Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0037200
Sequence Length
2779 nt
GC Content
0.4872
ACCCUGCAGAAACAACAAAAUACCUGUCACCAGCAACUGGAGGAUCUUUGCAGUUGGGUAGGACAGGCAGAAAGAGCACUGGCAGGCCACCAAGGCAGAACCACCCAGCAGGAUCUCUCUGCUUUGCAGAAGAACCAAAGUGACUUGAAGGAUUUACAGGAUGACAUUCAGAAUCGUGCCACCUCAUUUGCCACUGUUGUCAAGGACAUUGAGGGGUUCAUGGAAGAGAAUCAGACCAAGCUGAGCCCACGUGAGUUGACAGCUCUUCGGGAAAAGCUUCAUCAGGCUAAGGAGCAAUAUGAGGCGCUCCAGGAAGAGACACGUGUGGCCCAGAAGGAACUGGAGGAAGCAGUGACCUCCGCCUUACAGCAGGAGACUGAAAAGAGUAAAGCAGCAAAGGAACUGGCAGAGAACAAGAAGAAGAUCGAUGCUCUCCUGGAUUGGGUAACUUCAGUAGGAUCAUCUGGUGGACAGCUGCUGACCAACCUUCCAGGAAUGGAGCAGCUCUCGGGAGCUAGCUUGGAGAAAGGAGCCUUGGACACCACUGAUGGUUACAUGGGGGUGAAUCAAGCCCCAGAGAAACUGGACAAGCAAUGUGAGAUGAUGAAGGCCCGUCACCAAGAAUUGCUGUCCCAGCAGCAAAAUUUCAUUCUGGCCACCCAGUCAGCUCAGGCCUUCUUGGAUCAGCAUGGCCACAAUCUCACACCUGAGGAGCAACAGAUGCUGCAACAGAAGCUGGGAGAGCUAAAGGAACAAUACUCUACUUCCCUGGCCCAAUCAGAGGCAGAACUGAAGCAGGUGCAGACACUUCAGGAUGAGUUGCAGAAAUUUCUGCAGGAUCAUAAAGAGUUUGAAAGCUGGUUGGAACGAUCCGAGAAAGAGCUGGAGAACAUGCAUAAGGGAGGCAGCAGCCCCGAGACCCUUCCCUCCCUGCUAAAGCGGCAAGGAAGCUUCUCAGAGGAUGUCAUUUCCCACAAAGGAGACUUGAGAUUUGUGACUAUCUCAGGACAGAAAGUCUUGGACAUGGAAAACAGUUUUAAGGAAGGCAAAGAACCAUCAGAAAUUGGAAACUUAGUAAAGGACAAGUUGAAGGAUGCAACAGAAAGAUACACUGCUCUCCACUCAAAGUGUACACGAUUAGGAUCUCACCUGAAUAUGCUGUUAGGCCAGUAUCAUCAAUUCCAAAACAGUGCUGACAGCCUGCAGGCCUGGAUGCAGGCUUGUGAGGCCAACGUGGAGAAGCUCCUCUCAGAUACUGUUGCCUCUGACCCUGGAGUUCUCCAGGAGCAGCUUGCAACAACAAAGCAGUUGCAGGAGGAAUUGGCUGAGCACCAAGUACCUGUGGAAAAACUCCAAAAAGUAGCUCGUGACAUAAUGGAAAUUGAAGGGGAGCCAGCCCCAGACCACAGGCAUGUUCAAGAAACUACAGAUUCCAUACUCAGCCACUUCCAAAGCCUCUCCUAUAGCCUGGCUGAGCGAUCUUCUCUGCUGCAGAAAGCAAUUGCCCAAUCUCAGAGUGUCCAGGAAAGCCUGGAGAGCCUGUUGCAGUCUAUUGGGGAAGUUGAACAAAACCUGGAAGGGAAGCAGGUGUCAUCACUCUCAUCAGGAGUCAUCCAGGAAGCCUUAGCCACAAAUAUGAAAUUGAAGCAGGACAUUGCUCGGCAAAAGAGCAGCUUGGAGGCCACCCGUGAGAUGGUGACCCGAUUCAUGGAGACAGCAGACAGUACUACAGCAGCAGUGCUGCAGGGCAAACUGGCAGAGGUGAGCCAGCGGUUCGAACAGCUCUGUCUACAGCAGCAAGAAAAGGAGAGCUCCCUAAAGAAGCUUCUACCCCAGGCAGAGAUGUUUGAACACCUCUCUGGUAAGCUGCAGCAGUUCAUGGAAAACAAAAGUCGGAUGCUGGCCUCUGGAAAUCAGCCAGAUCAAGAUAUUACACAUUUCUUCCAACAGAUCCAGGAGCUCAAUUUGGAAAUGGAAGACCAACAGGAGAACCUAGAUACUCUUGAGCACCUGGUCACUGAACUGAGCUCUUGUGGCUUUGCGCUGGACUUGUGCCAGCAUCAGGACAGGGUACAGAAUCUAAGAAAAGACUUCACAGAGCUACAGAAGACAGUUAAAGAGAGAGAGAAAGAUGCAUCAUCUUGCCAGGAACAGUUGGAUGAAUUCCGGAAGCUGGUCAGGACCUUCCAGAAAUGGUUGAAAGAAACUGAAGGGAGUAUUCCACCUACGGAAACUUCUAUGAGUGCUAAAGAGUUAGAAAAGCAGAUUGAACACCUGAAGAGUCUACUAGAUGACUGGGCAAGUAAGGGAACUCUGGUGGAAGAAAUCAAUUGCAAAGGUACUUCUUUAGAAAAUCUCAUCAUGGAAAUCACAGCACCUGAUUCCCAAGGCAAGACAGGUUCCAUACUGCCCUCUGUAGGAAGCUCUGUAGGCAGUGUAAACGGAUACCACACCUGCAAAGAUCUGACGGAGAUCCAGUGUGACAUGUCAGAUGUAAACUUGAAGUAUGAGAAACUAGGGGGAGUACUUCAUGAACGCCAGGAAAGCCUUCAGGCUAUCCUCAACAGAAUGGAGGAGGUUCACAAGGAGGCAAACUCUGUGCUGCAGUGGCUGGAAUCAAAAGAGGAAGUCCUGAAAUCCAUGGAUGCCAUGUCAUCUCCAACCAAGACAGAAACAGUGAAAGCCCAAGCUGAAUCUAACAAGGUACUGUGUUUACAUUAGUUGCCUCCCAACACCAAGAGGAAGAGACAGCUGUACCAGUGUUCCUGCCCAAGCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-871.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -918.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 786.64
