Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0037700
Sequence Length
375 nt
GC Content
0.5067
ACCCUGCAGAAACAACAAAAUACCUGUCACCAGCAACUGGAGGAUCUUUGCAGUUGGGUAGGACAGGCAGAAAGAGCACUGGCAGGCCACCAAGGCAGAACCACCCAGCAGGAUCUCUCUGCUUUGCAGAAGAACCAAAGUGACUUGAAGAGUAAAGCAGCAAAGGAACUGGCAGAGAACAAGAAGAAGAUCGAUGCUCUCCUGGAUUGGGUAACUUCAGUAGGAUCAUCUGGUGGACAGCUGCUGACCAACCUUCCAGGAAUGGAGCAGCUCUCGGGAGCUAGCUUGGAGAAAGGAGCCUUGGACACCACUGAUGGUUACAUGGGGGUGAAUCAAGCCCCAGAGAAACUGGACAAGCAAUGUGAGAUGAUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-104.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -112.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 63.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((...............(((((((((..((((((.((.....)).)))))))))..))))))(((........))))))))...(((((((........((((((.((((((((((((.......((..((...((..(((........)))..))...))..))))))))))..........))))..)))).(((((((..((((....(((((((......(((.....))))))))))...)))))))))))...(((((((((....))))).))))))........))))))).((((.((.(((....))).)))))).........((((.....))))(((.....)))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((...............((((((,{{..((((((.((,...,)).))))))}}}..)))))){{{........))})))))...(((((((....,,.,({(((,.((((((((((((((((...{{..((...((..(((........))),.)}...))..)),))))))..}.,},.}.,))))..}|||{(((((((..((((....(((((((..,,.,{,,..,}.,,,)))))))...)))))))))))...||||(((((....))))).)))}))........))))))).((((.((.(((....))).)))))).........((((.....)))),{,.....,}}............
Back