Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0033800
Sequence Length
1634 nt
GC Content
0.4492
GAUUGCACUACCAGGAAUCAGAUGGAAAAGCCCAAGUGACAGGCCCAUCCCAAAUUUCCAAAACAGACAAGUCUUUCCAAGGAACCACCAGACAGGAGACCAACUAUCAAGAUUCCUGGGUUACUUCGAAAACUAAGGAAACCAAACAUCAAAUUUCCUCAUCUAAUGAAUGUAAAGAAAAGUCAUACCAAGAAGUAUCUUUUGACCCAGCAAGAGGUCUUAAAUUGGAAGAAAUCACAGUUUCUAGACCAGAUUCAAAAGAAGUCAGGUAUCUAGAAUUCUCAGACAGAAAAGACCUUCAUCAUCAGGGCAGCAAAAGUGAUGAUAAACUUUGUGGAACUCUCAAAUCUGAAAUAGCAACACAGGAACUAACUGGAGAGAAAUUUCUAGAAAUGGCAAACCCUAAUGUUGCAGGUCUAGAAGCAGGAUCCAUUGAGGACAUAGUGACUCAGAGAGGUUCCAGAGUCUUGGGAUCCUUUCUUCCAGAGAAACUGUUCAAAGGAGUGUCUCAAAAAGAGAAUACAGGGCAACAGAAUGCCAUCAUUAGUCCUACUGUUCUAGAGACCAGUGAAGAAAAGACAGUGUCCCUAACAGUAUGCUCUGCAGUGAAGACAGAGAAGACACCACAGGAAAAGCUCAGAGAAAGCCCUGGCAGUGAACAAACUCCCUUCAUGACUGCACCUGAAGGAAAGGGAAAUGGAGGUGUAAACCCAGAGCCCUUCAGAGCAACUCAGAAUGUAUUUACCCGGCAACUCUGUUUAGAACAUGAUGAAAAGCUAGUAUCCUAUCUGUCUCUGUUACGGAACAUUGAAAUGAGGACCAAACAGAUUCAACCUUUGGAGCUAAACCUGGCAGAACUACAGGAUCUGCUGUGUCAGGCCAAGGUAUUAGAAAGGGAGUUAAAGGAUCUGACCACCUUGGUCAGUCAGGAGCUGGAGUGUGUGAAUCAGAUUAUCAUCAGCCAGCCUCAAGAAGUUCCUGCUCAACUGUUGAAGGCUCUAGAGAAAGAUGCCAAGAAUCUUCAGAAGUCUCUCAGCUCUGUGAGUGACACUUGGAAUUCCAGGCUACUCCACUUCCAGAAUGCUGUGGAAAUAGAAAAGACUAAAGUGUUAAAUCAGCACACACAGCUAGAAGGCCGACUUCAAGAUCUGAGAGCCUGGGUUGGCAAUAAAAAUCUUAUUCUGAACAGCAAGGGAUCUAACAGUGAAAUAGAUGUUGACAGCCUGAACCUCUGCCUCCAACAGUAUGAGGAUUUGAAACAGCCCAUGGCUGAAAGGAAAGCUCAGCUGGAUGCUCUUGCUUUUGAUAUUCAGUUCUUUAUCUCAGAACAUGCCCAGGACUUGUCCCCUCAGCAGAAUCGACAGAUGCUGAGGCUUCUGAAUGAACUGCAGAGGUCCUUCCAGGACAUUUUGGAACAGACUGCCGCUCAGGUGGAUGCCUUGCAGGGCCAUCUUCAACAAAUGGAGCAGGAAGCCCUGGUGAAGACCCUGCAGAAACAACAAAAUACCUGUCACCAGCAACUGGAGGAUCUUUGCAGUUGGGUAGGACAGGCAGAAAGAGCACUGGCAGGCCACCAAGGCAGAACCACCCAGCAGGAUCUCUCUGCUUUGCAGAAGAACCAAAGUGACUUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-460.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -489.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 500.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...((....((((...(((((....(((.........))))))))......)))).....))...))))((((.(((..((...((..((((((.........((((..(((((((((((((((.......((((((............)))))).......)))).))).............((((.(((.((((((((......)))))))))))...)))).....(((.(.(((((((((((...(((....))).((((((....(((.((((...(((((........(((((((...(....)....))))))).....))))))))).)))...))))))....((((((.(((..(((.(((((((....)))))))...))).....)))..)))))).))))))))))).))))......(((((.((((((...(((((((((((((....)))))).)))))))(((...(((....)))...)))(((((((.....))).))))..((((......)))).)))))))))))..((((((.((((....(((((((..((((((((((.((((((....((((((......).))))).(((((....((((...((.(((........)))))(((......))).((((((.