Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0006900
Sequence Length
1308 nt
GC Content
0.4778
AAUUUAGGAAAGCUGAAUCUGUAGAGGGAAUAUCUGAGUGGGAGUACCUGCUCCCUGCUGAAAAGCAGUCUUUUUUUGAGAUGGAGUCUCACUCUGUCACCCAGGCUGGAUUGCAGUGGUGCCAUCUCAGCUCACUGCAACCUCUGCCGCCCGGGUCCAAGCAGUUUUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGAUUACAGGCUUGUGCCACCACUCCCAGCUCAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUUGCCAUGUUGGCCAGGCUAGUCUCGAACUCCUGACCUCAGGUGAUCUGCCCACCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUGGCAGGCGUGAGAGCCACAGUGCCUGGCCUGAAAAUACCAUCUUAAUGUGUCUUGUAGCUAUAACCUUGACACCUAGAGGACUGUGAUUAUAUAUUUGUUAAAUGAAUAUUUUUCAAUACCUAUGGUUGUCCUAAAUGUUGGAUAUUUAAUGAAAAAAAAAUUUUUUUUUGAGAUGGAGUCUUGCUCUAUUGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACAAUCUCAGCUCGCAACCUCUGCCUCCCAGGUUCAAGCCAUUUUCCUACCUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGAUUACAGGAGCGCACCACCUUGCCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACCAUAUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAAGUGAUCUGCCCACCUCAGCCUCCCAAAAUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACUGCUUCUGGCCUUUAAUGAAUUUUUUUUUUUUUUUUUUUAAGACAGAAUCUUACUCUGCCACCCAGGCGGGAGUGCAGUGGCGCAAUCUCAGCUCACUGCAGCCUCUGCCUCCCGAGUUCAAGCGAUUCUCCUGCGUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGAUUACAUGCGUGCACCACCACACCUGGCUAAUUUUUGUCUUUUUUUGGGUAGAGUCGAGGUUCCCCAUAUUGGCCAGGCUGGUCUUGAACUCCGGACCUCAAGUGAUCCACCCACCUCGGCCUCCCAAAGUUCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACUGCCCCUGGCUGGCCUUUAAUGAAGUUUAAAGCAUGGAUCUUGACUUGAAAGAGCUCAAUUCAGAUACAGAAAUGGACUUAGAUACAGAGCUUUCUAAUGAUAGGUUUUAUAUGCUUAGUGCUAAGUAAAUUGAAGAAACUUUAAAGUGCCAUAGGCAUCCAAAGGUGGCUGACAUGUCCGGAAAGGUGUAACAGAAGCAAGACUUCAGCUGGACUUUGAAAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-424.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -448.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 343.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...(((((((((((..(((......)))......(((((((....))))))).(((((....)))))...........((((((((...))))))))((((.(((.((((((((((((.((.......)))))))))))..)))...))).)))).....)))))))))))..((((((.((.....((((((((.....(((....))).....))))))))(((((((((((((..(((.(((((..(((((.((((...)))).))))).)))))..)))..(((.((((((((.......)))))..((((((((......))))).))).(((......))).....((((((((........((((((((..(((((................)))))(((.(((....(((....((((((((...))))))))...)))...))).))).(((((........)))))......(((((((....))))))))))))))).(((((((......))..(((((((((.((((((((..((((((((((.(((.....)))......(((....)))..........(((((....))))).)))))))))).((((((..(...(((..(((((((((((...................((((.......))))))))))))))).)))...)..)))))).................(((((.....(((((......)))))....)))))...)))))))))))))))))...........................))))).(((((((((((((((..(((((((((((.((((.((((((............))).))).))))))))))(((((.(((.((((....((....)).....)))).))).)))))......(((......))).)))))....................)))))))).)))))))........)))))))).(((((.(....).)))))((((((((((((..(((((.(...(((((......)))))...))))))...((((..(((...)))))))((((((......))))))..))))))...))))))..))).)))....))))))))))))).((((((.(((.((((.....(((.....)))......)))).)))))))))...((((((...)))))).(((((...))))).....)).))))))..).(((...(((((.((.(.((((.....)))).).)).)))))....))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,(((((,..,{||||}|({.,,{{{{,....,||((({((({{,.,}})))),|((((....))))|{({{{{{{{{,((((((((...})))))))((((.(((.((((((((((((.((.......)))))))))))..)))...))).))))....(((,{{{|||,||.((((((.{(.....((((((((.....(((....))).....))))))))(((((((((((({..{{{.(((((..(((((.((({...}))).))))).)))))..,|,((((....)))).|.||(({(,{{({((((((.....}).)))))).,))))|||.,,.{,|||.....((((((((.,......{{{((({,..(((((..{,.........,..))))){{|.{((....(((....((((((({...})))))))...)))...}}}.})).(((((........)))))......{(((((({,,,||}}},}}|}|||||(((,,.||}}}}}},}..(((((((((.((((((((..((((((((((.(((.....})).....,((|....))}..........(((((....))))).)))))))))).((((((..(...(((..(((((((((((.,{{.(({,...,,}),)}|{((,......)))}))))))))))).)))...)..)))))).......,.,.......(((((.....(((((......)))))....))))).}.)))))))))))))))))..,,.|||..,,,,}}}}.,,.....,}}}},.(((((((((((((((..{{(({{(((((.((((.((((((............))).))).)))))))))|{({{,.,{,|||,|,...(({{..}}.{{{{|,,..,,))))).....||,(((....,,}}}.}}}|},........,.........,)))))))).)))))))........)))))))).(((((.{....}.)))))((((((((((((.,(((((.(...(((((......)))))...)))))).}.((((..(((...)))))))((((((......))))))..))))))...))))))..,,}.}},..,,))))))))))))).((((((.(((.((((.....{{,.....,,,,.....)))}.)))))))))...{(((((...)))))}.(((((...))))).....)).))))))...}}|,))}}}),})}.,}))}}).,))))))))})),,,}},,,,,,}}},
Back