Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP6_0013600
Sequence Length
1888 nt
GC Content
0.3840
GAUACGGCCUUGGUAAUAAGACAGAUACAAGAGGUCUCACGAGCAGGUGAGUGCAGACCAUUAUUAAAUAUUUGAGUGCUGACUGUGUACUUGGCAUUAUGCUAGAUUGUUUUAGGAUAGGGGAUACAACAAAAAAUAAAACAAAGUCCUUGUUUUCAAGGACCUGGAAUCUAGAGUGGUGAAAACAUAUGAGUAAACAGUCCUAAUACUGUAUUUGAAAUGUACAGAGAUGUAGUUUGUACCUGGAGCAUAGUAUCAGAAUAACGUGCAGGAGCACAGAGGAGAGUAUGCUUGAAGGGGGCAUUCCUGACAGUUAAUAUUUCAUUUUUAUUAAACUUAGAGGCGCUCAAAAUGCAUCACCUUUGAUUCUUUGGAAAGAGGAAUGACGUAUAACAGCAAUUUUGAAAAAUUACUAGAGUUAGCAUUUUCUUUGAUGAUAGUUGGGAAUUAAAUUGAUGUAAUCUGUUACCCGCUUUCAGGUUAUAAUCUUUAUCUUCUAGUAGUGGUUUACCAAUGUUAUUUCUGAAUUAAAUAUAUUCUUUGCAUUAUGUCCACUAACUUUUUAAAAGUAAUCGACUAGACUGGGUGCUUAAGGCUGUUCAUGAGGUUCUUAUUUUCUCCAGGGCAACCAGUUUAUACAUUCAGAAUUUCAUGAUGAUGCAUACUGUCACAAGCAAGUAAUUAGGUAGAAUUAUUAUCCCUAUUGAGGGACAGGUAAAAACAUGGGAUGACAAAGCCAUCCCUACUCUGGAUACGGAAGGAAAAACAGUGAGGUUAGGAUGCUUCAGUUCGUCCGUAUUUGAACUCAUCAUCUUACCGUCCCAAACCAUGUCUAUCUAAUUCCAUUCCAGACUCUCUUUUUUUGAGACGGAGUGUUGCUCUGUCACCCAGACUGGAGUGCAGUGGCACGAUCUCGGCUCAUUGCAACCUCCACCUCCCAGGUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGUGAUUACAGGUGCCCACCACCACGCCUAACUAAUUUUUGUAUUUUUAGUCAAGUUGGGGUUUGGGGUUUCACCAUGUUGGCCGGGCUGGUCUCAAACUGCUGACAUCAUUAGCCGCCCAUCUUGGCCUCCCAAAGUGCCGGGAUUACAGGUGUGAACCACUGCACCCAGCCCAGACUCUUUUAUCUGGUUACUGUAUAUUCUCUGUAAAAACAACCACAGAAACCAACCUGCUAACAUGAAUGCUUUCACUAUCCUCUUUUAUUAAUUUCUACUUGUUUUUAAAAUAUGAUACCAACACAUGAUCAAGUAGAGGGGAAGUGCAGAAGUAGGUCCGAUUUCUUCACAAUUCUUUUUUUCUUUUCACUUCUAUUAGGAAGCAGAAAUCCGUAAAUUCUUCAAACUCCUCUUCACUUAAAGCCUAAUCUACUAACCGGAGUAAGAGAGGAACAUGGGGUCAGGAAUCAAGUUCAGGGGUUAGUAACAGGAAGGGUGUGAAUUUUACACAACACUUUUCUUUUUCACAUUAAAAUCAGAACUAUUUUCACUGGCUGCAUUUUCAAUUUGAUAAUGAUGUAUGUGAUUUUUGAAGUUUCCCCCAAAAUAAAUUUGAUGGCAACAAAAUGUUUUUGAGGACCUGUGGCUUUUUAUAGGUCCUUUCAGAGUUACUUACAUGUGUCACAUUAAUGUUCUUAGAAUUAGCAUGGCUCAACACUUCUGGAUUGACUUAGUUUCAUAUGCAACUCGUAAUUGUGAUUUAUUUUGCCCUGUUACUGUAGACCAACUUCUUUGACUGUUAAUAUGCUUUUUACUUUAUUUACCUUUUCUAACCAACUUUCACUUAUUUUUACACUGAUUUUCCUGUUAUUCUAUUGACUGGUGGUCUGGAUACAGAAGGAAAAACAAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-463.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -500.15
Frequency: 0.0000
Diversity: 637.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((((.(((..........)))..))))))((((......))))((((((((((((.((((((((...((((..((((((.(((((..((((((.(((((((((((((......(........)......))))))...(((((((....)))))))....))))))).)))))).........))))).))))))....))))))))))))))))((((....))))))))))))((((.((...)).))))......((((....))))(((((((.(((....((((((((((((...((((((((((.........(((((......(((.((((.(((((((((..........(((((((.....)))))))...........)).))))))).(((((((..(((((.((((..................((((((((...(((((((((((...........)))))))).))).......(((((.((((.....(((.(((((.((((((....(((((.......((((.((((....(((((((....(((.((((((((((.((((((((((..(((.((((((((((((((...........((....)).............))))))))))))........)).)))..))))..(.(((((((((((.................(((((.(((((......((((((.......))))))...((.(((((((((..((.....(.((((((......)))))).))).)))))))))))