUGGCAGAGGCGUAGCAUUGAAAGAGUUCAUAAACGAAGUGCAGAGAGGGAAGUGAUCAUAGAUCAGCUGCCUGACCUCAUGGGCCUAAAGGCUACAAAUGUUCAUCGAGUGAUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-210.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -225.22
Frequency: 0.0000
Diversity: 225.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..............))(....((((((.(((((...(((.((((.((.(((((....((..((((....(((.....)))))))..))..))))).)).))))..(((.((.((((((.........)))))))))))..((((.........))))...((((((((((.....))).)))))))...((.((.((.((((((..(((((((((((((.(((.....((((((((..(((((...)))))))).)))))(((((......((((((.(((((.........))).)).))))))........(((((...))).)).(((((((....(((.(((((..((((((...(....(((((((((((..(((((.(((((((........))))....))))))))(.((((....)))).).....((((.....)))).(.(((((....))))).)((((((.((.(((.(((.(((((..((......((((.(..((((((..(((..((....))..)))..))))))..).))))...))..)))))..)))))))).)))))))))))).)))))...))))).))..)))))..)))..)))))))....((((.....(((((.((.((((.((((((((.(((..........))))))))))))))).))))))).......)))))))))....))).)))))))))))))..)))))).))))))...((((....)))).))).))))).))))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,,{.{,......,||({{{{(((({{.({{{{,..|||||{,|,|,.|||{{||...|.}(({{....,{{{,..,|}})))}..}},,}}}||,}|.||||..(((.{{.((((((,,....,,.))))))}})))..((((..,......)}})|||(((((({(((.....))).)))))))...||,||.((.((((((..(((((((((((((.(((.....((((((((..(((((...}))}}))).)))))(((((....,,((((((.(((((.........))).)).)))))).}},.,..(({({...}}).)).(((((((....({{.(((((..((((((...{...,(((((((((((,.(((((.(((((((..,,....))}}....)))))))){.((((....)))).,.....((((.....)))),{.(((({....})))).|{(((((.({{(((.(((.(((((.,((.,,...{{((.{.,(((({(..{{{..{{,,,,)}..))}..))))}}..,.})))...))..)))))..)))))))).)))))))))))).)))))...})))).))..)))))..}},..))))))}....,,||,,,..(((((.{(.((((.((((((((.(((..,.....,.))))))))))))))).)}))))),|,....,}},)))))....))).)))))))))))))..)))))).)}))}}.,}|(((....)))}.,,..))))),)}}}))..,})
Back