Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0002000
Sequence Length
2955 nt
GC Content
0.4176
GUGAAGAAGGGUGGGGAGAGUUUUGUUUAUGUAUUGUAACACAGGAGAGACUUGAGCAUGUUUAUUUUAAGUGCUGUUUUGAAAGAGCCAGUAGAGAAGGAAGAUAUAAUACAAUUCAAAGACGGGGAGAAAAAUUGAUGGAGCAUGGGCUCUAGAGUCAAAAGUUGUGUCUUUUAGAAAGAUCAGAGGGUUAAAAAUAAGAAUGCAGGUGAUUAAGUUGGUUGGUUAGAGGUGUAGGAACUUGAGGGAAUUUCUCCUGAUGCUCAUACUCUCUCUAUGAAGUAGGAGGUGAAGUUAUUUGCUGAGAGUCAGGAGGAAGGAAAGAAGGGGUGAGUGUGUAUGUGUGUGUGUGUGUGUGCACGUGUGUGUGUGUAUGUGUGUGUGUUUUCCCUCUAGCCCUAGAAGCACUCAACAACCUGAUUGUAAUAGAUUCCAAGGCAGACAGGUAGAUUGAUCUAGGAUCAGAAUUUUCCAGCAUAGUUUUGACGGAAGAAUAUGGGGUCCUUGUAGUUUGUCUUAAAAUGUAGCAUCAGUUUGAUUAUUGAUUGUUUGUACUGUUGUUCUCUGGCUGGCUUGUAUUUUGGCUCCCCAGUGAAAUUGUCUACUCCUCUGGGAAGAAGCAUAUAUGUAACUUUUGCAUUCCUGCCUGUCAUUUAGCUAAAUACUAUGCAGAAAUUAAUUCUUAAGUUUUUGUUGAGAUAAUUUGACUUUUGGACAGGACAUCUUGACUCUUGACAUAGAGAGAGGCUUUCCUCACUUGUGGUCUUUAAUCCCCAUCUCAUUAUCUGACAUGGAUAGUGGAGGAUUCACUCACUCUCCAUGAGUGAACUCCAGGCCUAGCUUCUUCAUUAGUCUUAACAGGUUAGCUUUACUACUCUCCCCAGGGCAGUUGAGCUUUGCUUUCCAUGAAGGUUAUGUAGUUAAUUUGUACUAGGCUUGUGAAGACCUGGGUGUUUACAAGACUGGACAGAGAGGCUGUUGUGGAAAAUGCAGCCUCCUUCUUGUUUAUUUUGGCAGGCAGGCAAUGAAGGAGAUAGAUUUGUUCUCAUGACUCAGAGCCCUACCUGCUUUACCUUAACAGGUUCAAUAUAACCACCACCUUUCAGAUGUGAUAGUGUCCUUCAGAGUUUAUCUGACCUUUAUAUCUAAAAAGAGUAUUAGUUACCCUUUGCCCUCUACUUGCUUGGUUUUUUUUCACUUUUAUUCCAGUGUAGAGGAUAUUUCCUAAUGUGUUAGGGCCAGCUCAGAAUUGAUGUAGUUCUUUCCCAUUGGCACAUUCCGCAUCUUUGUUUGUUUAUUGCCAUGUUCGCCACAGUGUGCCUUGUUUUGCGCUCCUUGUUUUGUGAAGCUGGACUCUUAUCAGAUAAACUUGCCAUGAGUCACACUGGGGAGUGGAAGUAUGUCUCCACUAAUUUGGAGAAUCUUUGAUCUUGUUUCACUCCCUGGUUUGGCUUGUCCAGUGCAAUUUGUCUCUCAACCUGCAAGAGGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUACUUGGGUGUCCCUUGCCUGUGGCUUCACCUGUUGCCAUGAAUGGUUGACUUCAGGGCAUGCCCCUUUGUGUAUACAGACUUCCUCUACUAUUGUUAUCACCAUCAGCAAAAAUGUCUCUGUUAAGAGCCUCUUUGAAUGUAGAAUAUAGUAUAUAACACUGAGAGUUCAUAAACCCUCUGUCCUCUAGGGAUUUACAGUAUAUAAUACACAUUACAAAUGACAAAAGACAAUAAAGAAUGUGUAAGCGGUUGAACAAAUAAUGGAUUAUUGCUCCUCAUUUAGCUAUCAUAUUCACAGUAGAAGAUAUCCUAAAAAGACAUGUAGUCAGUGAGGAAGAGGAUUAACAGAGACCAGAUCAUCUUCAGCUCCAACUAAGAUGGCAGAGAGCUGCCACCUGUGGCCCUUUGAUGCCAGGUAAUUUCUCUCUGAUAUCCUUUCUAGUCAUGCAGGACCUUUUUGCCAUAUUAUCUAUACAUAUGGGGCAGGAUCCUAACAGGACCUUUGCUCUCUAGUGGUAACCUGUCACUGAAAUGGGAGGCUCCAGUUUCCAGCAGGGAGAGUGCCUGGAAGGCUUGGCUCUUCUGGUACAGUUAUCUUUGUAACUUGAGAAAAUUUAUUCCAGACCUACUACAAACAUUCGUGUGCUCACAAGCACCACAGACAGAGCAGCAGCCAAAGCUAGCUGCAGCCUGAGCAUGGGUCAGUGUAGGGAAAGAAGCUAACUGACCUGGCCUGAGUCACCUCUAGAGGGGAAGAAUGUAGGACUUGUCCCAGCCUUUGUUGGUUAGUUUCCCAAAUGGAAAACAGGGACCAGAGUAGGUGGGGUACUUUGAGGUCCUCAUACCUUUCAGAGGACUGGAUCCUUGUUUUCAUUCUUGUUCUUAUUGUUAAUAAGUGUAAUAACAGUAUUCAUGUAACACUGCCUUUAUUAGGAAGAAUGAGGAACUGCCAAAGGGCUGGAAAUUUUCUUUACUUUCCCUGUGGGAGAGAAAGAUAGAUGGAGCAUUAGGUGCCCAUCUCUCAGGCCUCCUUUCUCUGAUUAUCCUGUGGGAAGUACCUGGAAAGCAGUGAGGCAUUGGAAGGAAUGGUCUAGGCCUUGGCAUGAGUAUGUGGUCGUGAAGGCAUAAGACAAAAUAUCUUGUGUAGCUGUAGCACAGGUGCUGUGGUAAGAGGAAAUAGGUUUGGGGGCAGUAUUAAGGGGGCUAAUAAGCGCAGAAAAUAGUAUUUGUUGCUGUCGUUAGUUACUUCACUUUGCCUUGCCUAUAUGUAUUGUCUGACAGCAGAGCCGAAACUCCAGCAUCCUUUUGUCUCCUCCUCCUCCUCCUCUUUUUCUUAUUUUCUGACUUAUAAAGAUGUAUAUCUUCAAUAAAUAAGCUUGUGAUGAUAUGGAAAGUUAAAUAAAUAAAAGUUCUAGAAAUUGGAAAACUAAAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-876.