Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0022500

Sequence Length

1395 nt

GC Content

0.4803

AUUACUAUUUGCAAAAAUGAUGAAUGUGUGCUAGAAGAUAAUUCUCAGCGGACCAAAUGGAAAGUGAUCAGCCCCACAGGGAACGAGGCAAUGGUGCCGUCAGUCUGCUUCCUCAUCCCCCCACCCAAUAAGGAUGCCAUUGAGAUGGCCAGCAGGGUCGAACAAUCUUAUCAGAAGGUUAUGGCCCUUUGGCAUCAGCUGCAUGUUAACACCAAAAGCCUUAUCUCUUGGAACUAUCUGCGUAAAGACCUUGACCUUGUACAGACCUGGAACCUAGAAAAGCUUCGAUCCUCAGCACCAGGGGAGUGCCAUCAGAUUAUGAAGAACCUUCAGGCCCACUAUGAAGACUUUCUGCAGGAUAGUCGUGACUCUGUGCUGUUCUCAGUGGCUGAUCGCUUGCGCUUGGAAGAGGAGGUGGAAGCUUGUAAAGCCCGCUUCCAGCACCUGAUGAAGUCCAUGGAGAAUGAGGACAAAGAGGAGACUGUGGCCAAGAUGUACAUUUCAGAGUUGAAGAACAUCCGGCUACGCCUGGAGGAGUAUGAACAGAGGGUGGUCAAACGAAUUCAGUCUCUAGCCAGCUCUAGGACUGACAGAGAUGCCUGGCAGGACAAUGCAUUAAGGAUUGCAGAGCAAGAGCACACCCAGGAGGAUUUACAGCAAUUGAGGUCAGACUUGGAUGCAGUUUCUAUGAAAUGUGACAGCUUUCUCCAUCAGUCUCCAUCUAGUUCAAGUGUCCCAACUCUGCGCUCAGAACUGAAUCUGCUGGUGGAGAAGAUGGACCAUGUCUAUGGUCUCUCUACUGUAUAUCUGAAUAAGUUAAAGACAGUUGAUGUUAUAGUACGUAGCAUACAGGAUGCUGAACUCUUGGUCAAAGGUUAUGAGAUUAAGCUGAGUCAAGAAGAAGUAGUACUGGCAGAUCUCUCAGCUCUGGAGGCCCAUUGGUCGACAUUACGGCACUGGCUUAGUGAUGUGAAGGACAAGAAUUCAGUGUUUUCAGUCCUGGAUGAGGAAAUUGCCAAGGCCAAGGUAGUGGCAGAGCAGAUGAGUCGUCUGACACCAGAGCGAAAUCUGGAUUUGGAGCGCUAUCAGGAAAAAGGCUCCCAGCUGCAGGAGCGUUGGCACCGAGUCAUUGCCCAGCUCGAGAUUCGCCAAUCUGAGCUAGAAAGUAUCCAGGAAGUUCUGGGAGAUUACCGAGCCUGCCAUGGAACUCUCAUCAAGUGGAUUGAGGAAACCACUGCCCAGCAGGAAAUGAUGAAGCCAGGCCAGGCAGAGGAUAGCAGAGUGCUUUCGGAGCAGCUCAGCCAGCAGACGGCCCUAUUUGCAGAAAUUGAGAGAAAUCAGACAAAACUGGAUCAAUGUCAAAAAUUUUCCCAGCAGUACUCUACUAUUGUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-420.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -448.90

Frequency: 0.0000

Diversity: 433.21

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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