Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP6_0011700
Sequence Length
701 nt
GC Content
0.4536
CCACAAAUCCAUGUGGAAUUGACAAUGGGGGUUGUUCCCAUUUGUGUUUGAUGUCUCCAGUCAAGCCUUUUUAUCAGUGUGCUUGCCCCACUGGGGUCAAACUCCUGGAGAAUGGAAAAACCUGCAAAGAUGGUGCCACAGAAUUAUUGCUUUUAGCUCGAAGGACAGACUUGAGACGCAUUUCUUUGGAUACACCAGAUUUUACAGACAUUGUUCUGCAGUUAGAAGACAUCCGUCAUGCCAUUGCCAUAGAUUACGAUCCUGUGGAAGGCUACAUCUACUGGACUGAUGAUGAAGUGAGGGCCAUACGCCGUUCAUUUAUAGAUGGAUCUGGCAGUCAGUUUGUGGUCACUGCUCAAAUUGCCCAUCCUGAUGGUAUUGCUGUGGACUGGGUUGCACGAAAUCUUUAUUGGACAGACACUGGCACUGAUCGAAUAGAAGUGACAAGGCUCAAUGGGACCAUGAGGAAGAUCUUGAUUUCAGAGGACUUAGAGGAACCCCGGGCUAUUGUGUUAGAUCCCAUGGUUGGGUACAUGUAUUGGACUGACUGGGGAGAAAUUCCGAAAAUUGAGCGAGCAGCUCUGGAUGGUUCUGACCGUGUAGUAUUGGUUAACACUUCUCUUGGUUGGCCAAAUGGUUUAGCCUUGGAUUAUGAUGAAGGCAAAAUAUACUGGGGAGAUGCCAAAACAGACAAGAUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-190.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -205.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 234.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((......))))).....((((..((((....))))..))))(((((((.((((((((....((.((((.((((.(.(.(((((((...)))).))).).))))))))).))......(((.((((.((((((((.((((....(((((((((.((........)).)))))).))).)))).)))...)))))..)))).)))........((((((((((((..((((((((((((((((((((.(((((.((.(((.(((((.(....).))))).))).((((.(((((.(((..((((....(((((........)))))...))))..))).))))).))))...........((((((((..(((((...)))))))).)))))....)).)))))....))).)))....))))).))))............(((((((((...(((.((.((((.....((((........))))))))..))..))).))))).))))(((((.(((((((........))))....))))))))(.((((....)))).).....((((.....)))).))))).)))))))..)))))..(((((((((.(.......))))))))))...((((.(((((...........))))).))))..)))))))).)).......))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((......}}})),.,,.((((,{((({....)))),,)))){{{{{.(.((((((((((..((....{{{..(((((((({.,(({.(((((((.((({((........))}.....{((,({{{.((((((((,(((,..,,((((((((({({..,{,,,,|,,}}||||.}}}.,})|,|||...}}))),,})),.}))...,}}}))},|}}|}}|||{,,,((((((..(((.{{.((((((,,.....|,})))))|,)))..{({{,,,..,,.,|||}|||(({(((,(((.....))).|})))}}...)))))}},}}))||}}|.)))))})}))}}||,,.....((((((((..{{(({...})))}))).)))))}}},.}...,,{{{{{{.{{(((.....,.,,})).)).}}}})),}},(((((((((...(((.((.({((.....((({,....,,}),,,)))}..))..))).))))).))))))).)))))))))).})))))))))})..))..)))))))))).}..,|||{......((((.....))))}}}}|((({{{.,|{||{||...(((((((((.(.......}))))))))}.,,{({{.(((((.,.......}.))))).,,}),,})})),,)}}.))))...)}})),.....,,.
Back