Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0034900
Sequence Length
558 nt
GC Content
0.4427
GAGAACGUCAGAACUGAGUCAGCUUUCUUUUUGGCUCCACAGAAUGUAUUUACCCGGCAACUCUGUUUAGAACAUGAUGAAAAGCUAGUAUCCUAUCUGUCUCUGUUACGGAACAUUGAAAUGAGGACCAAACAGAUUCAACCUUUGGAGCUAAACCUGGCAGAACUACAGGAUCUGCUGUGUCAGGCCAAGGUAUUAGAAAGGGAGUUAAAGGAUCUGACCACCUUGGUCAGUCAGGAGCUGGAGUGUGUGAAUCAGAUUAUCAUCAGCCAGCCUCAAGAAGUUCCUGCUCAACUGUUGAAGGCUCUAGAGAAAGAUGCCAAGAAUCUUCAGAAGUCUCUCAGCUCUGUGAGUGACACUUGGAAUUCCAGGCUACUCCACUUCCAGAAUGCUGUGGAAAUAGAAAAGACUAAAGUGUUAAAUCAGCACACACAGCUAGAAGGCCGACUUCAAGAUCUGAGAGCCUGGGUUGGCAAUAAAAAUCUUAUUCUGAACAGCAAGGGAUCUAACAGUGAAAUAGAUGUUGACAGCCUGAACCUCUGCCUCCAACAGUAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-144.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -157.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 145.97
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.((...........(((((((((((((((((((.((..((.((((....((...((((((((.(((((.((.((..((.(((....))).)).)))))))).).))))).......)))..))....)))).))..)).)))))))).(((((((...((.((((......))))))...))).))))....)))))))))))....((.(((((((...)))))))))..(((((((..((.((((.........)))))).)))).)))..)).))).)).(((((((((((.((((...((((.(((((.......)))))....((.(((((((.((((((((((...(((((....))))).)))).))).........((((((....(((......)))..(((((.....))))).))))))..((((.....)))).))).))))))).))((((((.((((....((((..(((.......................)))..)))))))).))))))....)))))))).))))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((.((.....{,,.,,{((((((((((((((((((.((..((.,(({....((...{(({((({.{{(({.((.({..{(.(((....))).)),)}}}})}}.,.}}}}}.......)})..))....)))}.))..)).)))))))},(((((((.{,,{,((((......))))))}..))),,)))...,)))))))))))....((.(((((({...})))))))).,({(((((..{(,({{(,.....}}.,))),,.)))))}))..)}.)))}}).(((((((((((.((((...((((.{(((({{{,,..,},|{{{{..(,({(((({.{{{{||||{|,,.{{|||....|||||,|,|||,}},,,,,....((((((....,{(.....,|},..{{{||.....}}}}}.))))))..((((.....)))).}}}.}})))))}))}|||||}||,,.....|||}.}}|}}....,,.,{|..,||{,{{.......,},))))).,,,)))....)))})))).))))))).))))
Back