(......).)))))).(((((...(((.(.......))))...)))))...(((...(((..((((.((((..(((.....)))..))))))))..)))...)))....))))...))))))))))).)).)))))).......((((((.((((((((((((((....(((((((((((...((.((((......))))))...))).)))).))))..)))).)))...)))))))......)))))).(((((((((.(((((((((((.........))))...(((((.........(((((.(((((((((((.((((...((((.(((((.......)))))....((.(((((((.((((((((((...(((((....))))).)))).))).........((((((....(((......)))..(((((.....))))).))))))..((((.....)))).))).))))))).))((((((.((((....((((..(((.......................)))..)))))))).))))))....)))))))).))))))).)))).........(((((...)))))..)))))......)))))))))))).)))))))))..))..))))))))))))))))).))))))))))))...((((((((...((....))))))))))))))))..))(((((((((((((((.((((......((((.((((.(((((.....))))).....((((((((...((((((.((...((.((.....)))))).))))))))))))))..............))))..))))...)))))))))))))))))))((((.((.(((((.......)).)))....(((.....)))....))))))....((.(((.(((((...)))))))).))...))..)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({......,,,((((,,.(((((....(((.........))))))))......}}}}......|...}|||(((,,{{(,.{{...{{..{{{|{{.........{,,|}}||||||{({,,(((,.......((((({............}}}}}|,,,...,|||,.}},........||,,.((((.{((.((((((((......))))))))))}...})))......{{.|.(((((((((((...{((....)}}.{(((((.,..(((.((((...{{{{,..{{....(((((((...{....}....}))))))....))))}))))}.)))...))))))....((((((.(((..(((.(((((((....)))))))...))).....)))..)))))).))))))))))).||||{{.{{{({,,,,((((,,((((((((((((((({....}))))).)))))))..,.}}}..}}}})))}}.))}(((((((.....)))},)))..((((......)))).|||||}||||(({{{{,.|||.|||,|}||,........||{||||{}||||||,...((((((,,,..,}.|||||.,{{{{...,(((,...(({{,{....,,}})))||{({,.....}}}.((((((.(....,.,,)))))).{((((...(((.(,,....,))))...))))),.,(({...{{{..{{({.{{{{..{(({,..,|})..}|||}}}}..}}}..,||},{,.|||,...||}}||||||,.||..|}|}}...,},},.}}.}}}}}|,,|,.{{{{{,,..(((((((((((.{,,{,((((......))))))}..)))}}))).)))),})))|||}}...,{{.(((((({...)))))))||.,({(((((..{({({{(......}}.,))),,.))))}}))..,..,|}}}}}|||,(((((((.((((..,((((.{(((({{{,,..,}}||{{{..({({(((({.{{{{||||{|,,.{||||....|||||,|,|||,},,{,,,....((((((....,{(.....,|},..{{{||.....}}}}}.))))))..((((.....)))).}}}.}})))))}))}}||||}||,,.....|||}.}}|||...,,,.,{{,.{|{{,{{.......,,,))))}.,,,})},...})}})))).))))))).||||..|||....(((((...)))))....}}}.,}}}}||})}}})))},.))))))}}}..}},}))))},}...}}))}..,)))}}))}}})),,.((((((((...((....))))))))))})))))..},.||||||||||||(((((((,.{,{{((((.,{,{.(((((.....|||||.,{{{{(((((((...((((((.(,...((.((.....))))}}.)))))))))))))}.............,||||{.||,,,{{|||}||}}}})))})))))||||.{|,||||{.......,,.}}),},.{||,,,..))),}..}},}|},...||.{{(.(((((...)))))))).)),,,))}.)))))))
Back