Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0004300
Sequence Length
580 nt
GC Content
0.4500
GCUGGUCUCGAACUUCUGGCCUCAAGUGAUCUGUGUGCCUCGGCCUCUCAAAGUGUUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCAUACCCAGUCUUUUUUUAUUUUUUUAAAGACAGGUUCUUGCUCUGUCGCACAGAGUGGAGUGCAGUGGCACAAUCAUAGCUCACUGUAACGUGUCUACCAGGCUCAACAGAUCCUCCCACCUCAGUUUCUCAAGUAUCUGAGACUACAGGCAUGUGCCAUUACACCUGGCUAAUUUUUAAAUUUUUUGUAAAGACGAAGUCUCAUUUUAUUGCCCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGGGCUCAAGCCAUCCUUCUGCCCUGGCCUCCCAAAGAGCUGGGAUUAUAGGCAUGAGCCACUGUGCCCCAAUUUAUUUAUUUUUUAUUUUUUUACCUUCAGAUGCUCUUUGGCAAGCAAGUAAGGAUUGCUCAAUUAAAAGUAUUGCAUUAUCUCAUUCAACUAUAUGAACAUACAAAACUUAAAAAAAUUUGUCUGAGGCCAGGCGUGGUGGGUCAUGCCUGUAUUCCCAGCACUUUGGGAAGCCGAGGCAGGUGGAUCACCUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-214.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -225.61
Frequency: 0.0000
Diversity: 103.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..........)))))((((.(((((((((.(((((((((.((((((((((((((((.(((((((((((.(((((((..((.((((((............)))))).)).(((.(((((((...))))))))))(((.(((((((((....(((..(((......))).)))..(((.((....)).)))....(((.((((((..........))))))..)))..))))))))).))).(((((....................((((...)))).........(((((((..(((.....))))))))))...))))).......(((.((((((((((((((((((((..(((((((....)))..)))).))))..............((......)).........)))))))))..(((((.......))))).......((((.(((.......((((........)))).....))).))))..............))))))))))))))))).))))))))))).)))))))))))))))).))))))))).))))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..........)))))((((.((((((({(.(((((((((.((((((((((((((((.(((((((((((.(((((((.,({.((((((............)))))).))|{{,,(((((((...)))))))))}|(({((((((,,.......}}.}}}})}}{{{{(({{...(((.((....)).))).....({,{(,.{(,,......,))))}....)))}})))||||,,.,,|.||||{......,,,,..,{{{{,..{{||,,,)}},.........(((((((..({,.....,),)))))))...|||,|..,,...({{{(((((((((((((((({(((..{({,(((....)))..})}}.)))}...............,..............,,.)))))))))..{((((.......))))).......,{{{.{{{.......((((........))))..,,,}}}.}}}}.......,}}}...)))))))))}))))))).))))))))))).)))))))))))))))).))))))))).)}))))))).))))
Back