Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0017900

Sequence Length

474 nt

GC Content

0.4641

AUGAAACUGGAGCGAGCAGAGUGGGGCAAUGACCUGCCUAGUGUGGAGUUGCAGCUAGAAACACAGCAGCACAUCCAUACGAGUGUAGAAGAGCUGGGCUCAAGUGUCAAGGAGGCCAGGUUGUAUGAGGGAAAGAUGUCCCAGAAUUUCCAUACCAGCUAUGCUGAAACUCUUGGAAAGCUGGAGACACAGUAUUGUAAAUUGAAGGAAACUUCUAGCUUCCGGAUGAGGCACCUUCAGAGCCUGCAUAAAUUUGUUUCCAGAGCUACAGCUGAGUUGAUCUGGUUGAAUGAGAAGGAGGAGGAGGAACUAGCAUAUGACUGGAGUGACAACAAUUCCAAUAUCUCAGCCAAGAGAAAUUACUUCUCUGAGUUGACAAUGGAACUGGAGGAGAAACAGGAUGUGUUUCGUUCUCUACAAGAUACAGCAGAACUACUUUCACUUGAGAACCACCCAGCCAAGCAGACAGUGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-135.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -144.08

Frequency: 0.0000

Diversity: 103.55

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....((((..((..((........))......((((((.(((((((..(((.(((........))).)))..))))))).)).))))....((((((((((((((..(((.((..(..(((((((..((((......))))........(((.((((((((((((...(((((......(((((((((......((((..(((((((.........(((((.....))))).)))))))....))))......))))))))).....(((((((.....)).))))).............)))))....))))))).).)))).))).......(((((.....(((((..((((((.....))))))..)))))...))))).(((((((((((((.....)))))).)))))))....))))))).)..)).))).)))))))).....))))))...))...))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....((((..((..((,,.{{.{,,,..,.,}|}))||.(((((((..(((.(((........))).)))..))))))).,}.,,,,..,.((((((((((((((..(((.{(..(..(((((((..((((......)))).......,(((.((((((((((((...((((({{,,,{((((({{{{,|,|..{{{,..,{(((({...||||..|{|||.....)))}|.}}}}}},..,,}}}}....,,|}}}}||||{,,,.{|||..,}},,.}}}))|,},}}.,,..,.,,,}))))....})))))).}.)))).}}}....,..(((((.....(((((..((((((.....))))))..)))))...))))).|((((((((((((.....)))))).))))))}....))))))).)..)).))).)))))))).....)))))),..))...))))....