Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0008300
Sequence Length
408 nt
GC Content
0.3137
GUGUGAGCCACUGCGCCCAGCCACAGCUAUUAUUAAAAAUUAAAUUAUGUAAACAUACAAUUAAAUAAAUUAUAUUUAAAGUAAAUGUAAUACAUCCUCAAAGCUGUUCAUUUCAUAAUUGUUUUGCUGCAUGUUAGUAUUGUCUGUACUCUUGAGGUUAUGUCUGUUGUGUCUCUGUGAUGGAAAUACUGUACAUAAUGGUGUGCUACUGUAUAUUUCUUCCCAACAUUGCAUUUAGUGAUAUUAUAUUAGUAGCUUGAAAUUGGUUGUAUUGGGAAUAUUUACAUCAUGGAAAUCAGCAAAUUCUACAAGUUUGAGUUAGAUGUCUUGUUUUGUUUAUUGUUUAGACUUAAGAAAGUGAUGGGGAAAAUGUUAAUAUUGCAGAUUAAAUUUAAAAGUGUGGGCCGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-76.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -87.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 112.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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