Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0000100
Sequence Length
777 nt
GC Content
0.5779
AUUGUGGGAGCCGCUCCCCUCGGCUCCGCCACGCUCCCCUCGACUGCGCUCCAGCCUGGGGCGCGCCCGGCCGCCGCCGCCUUCGCUGCCGCCACGGGCCCGUCUUCUUCCUCCUUCGGCUCCCAGGAUGAAGAAACUGAGUCUCAGAGAGGUGAAGUGACUUGCCCAAGAUCACAGCAAUUAUCACUUCUCCCUGGGCUCCCAGGCCCUCCUGCAGCAGCCCCCGCCUGGGCCAUGUCUUCCUCAGAUGAAGAGACGCUCAGUGAGCGGUCAUGUCGGAGUGAGCGGUCUUGUCGGAGUGAGCGAUCUUACAGGAGCGAGCGGUCGGGGAGCCUGUCUCCCUGUCCCCCAGGGGACACCUUGCCCUGGAACCUGCCACUGCAUGAGCAGAAAAAGCGGAAAAGCCAGGAUUCGGUGCUGGACCCUGCAGAGCGUGCUGUGGUCAGAGUCGCUGAUGAACGGGACCGGGUUCAGAAGAAAACGUUCACCAAGUGGGUCAACAAGCACUUAAUGAAGGUCCGCAAGCACAUCAAUGAUCUUUAUGAAGAUCUGCGGGAUGGCCAUAACCUGAUCUCUCUGUUGGAGGUCCUCUCAGGCAUCAAACUGCCCCGGGAGAAGGGCAGGAUGCGUUUUCAUAGGCUGCAGAAUGUGCAGAUUGCCCUGGACUUCCUAAAGCAGCGACAGGUGAAACUAGUGAAUAUUCGCAAUGAUGACAUCACAGAUGGCAACCCCAAGUUGACCCUGGGUCUGAUCUGGACCAUUAUUUUGCAUUUCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-292.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -305.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 186.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((.......))))))..))))(((((((..(((((((((((.....((.((.((((((((.((((((((.((((((((.((...(((((.((.((((((.((((..((...)))))).)))))))).(((((.(((...((.(((((((.((((...........))))...))))))).))))))))))...)))))....)).)))))..((((((((((..(.(((((.......))))).).))))))...)))).......)))))).)))))...))))).))).))..)).....)))))..)))))))))))))(((...(((.(((((.(((((....))))).(((((...((((..((((....)))).....)))).....)))))..((((((((.(((((.(((.....))).).))))..)).)))))).....))))).)))..)))..(((....)))(((....((((((((..((((((.(((((((((...............))))))))).)))...)))(((...(((((.(((((.((.((((...((((((((((((.((((......))))..))))..(((((((..((((..(((..........)))..))))..)))))))))))))))...)).)).))))))).......((((....))))..((((...))))...)))))...)))..))))))))..)))..)))(((((.((......))....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((.......))))))}.})))(((((((..(((((((((((.,..,(({(({((((((((.((((((({,((((({(({(({{{((((,.{{,((((((.((((..((...)))))).)))))).,.((({({{{(,{,((.(((((((.((((...........))))...))))))),)))))))))){{{|||,,..,,||.,}}}|...,||||||||...{(((((.,,....))}))})})))),))).)))).,,.).})))))).)))))...))))).))}.)),.})},,,.)))))..))))))))))))){((.,.(((,({{{{.|||||,,,,||,},.(((((...((((..((((....)))).....)))).....)))))..{({(({((,(((((.(((.....|}),},))}),,}}.}})))),...,))})).))),,)))..{{,....,}){((....((((((((..((((({.(((((((((...............))))))))).}))...)))(((...(((((.(((((.{{.(,(({{{((((((((((((.((((......))))..)))),.(((((((..((((..(((..........)))..))))..)))))))))))))))...))})).))))))).......((((....||}}..,|||....)))}..)))))...)))..))))))))..))}..)))(((((.,{......,}....)))))
Back