Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0006700
Sequence Length
743 nt
GC Content
0.5114
GUUUACUCACUUCAUACCUUGACUGGACUUUUGCAUAUGGAGCUCUCCCCUCUGUACGCUCUAUUGGUCUGGAAACACAGAGUUGGUGCUACUUUUGAACAGCAUGCAGCAUGCUAUAUGCCUGAGACAUGGACCCAGUUUUUGGAAGUGCCCUAGGGAGGAGCUUCCUCUCUGACCUCAAGGGAAGAAGGAGGUCAGUAGGAAGUGGUGGGUGGAGCCACUUCUCUGUUCUGCUGUCUCCUCUCUACACCUCACAGCCCUUUUUGAGGAGCUGCGAAGGGUGCACAGGCCAGUAGCUGGAGGUUCUUUGGUACCCCCUCCUUUUAGGUGGGGUCAGCAGACACAGGGGCGCCAUGUGGCCGAGUUACCAAGAUGAACACGAGUUCAACGCCCACCUGGUUUGUCGCAUGUGCUGUAUGGAUGAACGGGACCGGGUUCAGAAGAAAACGUUCACCAAGUGGGUCAACAAGCACUUAAUGAAGGUCCGCAAGCACAUCAAUGAUCUUUAUGAAGAUCUGCGGGAUGGCCAUAACCUGAUCUCUCUGUUGGAGGUCCUCUCAGGCAUCAAACUGCCCCGGGAGAAGGGCAGGAUGCGUUUUCAUAGGCUGCAGAAUGUGCAGAUUGCCCUGGACUUCCUAAAGCAGCGACAGGUGAAACUAGUGAAUAUUCGCAAUGAUGACAUCACAGAUGGCAACCCCAAGUUGACCCUGGGUCUGAUCUGGACCAUUAUUUUGCAUUUCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-249.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -263.29
Frequency: 0.0000
Diversity: 203.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((.(((((.((...(((((.(((.(((((..((((((((.((((..((((((.(((....((((......))))..))).))...........((((((...)))))).....((.(((((.((....))))))).))..))))...)))).)))))))).(((((.......)))))(((((((((.((((((((((.(((((......))))).))...)))))))))))))).)))...((((.((((((((...)))).)))).).)))))))).)))))))).(((((((...)))))))..((((.(((...))).))))...((((.(((((.(((((((.((((.((...........(((((....))))).)).)))).))))..))).).))))))))..))))))).((((.((..(((....)))..)).)).))....((((((((..((((((.(((((((((...............))))))))).)))...)))(((...(((((.(((((.((.((((...((((((((((((.((((......))))..))))..(((((((..((((..(((..........)))..))))..)))))))))))))))...)).)).))))))).......((((....))))..((((...))))...)))))...)))..)))))))))))))..)))(((((.((......))....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((({..,,,...,.||,,{{({{,,.,{(,,(((((((,,.....,,,|,,.}}}|||,.,}|(((,.....)))|.{{{({{|,.{{{{{{{{{,,(((({{{|||||....{(((.{(((.,,...,((((((.{(((..(((((((((((((((,,,})}|}|||..,,....|||.{({{(((((.((((((((((.(((((......))))).)}...}))))))))))))),))).,.||((.((((((((...)))).)))).)},)))}))}}...)))).)))))).,}})))}.)))}.((((.(((...))).))))...((((((.(((((((({{..{{|||...,,,.,,..,.(((((....))))).})))}.}})))))))),})},}}))))))))..,,,,||,,..,}.))))}}}}}.....,,,))})}}..((((((((..((((({.(((((((((...............))))))))).}))...)))(((...(((((.(((((.{{.(,(({{{((((((((((((.((((......))))..)))),.(((((((..((((..(((..........)))..))))..)))))))))))))))...))})).))))))).......((((....||}}..,|||....)))}..)))))...)))..))))))))}))))..)))(((((.|,......}}....)))))
Back