Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0040200
Sequence Length
2649 nt
GC Content
0.4847
AGUAAAGCAGCAAAGGAACUGGCAGAGAACAAGAAGAAGAUCGAUGCUCUCCUGGAUUGGGUAACUUCAGUAGGAUCAUCUGGUGGACAGCUGCUGACCAACCUUCCAGGAAUGGAGCAGCUCUCGGGAGCUAGCUUGGAGAAAGGAGCCUUGGACACCACUGAUGGUUACAUGGGGGUGAAUCAAGCCCCAGAGAAACUGGACAAGCAAUGUGAGAUGAUGAAGGCCCGUCACCAAGAAUUGCUGUCCCAGCAGCAAAAUUUCAUUCUGGCCACCCAGUCAGCUCAGGCCUUCUUGGAUCAGCAUGGCCACAAUCUCACACCUGAGGAGCAACAGAUGCUGCAACAGAAGCUGGGAGAGCUAAAGGAACAAUACUCUACUUCCCUGGCCCAAUCAGAGGCAGAACUGAAGCAGGUGCAGACACUUCAGGAUGAGUUGCAGAAAUUUCUGCAGGAUCAUAAAGAGUUUGAAAGCUGGUUGGAACGAUCCGAGAAAGAGCUGGAGAACAUGCAUAAGGGAGGCAGCAGCCCCGAGACCCUUCCCUCCCUGCUAAAGCGGCAAGGAAGCUUCUCAGAGGAUGUCAUUUCCCACAAAGGAGACUUGAGAUUUGUGACUAUCUCAGGACAGAAAGUCUUGGACAUGGAAAACAGUUUUAAGGAAGGCAAAGAACCAUCAGAAAUUGGAAACUUAGUAAAGGACAAGUUGAAGGAUGCAACAGAAAGAUACACUGCUCUCCACUCAAAGUGUACACGAUUAGGAUCUCACCUGAAUAUGCUGUUAGGCCAGUAUCAUCAAUUCCAAAACAGUGCUGACAGCCUGCAGGCCUGGAUGCAGGCUUGUGAGGCCAACGUGGAGAAGCUCCUCUCAGAUACUGUUGCCUCUGACCCUGGAGUUCUCCAGGAGCAGCUUGCAACAACAAAGCAGUUGCAGGAGGAAUUGGCUGAGCACCAAGUACCUGUGGAAAAACUCCAAAAAGUAGCUCGUGACAUAAUGGAAAUUGAAGGGGAGCCAGCCCCAGACCACAGGCAUGUUCAAGAAACUACAGAUUCCAUACUCAGCCACUUCCAAAGCCUCUCCUAUAGCCUGGCUGAGCGAUCUUCUCUGCUGCAGAAAGCAAUUGCCCAAUCUCAGAGUGUCCAGGAAAGCCUGGAGAGCCUGUUGCAGUCUAUUGGGGAAGUUGAACAAAACCUGGAAGGGAAGCAGGUGUCAUCACUCUCAUCAGGAGUCAUCCAGGAAGCCUUAGCCACAAAUAUGAAAUUGAAGCAGGACAUUGCUCGGCAAAAGAGCAGCUUGGAGGCCACCCGUGAGAUGGUGACCCGAUUCAUGGAGACAGCAGACAGUACUACAGCAGCAGUGCUGCAGGGCAAACUGGCAGAGGUGAGCCAGCGGUUCGAACAGCUCUGUCUACAGCAGCAAGAAAAGGAGAGCUCCCUAAAGAAGCUUCUACCCCAGGCAGAGAUGUUUGAACACCUCUCUGGUAAGCUGCAGCAGUUCAUGGAAAACAAAAGUCGGAUGCUGGCCUCUGGAAAUCAGCCAGAUCAAGAUAUUACACAUUUCUUCCAACAGAUCCAGGAGCUCAAUUUGGAAAUGGAAGACCAACAGGAGAACCUAGAUACUCUUGAGCACCUGGUCACUGAACUGAGCUCUUGUGGCUUUGCGCUGGACUUGUGCCAGCAUCAGGACAGGGUACAGAAUCUAAGAAAAGACUUCACAGAGCUACAGAAGACAGUUAAAGAGAGAGAGAAAGAUGCAUCAUCUUGCCAGGAACAGUUGGAUGAAUUCCGGAAGCUGGUCAGGACCUUCCAGAAAUGGUUGAAAGAAACUGAAGGGAGUAUUCCACCUACGGAAACUUCUAUGAGUGCUAAAGAGUUAGAAAAGCAGAUUGAACACCUGAAGAGUCUACUAGAUGACUGGGCAAGUAAGGGAACUCUGGUGGAAGAAAUCAAUUGCAAAGGUACUUCUUUAGAAAAUCUCAUCAUGGAAAUCACAGCACCUGAUUCCCAAGGCAAGACAGGUUCCAUACUGCCCUCUGUAGGAAGCUCUGUAGGCAGUGUAAACGGAUACCACACCUGCAAAGAUCUGACGGAGAUCCAGUGUGACAUGUCAGAUGUAAACUUGAAGUAUGAGAAACUAGGGGGAGUACUUCAUGAACGCCAGGAAAGCCUUCAGGCUAUCCUCAACAGAAUGGAGGAGGUUCACAAGGAGGCAAACUCUGUGCUGCAGUGGCUGGAAUCAAAAGAGGAAGUCCUGAAAUCCAUGGAUGCCAUGUCAUCUCCAACCAAGACAGAAACAGUGAAAGCCCAAGCUGAAUCUAACAAGGCCUUCCUGGCUGAGUUGGAACAGAAUUCUCCAAAAAUUCAAAAAGUAAAGGAAGCCCUGGCUGGAUUACUGGUGACAUAUCCCAACUCACAGGAAGCAGAAAAUUGGAAGAAAAUUCAGGAAGAACUCAAUUCCCGAUGGGAAAGGGCCACUGAGGUUACUGUGGCUCGGCAAAGGCAGCUAGAGGAAUCUGCAAGUCAUCUGGCCUGCUUCCAGGCUGCAGAAUCCCAGCUCCGGCCGUGGCUGAUGGAGAAAGAACUGAUGAUGGGAGUGCUGGGGCCCCUGUCUAUUGACCCCAACAUGUUGAAUGCACAAAAGCAACAGGUCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-832.