Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0034000
Sequence Length
1010 nt
GC Content
0.4386
UUUCUAGACCAGAUUCAAAAGAAGUCAGGUAUCUAGAAUUCUCAGACAGAAAAGACCUUCAUCAUCAGGGCAGCAAAAGUGAUGAUAAACUUUGUGGAACUCUCAAAUCUGAAAUAGCAACACAGGAACUAACUGGAGAGAAAUUUCUAGAAAUGGCAAACCCUAAUGUUGCAGGUCUAGAAGCAGGAUCCAUUGAGGACAUAGUGACUCAGAGAGGUUCCAGAGUCUUGGGAUCCUUUCUUCCAGAGAAACUGUUCAAAGGAGUGUCUCAAAAAGAGAAUACAGGGCAACAGAAUGCCAUCAUUAGUCCUACUGUUCUAGAGACCAGUGAAGAAAAGACAGUGUCCCUAACAGUAUGCUCUGCAGUGAAGACAGAGAAGACACCACAGGAAAAGCUCAGAGAAAGCCCUGGCAGUGAACAAACUCCCUUCAUGACUGCACCUGAAGGAAAGGGAAAUGGAGGUGUAAACCCAGAGCCCUUCAGAGCAACUCAGAAUGUAUUUACCCGGCAACUCUGUUUAGAACAUGAUGAAAAGCUAGUAUCCUAUCUGUCUCUGUUACGGAACAUUGAAAUGAGGACCAAACAGAUUCAACCUUUGGAGCUAAACCUGGCAGAACUACAGGAUCUGCUGUGUCAGGCCAAGGUAUUAGAAAGGGAGUUAAAGGAUCUGACCACCUUGGUCAGUCAGGAGCUGGAGUGUGUGAAUCAGAUUAUCAUCAGCCAGCCUCAAGAAGUUCCUGCUCAACUGUUGAAGGCUCUAGAGAAAGAUGCCAAGAAUCUUCAGAAGUCUCUCAGCUCUGUGAGUGACACUUGGAAUUCCAGGCUACUCCACUUCCAGAAUGCUGUGGAAAUAGAAAAGACUAAAGUGUUAAAUCAGCACACACAGCUAGAAGGCCGACUUCAAGAUCUGAGAGCCUGGGUUGGCAAUAAAAAUCUUAUUCUGAACAGCAAGGGAUCUAACAGUGAAAUAGAUGUUGACAGCCUGAACCUCUGCCUCCAACAGUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-271.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -290.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 237.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((.(((((....).)))).))..)))))))..((((........((((((.((.(((.((((..((.(((((........)))))(((...((.(((....)))...))...))).........(((((((....))))))).....))...)))).))).)).))))))...(((((((....(((((((.(((((..((((((((((((((((....)))))).)))))))....)))..)))))))......(((((((.....))).))))..((((......)))).(((((.((((((......))).))).)))))........((((((((.((((((....((((((......).))))).(((((....((((...((.(((........)))))(((......))).((((((.(......).)))))).(((((...(((.(.......))))...)))))...(((...(((..((((.((((..(((.....)))..))))))))..)))...)))....))))...))))))))))).)).))))))...(((.((((((.((((((((((((((....(((((((((((...((.((((......))))))...))).)))).))))..)))).)))...)))))))......))))))..)))...(((((..((.((((.........)))))).)))))))))).....)))))))..(((((((.((((...((((.(((((.......)))))....((.(((((((.((((((((((...(((((....))))).)))).))).........((((((....(((......)))..(((((.....))))).))))))..((((.....)))).))).))))))).))((((((.((((....((((..(((.......................)))..)))))))).))))))....)))))))).))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((.(((((....)})})).)),.}))))))..((((........((((((.((.(((.((((..{(.,{(((........)))}|(((...{{.(({....}))...}}...}})}|.......(((((((....)))))))....,)}...)))).))).)).)))))).{.{((((((.{,.((((({..,((((,,((((((((((((((({....}))))).)))))))..,.}}}..}}}}}||,,.||,(((((((.....)))},)))..((((......)))).{((((.((((((......})).))).))))}........(((((({(.((((((....((((((......).))))).{((((....((({...((,(((.,....,,)))}}{((......}}}.((((((.(....,.,.)))))).(((((...(((.(,,....,))))...)))))...(((...(((..((((.((((..(((.....)))..))))))))..)))...)))....))))...))))))))))).)),})))))...,,,|,,|,.,.,,|,|||,.|||||},..(((((((((((.{,,{,((((......))))))}..)))}}))).)))).,,}})})))....{{.(((((({...)))))))))..,.(((((..{({({{(.....,}}.,)))}}.)))))))))}.....)))))))}.(((((((.((((...((((.{(((({{{,,..,},|{{{{..(,({(((({.{{{{||||{|,,.{{|||....|||||,|,|||,}},,,,,....((((((....,{(.....,|},..{{{||.....}}}}}.))))))..((((.....)))).}}}.}})))))}))}|||||}||,,.....|||}.}}|}}....,,.,{{..,||{,{{.......,},))))).,,,)))....)))})))).))))))).))))
Back