Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0034300
Sequence Length
703 nt
GC Content
0.4523
UCCUACUGUUCUAGAGACCAGUGAAGAAAAGACAGUGUCCCUAACAGUAUGCUCUGCAGUGAAGACAGAGAAGACACCACAGGAAAAGCUCAGAGAAAGCCCUGGCAGUGAACAAACUCCCUUCAUGACUGCACCUGAAGGAAAGGGAAAUGGAGGUGUAAACCCAGAGCCCUUCAGAGCAACUCAGAAUGUAUUUACCCGGCAACUCUGUUUAGAACAUGAUGAAAAGCUAGUAUCCUAUCUGUCUCUGUUACGGAACAUUGAAAUGAGGACCAAACAGAUUCAACCUUUGGAGCUAAACCUGGCAGAACUACAGGAUCUGCUGUGUCAGGCCAAGGUAUUAGAAAGGGAGUUAAAGGAUCUGACCACCUUGGUCAGUCAGGAGCUGGAGUGUGUGAAUCAGAUUAUCAUCAGCCAGCCUCAAGAAGUUCCUGCUCAACUGUUGAAGGCUCUAGAGAAAGAUGCCAAGAAUCUUCAGAAGUCUCUCAGCUCUGUGAGUGACACUUGGAAUUCCAGGCUACUCCACUUCCAGAAUGCUGUGGAAAUAGAAAAGACUAAAGUGUUAAAUCAGCACACACAGCUAGAAGGCCGACUUCAAGAUCUGAGAGCCUGGGUUGGCAAUAAAAAUCUUAUUCUGAACAGCAAGGGAUCUAACAGUGAAAUAGAUGUUGACAGCCUGAACCUCUGCCUCCAACAGUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-183.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -196.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 198.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((..(((.((((.((.........)).).))).)))))))))..((((((......).))))).........((((((...((..(((......(((((.(((((((.(((((((((.((((((.(((..((((.(((((...(((.(.......))))...)))))...(((...(((..((((.((((..(((.....)))..))))))))..)))...)))....((((.....((..((((....))))..))....)))).....((((((((((((((....(((((((((((...((.((((......))))))...))).)))).))))..)))).)))...)))))))....)))))))))))))))))..))))).)))...........))))..))))).))).))...))))))(((((((((((.((((...((((.(((((.......)))))....((.(((((((.((((((((((...(((((....))))).)))).))).........((((((....(((......)))..(((((.....))))).))))))..((((.....)))).))).))))))).))((((((.((((....((((..(((.......................)))..)))))))).))))))....)))))))).))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,..((((((,.,((.(({{{,({.........)},}))).)))))))))..((((((......).)))))....,,...((((....(((..,....,}}})))||{{,{,,,.{((((((((,.,{,.,{{..({(({{{.,((((...(((.(,,....,))))...)))))},,{((...(((..((((.((((..(((.....)))..))))))))..)))...))},,..{{{,...{{,,{{((((..{{..|,{.,....,,)..}}.}}}}}}..}}.,||}})),}||{,(((((((.{,,{,((((......))))))}..)))}}))).)))}.)))))))))....{{.(((((({...}))))))}}.,({(((((..{({({{(......,}.,))),,.)))))}))..,..}))))))|((((((((((.((((...((((.{(((({{{,,..,},||{{{..({({(((({.{{{{||||{|,,.{{|||....|||||,|,|||,}},,,,,....((((((....,{(.....,|},..{{{||.....}}}}}.))))))..((((.....)))).}}}.}})))))}))}|||||}||,,.....|||}.}}|}}....,,.,{|..,||{,{{.......,},))))).,,,)))....)))})))).))))))).))))
Back