Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0000300

Sequence Length

650 nt

GC Content

0.5415

AUGAAGAAACUGAGUCUCAGAGAGGUGAAGUGACUUGCCCAAGAUCACAGCAAUUAUCACUUCUCCCUGGGCUCCCAGGCCCUCCUGCAGCAGCCCCCGCCUGGGCCAUGUCUUCCUCAGAUGAAGAGACGCUCAGUGAGCGGUCAUGUCGGAGUGAGCGGUCUUGUCGGAGUGAGCGAUCUUACAGGAGCGAGCGGUCGGGGAGCCUGUCUCCCUGUCCCCCAGGGGACACCUUGCCCUGGAACCUGCCACUGCAUGAGCAGAAAAAGCGGAAAAGCCAGGAUUCGGUGCUGGACCCUGCAGAGCGUGCUGUGGUCAGAGUCGCUGAUGAACGGGACCGGGUUCAGAAGAAAACGUUCACCAAGUGGGUCAACAAGCACUUAAUGAAGGUCCGCAAGCACAUCAAUGAUCUUUAUGAAGAUCUGCGGGAUGGCCAUAACCUGAUCUCUCUGUUGGAGGUCCUCUCAGGCAUCAAACUGCCCCGGGAGAAGGGCAGGAUGCGUUUUCAUAGGCUGCAGAAUGUGCAGAUUGCCCUGGACUUCCUAAAGCAGCGACAGGUGAAACUAGUGAAUAUUCGCAAUGAUGACAUCACAGAUGGCAACCCCAAGUUGACCCUGGGUCUGAUCUGGACCAUUAUUUUGCAUUUCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-226.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -236.92

Frequency: 0.0000

Diversity: 167.99

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((..(((..((((...))))((.((.(((((((.((((...........))))...))))))).))))((((((((.((((((((.(((...((((.(((.(((((..(.(((((.......))))).).)))))))).).)))..))).)))).(..((.((((((.(((........))).)))))).))..))))).))))))))(((.(((((.....))))))))(((....(((((...((((..((((....)))).....)))).....)))))....))).((((((((.((...))((.((((.(((((.....)))))..)))).)).))))))))..(((....))).(((...((((((((..((((((.(((((((((...............))))))))).)))...)))(((...(((((.(((((.((.((((...((((((((((((.((((......))))..))))..(((((((..((((..(((..........)))..))))..)))))))))))))))...)).)).))))))).......((((....))))..((((...))))...)))))...)))..))))))))))).))).))(((((.((......))....)))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((..,{,..((((,,,||}|{(.((.(((((((.((((...........))))...))))))).)))){(((((((.((((((((.(((...((({,(({{(((((..,.(((((.......))))).},))))))}).).)))..))).)))).(..((.((((((.(((........))).)))))).))..})))).)))))))},{|,{{{{(.,,..}}})))}}{{{....(((((...((((..((((....)))).....)))).....)))))..,,}}}|(({(((((.{{,..},{|,|{|{,|||{{,..,,)))))..}))),))})}}}}}}}..||,....})),((,...((((((((..((((({.(((((((((...............))))))))).}))...)))(((...(((((.(((((.{{.(,(({{{((((((((((((.((((......))))..)))),.(((((((..((((..(((..........)))..))))..)))))))))))))))...))})).))))))).......((((....||}}..,|||...,)))}..)))))...)))..)))))))),})}))).))(((((.{,......}}....)))))