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -932.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 732.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.((((((.(((((.....(((((((((.(.(((((.(((((((((.........))))))).)).)))))......((.........))..).))))))))).....)))))(((((((.(((..(((((((..(.((((((...((((....(((.((((((...)))))))))(((((..............((((((((..((.(((..(((((((((..((.((...(((((((((((((((((((.(((((((.(((.((((...))))))))))...........)))).))))))))))).......(((((((......(((((((............))))))).....((.(((((((((((.(((((((..((((..((.(((((.(((((((.(((((.((..((.(((..(((((((((((((......))))((((((....((((((..((......))..))))))......))))))....)))))))))..))).))))))))).)))....)))).))))).))..))))(((.((((..((((........))))..)))).)))...............))))))).))))))))))))).....))))))).((((((....((.(((((.((..(((((((((........)))))))))..))...))))).))....))))))...((((..((((......)))).)))).)))))))).)).)).))))))))).))).)).)))))))).((((((.((((.((......)))))).)))))).((((((((((((.......(((((((.(((((..(((((((((((.((..(((.((...(((((((.......)))))))....)).)))..)).)))))))))))...))))).))))))))))))).)))))).((((.(((.((.((((((((..........))))))))))))).)))).....((((((..(((..(((..((((.........)))).....)))..)))...))))))..))))).((((((((.((((.....((.(((((.(((.(((((........(((((.....))))).............((((.(((.....))).))))..(((((((..(((.((..................))))))))))))(((((....)))))....(((((((.((((........((((((((((((....((((((.((((((((((((..(((.....(((..(((((.((((.((((........))))...))))...)))))..))).........(((((((.(((((((((((((.((((((((((((((.....((((((......)))))).............)))))))))))))).))))))))...).)))))))))))...)))..)).))))))))).).))))))((.((((.((((.((((.((((.(((((((.(((((((((.((((((.((.(((..(((((..((((((((..((((((.(((((..((((((((.(((.....)))...................(((((((.((((((((((((((((((..((.(((((........)))))..))..))).))))......((((((((((...))))).............((((((((.....((........))......)))))))).(((((....((.....))....)))))((((((((..((((.(((..((....(((........)))....)).))))))).))))))))))))).)))))))))))....(((((((.((......)))))))))(((((((.....((((..(((........))))))).....)))))))............(((......))).))))))).........)))))))).)))))(((.((((...))))))).))))))..)))..)))))..))).)).))))))))))).)))......))))))(((((((((...))))...)))))(((((...((((.((((........)))).))))....)))))..........))))))).)))).)))).)))))))).))...((((((((....))).))))).((((((.(...).)))).)).))))))).))))).)))).)))))))..))))).))))))))))....)))).)))))))).(((((((((..((((.(((((........(((((((((((((((.....((((((..((...))..)))))).((((...)))).)))).)))))))))))...(((((((((.(((.(((..(((((.(((..........))).)))))....))).))).)))))))))))))))))))))))))))......(((((.(((((((...)))))))))))).((((((.((((...))))))))))(((((((((..(((((((.(((((.........((((((((....((((((((((.(((((........))))))))))..(((((........)))))...((((((((.......)))))))).)))))....))))))))))))).)))))))..)))))))))((((((((.....((((....(((.(((((....((((......((((....))))))))....))))))))))))....))))))))))))...)))))).)..)))))...))..))).)))))))...)))))))))))))))((((((..((((((.......(.