Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0015200

Sequence Length

576 nt

GC Content

0.3733

GUAAGUGAGCUUAUCCUUUGCUGAGACUUGGGGUUUGCUGGUCUGUACUGUUGUUGCUUCUUGAUUAUAGAUUCCUUGUAUUCUUUUCCCAAACUGCAUUAAUAGAAGUACUCUCCUGGUGACAAAUAAUAGCACCACUCUCAGGCUGGUCUUAAAAUGUUGUGGUAAAGGGGCAAUGUCAGCCAUCUCUGUUUUUUAAAGGGCUUAUUGAAAAAUGACAUGUAUUUAUUCAGAAAUCUUGAGUUUUGUGGACAAAUUUUUCUGCUUCUCAGAGGGAAGCUAAAUCUUUCCCUAGGGUGGAAAGAAGAGAGACUUCUAUUCAGAAUUUGAUUCCCAGAGAAUUUGAAGUUGUAGAAAUGAGAAUUUAACCUUGCCAGAAUAAAAGUUAUUGAGGGGAAAGGAGGAUUUAUAGAAAGUGUAAAAGGAAUGGAAUGACUUAGAGUAGGUAGUCCCUACAUUCUAGAGGUGACUUUUCUGCUCUUUAACUCAAGGGUGAAGAACCUGAUACAUAUUUGAUUGUUUUUCCAUGUUAGACAAUAGGAAAAACUGCUGAAUGGCUGGGUAAAGAAGCAAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-133.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -147.85

Frequency: 0.0000

Diversity: 177.42

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((.(((..(((((..(......)..)))))..))).).)).)))(....(((((((((........(((((((.(((.(((((......(((((...((((((((.(((((.(((((.(........))))))......(((((........(((((((.........))))))))))))..((((.........))))......(((((((...........((((((.....))))))...........))))))).(((((((...)))))))....((((((((....).))))))).)))))))))))))(((((.((((.....))))...)))))...)))))......((((((..((((.((..(((((...)))))....)).)))).))))))...))))).))).)))))))..........((((((((.(((((((.(......)))).))))..))))))))...(((((.((((.....))))...............((((((((.((((....)))))))))))).(((....)))))))).)))))))))..)

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((.(((..(((((..{......}..)))))..))).).)).)))(..,.(((((((((..,{,,,,{{{(({{.,,((((((((({...{(({{..,{(((((((.(((((.(((((.(........)))))}......((((({.,......((((,(.,,...,,,}}}}}}})))))..,{{{{{{{,,,,,,}}}....,}||||||||...,..,,,,{((((,.,...,}}}}}||},}}}}.,,}||||||.(((((((...)))))))....((((((({....}.))))))).))))))))))))}|{||{,{{{{,,,,.}}}}}}|}}}}},||},},},,,|,.|,}}}}..|||},||,.||||..,}}},})},}))}}})))))}}}||,||...,}}})}.,}))))}..,,|,,,,.((((((((.(((((((.{......}))).))))..))))))))...,,|{|,(({{.....}))),,..{,....},...((((((((.((({....}))})))))))).{{{.,..)})}}))).))))))))).,)