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((...............(((.((((...))))..))).)))))))((((((..(...(((((...(((((((((...(((.....))).(((((.(((...((..(((((((((...)))))............((((.(((..((((((...((((((((.(((((((((((((((...((((((((((((.((((.(...(((((((((........)))))...((...(((.(((((((((.........((((((.(((...(((((((...(((....)))...)))))))..)))..)))))).)))))).))).)))..)).((((.......))))..)))).))))))))))))...(((......)))....(((........)))(((((((.........((((((..(((((((((((..((((....(((((((......(((.....))))))))))...)))))))))))...))))(((((....)))))..(((((.((..((.(((((...((((.((.(((....))).)))))).........((((.....))))(((.....))).........))))))).)).)))))..(((((((....))))))).........((((....))))(((((.(((((.(((((((((((((((........(((((....)))))........))))).........((((((.(((.((.((........)).)).)))))))))((((((((...((((.((((((...((....)).)))))).((((.(((((((....)))))))..))))......))))....))))))))...))))))))))...((((.....)).))...((((((((.(((.(((.((((..(((((....((((....))))...)))))..)))).).)).)))..(((((......)))))(((((((((.((..((((.(((((((.....)))))))..))))...)))))))))))..((((......(((........)))............(((...(((((..(((((..........((((((.............)))))).....(((((......)))))....(((....)))..))))).))))))))..(((((((((((..(((((((((((((....))))))))).))))....(.((((...)))).))))).)))))))))))(((..((((((....))))))..)))((((((((.........)))))))).((((.(((((((((((....(((...((((.....))))....)))....))).....((((((.(((.((..((((..(((..........)))..))))......)).))).)))))).)))))))).))))...))))).)))...)))))))))).)))))))))))))(((.....))).((((((.....(((..(.((((((....)))))).)..)))((((.((((((((((.............(((((.........))))).((((((.((((((..(..(((.((((((..(((((.(((.(((........))).(((((....))))).)))..))).))..)))))))))..)..))))))))))))))))))......)))).)))).(((((((........)))))))..))))))..))))))))))).))..)))))))))...((.((((((((((.(((.......((((.(((((((.....(((((((...((.(((((((((((........((((((....(((((...((((((((((((.......(((((...))))).(((((.......)))))...................)))))...((.(((((.((((((.........((....((....))....)).........)))))).)))))))..)))))))..((.((((((((((((.(((..((.(((....))).))..))).)....((((((......))).))).))))))))))).)).)))))....))))))........))))).)).)))).)).......(((.....))))))))))..((((...((((((....)))....)))...))))))))))).)))).((((((((.((((....)))).((((....)))).....(((.........)))...((((........))))(((((.(((..(((((.(((..(((((..(((.........))).)))))........(((..((.(((.(((((.......))))).))).))..))))))))))).))))))))))))))))..))))))))))))).))..........(((((.((....(((((.....))))))))))))..))))))..))))))))).))))..))))..))...)))....((((((.......((((.((((....)))).)))).......))))))..))))).......(((...(.((((.(((...(((.((((.......(.((..((((((.....)).)))).)).)......)))).)))...)))..)))).)...)))..(((((..(((.....