Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0004500
Sequence Length
762 nt
GC Content
0.4278
AUCAGGCUGAUUGUGGUAGCCACAUUCUAGAUGCUUAUCAAGAUAGUCAACUAACCCUUGAAUUUUUAUUCUUUCUAUCAAUGUACCUUAAUAUCAGAAGUUACUUUUCAUAAUCAUUGUACCCCUUGUCUGUGGGCUAUACGAAAAGAUUUGGAAGCAAGUUGGGGCUCUUAGAGUGAAUUAUUGAUACAAGCUAGCUUUUGAUAUACCUUUUGGUGUAUCAAAGAUACACUUUCUGGUGGCAAUGUCUGGUUCAUUUGUAACAUCUUGGAGAGGAUUGGAAUCUCUUUUCCUUUUUGUAUCAGGCCAGGAUAAUAGGAUAGAGGAGAGGCCAGAUCUGUAGAGAAUGAGCAAGUGGCUUGUUUAGGGUUUCCUGCCCUUGUGAGGUAAGGGCUCAAGGAUUAGAUUCAGUCUUUCCAUUUGCAGUGAAAGGAAGUAAACUCACUUUCCCACCCUCAUCCUGGAGGUUACUUAUGUUAUUUGCAGACCCCAACUUCUGCCUCUCUGUUAAGUAUACUUCUUAUGCAGGUUGCCCUUACUGUUACAUCUUACCACUGGGGGAAAGAUCCAAGGCUCUGGGAAGGACAGUGACAGUUGUCCUACAUUGGCUAGUUUCAAGACCCUGAGGGAAUUGCCAAGCCAGCAAUUAGGCAAUUUCUUUUUCUUUUCUUUUCUUUCCUUUUUUGAGAUGGAGUCUUGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGCGAUCUUCACUCACUGCAAGCUCCGCCUCCUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-218.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -232.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 290.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((....(((.(.((((((..(((((((.((((.(((((.(((....)))...)))))........((((((.........((((...(((.(((((((((((..((.((((.(((((.(((........)))...)))))...)))).(((.(((((((((((.(((..((((((............(((((((((((((((((((....))))))))))))...((((....)))).....).))))))(((..(((((.(((.(((((((..(((..(((((((((((.....((((.......))))..))))..)))))))..)))...(((((((((((((((.....))))))))(((....)))(((((((.....)))))))....(((..((((...)))).))).))))))).(((((..((....))..)))))....)))).))).))).)))))..)))))))))..)))))))))))..))).))).))..))))).)))))).))).))))..((((....((........))....))))))))))....)))))))))))(((((((......)))))))....)))))).)..)))...)))))((((((((((((........)).))))))))))............................((((((((...))))))))..(((((.(((((((((((((.(.((...)).))))))))..))))))...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((,(((,({.(((((...))))}.}|,,{,.,,,,.(((((.(((....}}}...)))))......,,{{{{{({{,,..,,,,{{,..{((({(((((((((((.{(({(((({((,(({(((........}}}...}}}}}...|||||{,..|}|||||||||.,,.}},|||||,}}}.,}}...}}|,}}}}}||||||||(((....||||||||,,,)}}}}}}}....)))},,..,|||||||,||,,,{{,{({,,,.((((((({,,{{..{{||||||||,..,|||{{|,,,,,,})))}..}})),,)))))))}})),}}|((,..{|||{{((((,,,..})))))}}{((((.....))))|(({{{{{|||||||...,(((..{{{{...)))).))).,,}},.({(,,,({{((,...,,.,))))).}}}||||{|,,.|||{|||||{{{........{{|||,,,,,,,,)))))........}))))).}))))}.))).))),.))}|}}}}}.}}}}}........,{{|{,{{.{{{..((((((((({(({((((,({.,,.,{|||}|||,..,{{{{|,{,..|{{..{||.,,|||{{|||{{,|},,,,...,),)))))))))}},.,,,,,}},..,{,,..,......}}||,})})))))).))),)).)))||({.((((((((((((.(.({...)).))))))))..})))))))}},)))
Back