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -879.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 698.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((........)))(((..((.(........).))..)))..(((((((..((((....(((((((......(((.....))))))))))...))))))))))).(.(((((((((....))))).)))).).....((.((.((((.((((.((.(((....))).))))))..)))))).)).......((((((.((((((......(((((......)))))......))))))(((((((((.....((((((((((..(...(((.((((((..(((((((((((((((((((........(((((....)))))........))))).........((((((.(((.((.((........)).)).)))))))))((((((((...((((.((((((...((....)).)))))).((((.(((((((....)))))))..))))......))))....))))))))...)))))))))).(((((((.((...((((....((((((((..(((..((((..(((((....((((....))))...)))))..))))...(((((.(.(((((......)))))((((((((........)))))))).......(((((((...((((...(((((((..((((..((.....(((........)))...((((((.....(((..((((.(((.(((..............)))..)))..))))..))).....)))))).((((.(((......((((((.((((((((((.....(((((....(.(((((.((((..(((((((((....)))))))))(((((...(.(((((((.((((..(((((..(....)..)))))....))))))))))).).....((((((((.........)))))))).((((.(((((((((((....(((...((((.....))))....)))....))).....((((((.(((.((..((((..(((..........)))..))))......)).))).)))))).)))))))).))))...)))))............((((.((..((.((((((((((.....))..((((((.....(((..(.((((((....)))))).)..)))((((.((((((((((.............(((((.........))))).((((((.((((((..(..(((.((((((..(((((.(((.(((........))).(((((....))))).)))..))).))..)))))))))..)..))))))))))))))))))......)))).)))).(((((((........)))))))..))))))...)))))))).)))))))).(((((((((.((((((((..((.(((......(((.......)))......))).)).....)))))))).)))))))))(((.....)))..))))))))).)...)))))...........))))))))))(((((.......)))))..((((...........))))....(((..(((((.((((((.........((....((....))....)).........)))))).)))))...)))..(((((((((.((((((.(((.(((..((.(((....))).))..))).))).))..(((......)))..)))))))))).)))..)))))).....)).).))))((((((...)))))).((((......)))).))..)))).))))))).(((((((.((((.....(((((...((..((((..((((((.((((......))))))))))(((((..((((((((.((.....(((((((...((((...(((((((..((..((......))..))..)).))))))))).....))))...))).....)).)))))))).....)))))..(((.(((((.......))))).))).(((..((((.((..(((((((..((((((.(((..((.((((((..(((((......)).))).)))))).)).))).))))))...))))))))).))))...........