Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0034700
Sequence Length
644 nt
GC Content
0.4519
UGAAGACAGAGAAGACACCACAGGAAAAGCUCAGAGAAAGCCCUGGCAGUGAACAAACUCCCUUCAUGACUGCACCUGAAGGAAAGGGAAAUGGAGGUGUAAACCCAGAGCCCUUCAGAGCAACUCAGAAUGUAUUUACCCGGCAACUCUGUUUAGAACAUGAUGAAAAGCUAGUAUCCUAUCUGUCUCUGUUACGGAACAUUGAAAUGAGGACCAAACAGAUUCAACCUUUGGAGCUAAACCUGGCAGAACUACAGGAUCUGCUGUGUCAGGCCAAGGUAUUAGAAAGGGAGUUAAAGGAUCUGACCACCUUGGUCAGUCAGGAGCUGGAGUGUGUGAAUCAGAUUAUCAUCAGCCAGCCUCAAGAAGUUCCUGCUCAACUGUUGAAGGCUCUAGAGAAAGAUGCCAAGAAUCUUCAGAAGUCUCUCAGCUCUGUGAGUGACACUUGGAAUUCCAGGCUACUCCACUUCCAGAAUGCUGUGGAAAUAGAAAAGACUAAAGUGUUAAAUCAGCACACACAGCUAGAAGGCCGACUUCAAGAUCUGAGAGCCUGGGUUGGCAAUAAAAAUCUUAUUCUGAACAGCAAGGGAUCUAACAGUGAAAUAGAUGUUGACAGCCUGAACCUCUGCCUCCAACAGUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-167.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -180.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 165.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((((((((((((((..((((....(((.......)))))))...))).........((((((.(......).)))))).(((((...(((.(.......))))...)))))...(((...(((..((((.((((..(((.....)))..))))))))..)))...))).........))).))))))))..(((((.((....((((.........(((((..(((((....(((((((((((...((.((((......))))))...))).)))).))))))))))))))....((.(((((((...)))))))))....(((((..((.((((.........)))))).)))))))))..))))))).)(((((((((((.((((...((((.(((((.......)))))....((.(((((((.((((((((((...(((((....))))).)))).))).........((((((....(((......)))..(((((.....))))).))))))..((((.....)))).))).))))))).))((((((.((((....((((..(((.......................)))..)))))))).))))))....)))))))).))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,..((((((({{((,,...,(((,...((,{{{.....,}})))}}{((......}}}.((((((.(......,.)))))).(((((...(((.(,,....,))))...)))))...(((...(((..((((.((((..(((.....)))..))))))))..)))...)))....}}}}.}}),))))))))..(((((.{{,...{{{{,.,,...|,{{{{{,,(((((....(((((((((((.{,,{,((((......))))))}..)))}}))).)))),}))))})}}...,||.(((((({...)))))))))..{,(((((..{({({{(......}}.,)))}}.)))))})),..,.))))),)(((((((((((.((((...((((.{(((({{{,,..,},|{{{{..(,({(((({.{{{{||||{|,,.{{|||....|||||,|,|||,}},,,,,....((((((....,{(.....,|},..{{{||.....}}}}}.))))))..((((.....)))).}}}.}})))))}))}|||||}||,,.....|||}.}}|}}....,,.,{{..,||{,{{.......,},))))).,,,)))....)))})))).))))))).))))
Back