..........))))))))))........))))))))))).)....((((.........)))).((((((((...)))))))))))))).))(((((((((((((.((....)))).)))))))..))))((((...))))....((((..((((.((((((((.......(((.((((....)))).)))...............(((((...........)))))...))))))))..))))..))))(((((((((.(((.((((........(((((.....))))).....((((((((((.....)).))))))))....(((((........)))))(((.(((((........)))))...))).......(((((..........))))).)))).))))))))))))..((((((((((.(((((...........((((((((.((......................)).)))))))))))))))))..))))))))).))))).)))......................(((((....)))))((((((((((((.(((..(((((.(((((((.((((....................))))..)))))))..(((.(((((((((...(((((.((..(((((((.(((((((((((............))))))))))).))...)))))..)).)))))...))).)))))).)))......)))))....))).)))).))))))))..(((.((..((((.....))))..)).)))...........(((((((((((......)))))))))))..)))))))...)))))))).......))))).)))))).)))))))).....)))).))))).....))))))))..)))))))))......)))))))....))))))).....))))).........))))))))))..)))))))...)))))..))))))))))..............))))((((...((.(((((((.....((((..((((...))))))))......))))))).)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{,.(({(((,(((....,.,,{.|}},,||||||((((..,...|}}}{{{(({{{{{{{,{{,,,,,..,{(((({.{,{{,,,||||{{{({,{{|,||{{{{{((((((,,,,,,(,,,.....}......||}}}},..(((((((....))))))).{{,,,,}|||,|}||||{,,,,,,..|||||,||||||,,.{{{{{{{,{{{.{...|(((({(......,))))))),|,|}|,}}}}}}},}}......((((....)))),{(((((,((.{((,{{(({((((({,.{{({{{((((((((.........}}}}},,,},,{|||.{|||,,,((((,{{,,,,{{,{((({{{.,|,|}})),,}||,|||.....||{{,,,,|,..{{{{{{{{((({(,((({,......|{|.,,.}|||{{{,,{{{,..(((((((((((...........))))))))},)),,},.,,|{{((.{(((,....{{||((({{.{{{{((...............,||{{|||||,,,|,.,|||,...,}}|||{{{||,,{{{(((((,(((,.{(((,{.((((((((((({,|,........{(,...)),},..,.......)))))))))))).,,,}},|{||||,....}},,},|{{{((({((({{{{{{.,{{{{...,}||||,.((({,......((((((.......))))))...{({(((,{{(((,{((...{{{,{(((({.,{{{{|,,},|{|||{,,,,,,,,)))}}}...}}}}))))),))}}......}})})})))}}))}|,,|||}}}.{{{{.......}}||{|||||,..)))}))}).,,}}},.{(((((((((((((.((....)))).)))))))..))))||||,..}))}.,,)))}))))))))||||{|||..}}},,||,,|||}}}}}})|((((.....|,||.,,|||.{{{,,.....,,....,}}}|.,|}))))}||,||||||,||,,(((((((({,(((.((((......,.(((((.....))))).,...((((((((((.....)).))))))))....((((({......,)))))(((.(((((........)))))...))).......(((((..........))))).)))).))))))))))))..{{{{{{(,,,.{{{{{,.........,((((((((.,,........,,............)}.)))))))))}|||||||.{((((,,{{...{{||,,,.......,,....,,.}}|||},|||||....)))))|})))}}}|,,,.,,,|,,|.,||{{{{{{{.{{{{...................,)))),,))))))|,.(((.(((((((((...(((((.((..((((({{.(((((((((((............))))))))))).}}...)))))..)).)))))...))).)))))).))).,,},,},||||,..,(((((.(((({{{{{((,(({.((..((((.....})))..)).}))........,,,{((((((((((,....,))))))))))))))))))))).)))))}))}}),},,}}}}}..}})))).)))))))).....)))}.))))}.,}}.,,}}},}},.}}))}}))}}}},,,}))),,,...,))))))}))...)})})),..,,))))})))))))..,}))})},,,,,,,,,}}}}}},,}}}},.,,},...,,..,))))|||,...{{.{{{||||,||,.{{{{..||||,,,))))})}),..,..}))})}}.)}.})))
Back