Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LTBP2_0002200
Sequence Length
882 nt
GC Content
0.6145
AUGUGGAUGAGUGUGCCAGCCGGGCCUCAUGCCCCACAGGCCUCUGCCUCAACACGGAGGGCUCCUUCGCCUGCUCUGCCUGUGAGAACGGGUACUGGGUGAAUGAAGACGGCACUGCCUGUGAAGACCUAGAUGAGUGUGCCUUCCCGGGAGUCUGCCCCUCCGGAGUCUGCACCAACACGGCUGGCUCCUUCUCCUGCAAGGACUGCGAUGGGGGCUACCGGCCCAGCCCCCUGGGUGACUCCUGUGAAGAUGUGGAUGAAUGUGAAGACCCCCAGAGCAGCUGCCUGGGAGGCGAGUGCAAGAACACUGUGGGCUCCUACCAGUGCCUCUGUCCCCAGGGCUUCCAGCUGGCCAAUGGCACCGUGUGUGAGGAUGUGAAUGAGUGCAUGGGGGAGGAGCACUGCGCACCCCACGGCGAGUGCCUCAACAGCCACGGGUCUUUCUUCUGUCUGUGCGCGCCUGGCUUCGUCAGCGCAGAGGGGGGCACCAGCUGCCAGGAUGUGGACGAGUGUGCCACCACAGACCCGUGUGUGGGAGGGCACUGUGUCAACACCGAGGGCUCCUUCAACUGUCUAUGUGAGACUGGCUUCCAGCCCUCCCCAGAGAGUGGAGAGUGUGUGGAUAUUGACGAGUGUGAGGACUAUGGAGACCCGGUGUGUGGCACCUGGAAGUGUGAAAACAGCCCUGGCUCCUACCGCUGUGUUCUGGGCUGCCAGCCUGGCUUCCACAUGGCCCCGAACGGAGACUGCAUUGACAUAGACGAGUGCGCCAACGACACCAUGUGUGGCAGCCACGGCUUCUGUGACAACACUGAUGGCUCCUUCCGCUGCCUCUGUGACCAGGGCUUCGAGAUCUCUCCCUCAGGCUGGGACUGUGUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-342.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -358.54
Frequency: 0.0000
Diversity: 346.20
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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