Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0015400

Sequence Length

1075 nt

GC Content

0.4335

AAAUCUUGAGUUUUGUGGACAAAUUUUUCUGCUUCUCAGAGGGAAGCUAAAUCUUUCCCUAGGGUGGAAAGAAGAGAGACUUCUAUUCAGAAUUUGAUUCCCAGAGAAUUUGAAGUUGUAGAAAUGAGAAUUUAACCUUGCCAGAAUAAAAGUUAUUGAGGGGAAAGGAGGAUUUAUAGAAAGUGUAAAAGGAAUGGAAUGACUUAGAGUAGGUAGUCCCUACAUUCUAGAGGUGACUUUUCUGCUCUUUAACUCAAGGGUGAAGAACCUGAUACAUAUUUGAUUGUUUUUCCAUGUUAGACAAUAGGAAAAACUGCUGAAUGGCUGGGUAAAGAAGCAAGAAGUGAUGUGCAAAUAAUAAAUCAAAACUGGGACAAGAGGGCAUGGCUGUGUUUUUGGACUGAAAGAGUAUCUGUUUCAGGUGUGGAUUGAAUUUGGCCGAAUUAAACUGCCUCAAGGUUAUCACCCUAAUGAUGUGGAAGAAGAGUGGGGAAAGCUCAUCAUAGAGAUGCUGGAACGAGAGAAAUCACUUCGGCCGGCUGUGGAGAGGCUGGAAUUGCUGCUACAGAUUGCAAACAAAAUCCAGAAUGGUGCUUUGAACUGUGAAGAAAAACUGACACUAGCUAAGAAUACACUGCAGGCUGAUGCUGCUCACCUGGAAUCAGGACAACCGGUACAAUGUGAGUCAGAUGUCAUUAUGUACAUUCAGGAGUGUGAAGGUCUCAUCAGGCAGCUGCAGGUGGAUCUCCAGAUCCUGCGGGAUGAGAAUUACUACCAGCUAGAAGAGCUGGCUUUUAGGGUCAUGCGUCUUCAGGAUGAGCUGGUCACCUUGCGUCUAGAGUGUACAAACCUGUACCGGAAGGGUCAUUUCACUUCACUUGAAUUGGUUCCACCCUCUACUUUAACCACCACUCAUCUGAAAGCAGAACCCUUAACCAAGGCAACCCAUUCUUCUUCUACCUCCUGGUUCCGAAAGCCUAUGACUCGGGCUGAACUUGUGGCCAUCAGCUCCUCUGAAGAUGAAGGCAAUCUCCGAUUUGUGUAUGAACUACUGUCUUGGGUAGAAGAGAUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-303.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -321.43

Frequency: 0.0000

Diversity: 294.48

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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