((((((.(((.(((......)))))).)))))).)))))))...))))))...(((((.....))))).))(....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,(((((((((.((((((.((((({..,.(((((((((.,.(((((.(((((((({........,})))))).)).)))))......{{..,......))..}.)))))))))...}}))}}}(((((((,(((.,(,(((((..(.((((((...((((...,,{.,{({({{,,,||||||{{({((({.........,,.,{{,(((((((((.,{,.{{(({(((((((.{{{((((((((((({.{((((((((((.((({,,(,(((.((({...}}}))))|||,{,...,,,}})))).))))))))))},,,.,({{((((((,(({,{({({{,,,,{{,,.....,))))|,{{{,,.{,,(((((((((((.(((((((..((((..((.(((((.(((((((.(((({{((..((.(((..((((((((({{{(......})))((((((....((((((..((......))..)))))).,....))))))....)))))))))..))).))))))))).)))....)))).))))).))..))))(((.((((..((((........))))..)))).)))...............))))))).))))))))))),}...}}))),|,{{((((((....((.{((((.((..(((((((((........)))))))))..)).,.})))).))....)))))),}},,,,..{{{{.,,,..}|||.|||{....)))).}}}..|}})......}}||,|||(({{{(({,..,|})|}||||||({{{{{{{(({,,.....)))))))|,|||(,({{{{{..(((((((.(((((..(((((((((((.{{..(((.((...{((((((.......)))))))....)).)))..}}.)))))))))))...))))).))))))),)))))),),,,|{(((,{((({((,((((((((..,.......)))))))),,))},)))),,,,}|(((((.|(((..(((.,((((.,.......)))).....)))..))},}.)))))}..,|||...,)))}.,.}}}}}}})}))}}|||||{,,,,|||.,|.,}}}}}}|||}}},.})))))))))),,,))}}.,,,.,,.}))))))))}}||,|||||{{,,,{{{{((..,...............}}))})})}||({....}}}}...(((,,.(((((((.((((........((((((((((((....((((((.,(((((((((((,,({,....,(((..(((((.((((.((((........))))...})))...)))))..))).,.......|||||{{.((({,((((((((.((((((((((((((.....((((((......)))))).............)))))))))))))).))))))))...}.|||}}|||}}}..,)),.,)))})))))))).),))))}|((.((((.((((.((((.((((.(((((((,(((((((((.((((((.((.{({.,,,(((..(((({(((..((((((,(((((..((((((({.{{{.....,,,....,,{|,.........,||||,,..((((((((((((((((((..((.(((((........)))))..))..))).))))......((((((((((...))))).............((((((((.....({........}}......)))))))){(((((....((.....))....)))))|(((((((..((((.(((..({....(((........)))....)).))))))).)))))))}))))).)))))))))))....,((((((.((......))))))))}(((((((.....((({.{(((........))))))).....))))))).....,,...,||,...||||||..,)))))).........)))))))).))))){((.((((...))))))}.))))))..)))..}))))..)))..}.}}})))))))).)))......)))))){{{((((({,,,|}}}...))}))|{{({,,,((((.((((........)))}.}}}}....))))}..........))))))).)))).)))).)))))))).))}..((((((((....))).))))).((((((.(...}.)))).)}.)))))))}}}))).)))).))))))).,,.))),,}))}))))}}}}.{||||||}},,.,.((((((((,.{((({,((((({,,..,.,(((((((((((((((.....((((((.,((...,),,)))))).((({...}))).)))).)))))))))))|||{(({(((((,,({.,{,..(((((.,{,,{{.......))).)))))....,)).)))})))))))})))))))))))))))))))......(((((.(((((((...)))))))))))).((((((.((((...))))))))))(((((((((..(((((((.(((((((....)},((((((((....(((((.,.((({.(((.......((((,.(((({..(((((.,....,.)))))})))).|,})))......)))})))).)))))....))))))))})))).)))))))..)))))))))(((((,,,..{{{,((({({{.(({(((((....,,,,,}}},}})}...))))))},))}...,))))),,})))}}}}}}})},},))))...)))))).)..))))).,},,.,))).))))))),},)))))))))))))))|(((((..((((((.......(.((((((.(({,(((......)))))).)))))).)))))))...}}}}},...(((((,...,))))}.}}|....)
Back