Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0002600

Sequence Length

1483 nt

GC Content

0.4275

AUCACCUGAGAUCAGGAGUUCUAGACCAGCGGGACCAACAUGGAGAAACCCCGUCUGUACUAAAAAUACAAAAUUAGCUGGCGUGGUGGCCCAUGCCUGUAAUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCGCUUGAACCCGGGAGGCGGAGGUUGCGGUGAGCCGAGAUCGCACCAUUGCACUCUAGCCUGGGCAACAAGAGCGAAACUCCGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACCAGAAAAACAAACAAGUGUUAUAAUUGUAAUUCUUGUAAUUCCUUAAGCCAAAACUCCAUUAUAACAUUUCUUAGUUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUGUUACUUUUUGUGUGUAUUUGUUUGAACUUCCCAGCUGUAUUGUGAUCUCUUUGAAGGUCUAGAUUGUGUCUGAUGAGAUGCAUAUGAUGCACUUCAUGAAUUGAGCUACUUUGCAAAUGAUGCUGGUUGUUUUAUUUCUUAGUGUUUUCAGCAACUUCCAGCACCUUUCACAAUGUUUCUUUCCACGUGGUUGUCCCACAGAUGUUGCAUACUUGAUAUGUCCAAAAGGGGCAUUGUUGUCCCCCUCCCUGCUCCUGGACCUGCCUCUUCUUCUAUGUUCCCGAUUUUAGUGAAUGCUUUUCCCGUCCAUCCAGUGGAGAAAUUCUAAAUACUGAAUGCUUUGUGUAUACUAAAUAUAUAUUCUGUCCAUUUCAUAGUUUAAAGUGUUGCUAUCAGAUGGAGAAUUGUAAUGUGCAGAAUAUAAUAAAGCCUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGAGUUUUGCUCUUGUUGCCCAGGCUAAAGAAGUGCAAUGGCAUGAUCUCGGCUCACCGCAACCUCUGCCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUACUGCCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGAUUACAGACAUGCGGCACCACGCUUGGCUAAUUUUGUAUUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCUCCAUAUUGAUGAGGCUGGUCUUGAACUUCUGAUCUCAGGUGAUCCACCUGUCUUGGCCUCCGAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCACCUGGCCAAUAAAGCCUCUUUAUACCAUUUUCUAAUUUCUAUUUCAUAGAAUUUUAAAACUGCAUAAGCCUUUAACCUCUGUUUCUCAAAUUCACUUUCCCCUUUGGAAUGUUAUAAUUCUACUUCACCUGACUCCUGGAACUCCCUGUUAUCAUGUAACAUAUUUUAAUUAUUUUGAUUGUUGUCUGAGUCUUCCUACUACAAGAGUGAGACUGAGUCUCACUCUUGGCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCUGUCUCUGCUCACUGUAACCUCUGCAUUCUGGGUUCAAGAGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUAGGAUUACAGGUGUGCACCACCACACUUGGCUAAUUUGUGUAUUUUAGUAGACACAGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-638.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -665.86

Frequency: 0.0000

Diversity: 257.78

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((((((((((((.((((((((.....(((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((.((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.(.((.(((((((((((((((((((.((....((((........)))).....))...))))))))))))....))))))).)).).)))))).............((((((((((((..((.....(((..((((((((((........(((((((.((...((.((((((((.(((((...))))).))))).....((((.(((..(.((((((.((.....)).)))))))..))))))).)))))...)).)).)))))))))))))........))..)))...))..))))))...))))))...............((((((....)))))).(((((((....(((((..((...(((..(((............))).))).)).......)))))..))).))))..((((........))))(((((((((((.((..((((((((((..(((((((.(((((..........))))).)))))))))).))).))))..)).)))).))))))).........)))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))..)).))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))).)))).)))))))))).)))))))))))))).))))))))).))))))))))))))))).))).....)))))))).)))))))))))))))))))))(..(((((((((((((.....)).)))))))...)))).(((......))).(((((((((((.........................((((((...))))))..........((....))....((((.((((.(((..................((((((......))))))........(((((..((.....))((((((...))))))...............(((....))).))))).((((((((((((((((((((...)))))))))))((..((((((.((.((((.((.(..(((((((((((.((((.....))))...)))))...)))))).))))))))))))))).))..)))).)))))...((((((((......))))))))(((((..........)))))))).))))))))......)))))))))))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((((((((((((.((((((((...,.(((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((({,((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((.{((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((.(.({.(((((((((((((((((((.(,....((((........)))).....}}...))))))))))))....))))))).}).).)))))},,....,,.....({((((({{{((..(,,{..,{{({,,{{((({{((,{{...,{{{||||..||,{{{{{{{,,,,||}||||,...},))}})))),,,...|{({.,,..,|},,,.{.{(((((..(({..,.......,,}.....}}})))..)))))).}.,)}})))}),.......,,.{|||..,,,},))}}}||,,}}}}}}.,}..,}},,,,,..((((((....)))))).(((((((....(((((..{,...{{{..({{.{..........))).))).},.......)))))..))).))))..((((........))))(((((((((((.((..(((((((({{,.(((((((.(((((..........))))).)))))))})},,)),})))..)).)))),}))))))........,)))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))),.}),})))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))}.))))))))))))))))))))))))))))))))).)))).))))))))))},))))))))))))))))))))))).))))))))))))))))).))).,...)))))))).)))))))))))))))))))))(...,((((((((((...(((((((.(((((..(((((.(({.{{{,..,,...|||||,((((((...}}}}}}..,..{{{..{{.((((((...)))))).}}.|}},..|{....)}.,,,,}|.,}})).)))))....))))))).....((((((......))))))........{{{{{.,((,{,.{{,((({{(,,.||||||......,,.......|||}},,}},,))|||.((((((((((((((((((((...)))))))))))((..((((({{((.((((.((.,..(((((((((((.((((.....))))...)))))...)))))).})))))))))))))).}},,)))).)))))...((((((((......)))))))){{{{{..,,,,,,..}}})}}})})))))},,...,,..)},))))))))))