(((((((((....)).))).))))((((........).))))))..)))))...)))))))))))))))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((..............,{{{.((((...)))).,)}}.)))))))((((((..(...(((((...(((((((((...(((.....))),{{.{{.,{{....||.{{{,(((((...))))).||.|,..,{{,,((({,,({{(((,(({{,({{{{{,,.{{,{({{(((({{((...{((({(((((((,{{((.{...{,(({((((,{,,....,,,||,,.,{...(((.(((((((((.........((((((.(((...(((((((...(((....)))...)))))))..)))..)))))).)))))).))).)))..,}..||(|,,,...},}}..))))}}}}}}}}}))})...{((......)))....{{{,....,..}}|(({..{{.{........}.}}..}||(((((((((((((((....{((.(((.....,))).))|{((.(((((......(((((((((..{(.((((((((((.((.(((.{(((........|}|}((((({(((,.(({({({{,.|.{{(((,(......).))))},.,.,.||((((,,(((((.,..{.(((((......))))),}....))))))))}),,||||||..........((((....))))(((((.(((((,((((((((((,{{,(,.......,((({....|)}}},{{,....,)))).,.......((((((.(((.((.((........)).))}))}))))))((((((((...((((.((((((...((....}).)))))).((((.(((((((....)))))))..))))......))))....))))))))...)))))))))),}.((((.....)}.)).,.,(((((((.(((.(({.((((..(((((,{..((((....))))..,)))))..)))).).)).)))..{((((......))))}((((((({{{((..((((,{((((((.....))))))),.))))...)))))))))))..((((,.....(((........)))...|||.,,...{{{,,.{((((.,(({(({,,,,.....{{{{{{,,..,,,......}})))},....{((((......))))}..,,(((|...,,,,,))))}.)))}})))..,((((((((((..(((((((((((((....))))))))).))))....{.((((...)))).})))).)))))))))))(((..((((((....))))))..)))((((((((.........)))))))).((((.(((((((((((..,,(((.,.((((.....))))....))}.,}.))).....((((((.(((.{(..((({..(((..........)))..))))......)).))).)))))).)))))))).))))...)))))})))...)))))))))).|||,,}},}}||||}}.....||..,|}|||},,,}}}}.}}}))))))..})))).))))),})))).)},{{,,{{,,}...,,.........)))))))))..))))).))}|((((.((((((..(,.(((.((((((..(((((.(((.{{,........,}|.(((((....))))),)))..))).))..)))))))))..),.))))))))))))))))))))).)))))..||,,.(((((((.{....,.}))))))|,||||...{||||,}}}}}}.))},),,||||{{{{{.({((((((,,{(.(((.......((((.(({{|||...,.,}|||}}.,,,.}||}||||.|||}}}}}).{(((((({{{..(((({{{({((((((({,........(((.(((.(((((..,((,....}}))))))))..))}.......{{{(((((({.{{((,(((((.({(((({{((,...{((....))}..{{{....))}....{{{{||,|||{|||||{|.{{|{{(((..{({{(((((((((({.(((,.((,(({,,.,)},.}}..)}}.),...|{{(((......))).))).))))))))))).,}.))))).....,,,.,...{{{{{|..,)}))))|||{|,.....{((((.....))))}..,)))}||||}}}|,,|{{....}}}|,,...,..,}}.,,||||||.||||.,,,,,|||}}}|}}}....))}}}.}}}))},,......}||}}}},.,.})))...((((........)))){{,{..{{,..|||,{}|||.}}}}}}}}}}..........{({{{{{|{{{{{....((({{({.{((.(((((.......))))),)||,||{{.{{||,||},|{|||||,,||||||,||,.,||,||||||,,|{||.......,,,|||,}}||}}.}|,|||.,}}})),,,)))))))}}.)))),..))),,,))),,,),}}))))..)),}))))}))}||||||}}}}..,((({.{(((,,,.}}}}.}|||,......,}})}},}}}|||....||||||...|}||||}|||}}}|{|}||||.......}}||..||)))}...}})}|||}}.)),}}}}...},},.,},.,,)}|..}}}}|}...||,...||)},,}}}..,,||{||||{||....},.||||||}||({{........,.)).,)}}.)))))}..)))))))))))))))..))))))
Back