((((((((...............)))))))).....)))((((.((((....)))).))))...(((.((((((..(.(((.....))).)...)))))).)))))))..))..))))).....)))))))))))....(((((...))))).....)))).))))))).....(((((...((((...((((((((..(((...(((((((..((((((((........((.(((..((((((....((..(((....))).))))))))..))).))......))))))))))))))).......)))..)))...)))))...........(((((...))))).)))))))))((((..((.(((((..((....))))))).))..))))....).))))))))))))))))....))))...))))))))).))))..))))))))).)..)))).))).))).....)))))))))....(((....))).......(((((..(......)..))))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.({......||...{{,.{{((((..({.{.......,|,||,.}||(((((((((,,((((....((({(((.....,|||.}}|,||.|||||}}...}|||||||||,.,|}|||(((((,,.,|}|||.|(((,,.....{|,||((({(.((((.((,(((,,,.}}|,|||}|,...,,),))))},.,...||((((,,(((((.,..{.(((((......))))),),.,.})))))||}},,}||||,..........((((....))))(((((.((((({(((((((((({({{(,,......,((({....|)}}}{{{{....,)))).,....,..((((((.(((.((.((........)).)),))}))))))((((((((...((({.((((((..,((....}).)))))).((((.(((((((....)))))))..)))).....,})))....))))))))...)))))))))}.|.((((.....)}.}},,.,(((((((.(((.(({.((((..(((((,{..((((....))))..,)))))..)))).).)).)))..{((((......))))}(((((((({{((..((((.{((((((.....))))))),.))))...)))))))))))..((((,.....(((........)))...|||.,,...{{{,,.{((((.,(({(({,,,,.....{{{{{{,,..,,,......}})))},....{((((......))))}..,,(((|...,,,,,))))}.)))}})))..,((((((((((..(((((((((((((....))))))))).))))....{.((((...)))).})))).)))))))))))(((..((((((....))))))..)))((((((((.........)))))))).((((.(((((((((((..,,(((.,.((((.....))))....))}.,}.))).....((((((.(((.{(..((({..(((..........)))..))))......)).))).)))))).)))))))).))))...)))))})})...)))))))))},||||}|}}|}||||||.....||..,|}||,|,,}}|||.,|,|{{(({....)))})),)|||||||,|,.,,,.{{{{{{..{{,,......,||||||,}},.,,}}|{||{((,(({((((((,,{..(((.((((((..(((((.(((.({,........,,|.{((({....}))))|)}}..}}).))..))))))}}}..},.||||}}|||}}}}}}}|||||{|||},,,,,...(((((((.{....,.))))))){{((((...(((((........)))))..(((((((((.((((((((..,{.{{{......,(({{,,,{|},,...,.,))).)).,,..)))))))).))))))))).((((((((((..(((((((({((((((({.........(((.(((.(((((...{{.....}}))))))))..))).......((((((((((.(((({{((((.{.((((((((....{((....)))..{({....)))....((((({.((((({,((((.((((((((..{({{(((((((((({.(((,.((.(({,,.,)},.}}..)}).),...{{{(((......))).))).))))))))))).,}.))))).............((((((...)))))){((((......(((((.....))))}...))))})})))}}..{{{....}}|,,......,,}}.,.((((((.((((......))))))))))....))))).})))))........)))))))).}.)))}...((((........)))),..,.......,},..)))).))))))))))..........(((((((((((((....(((((({.,((,(((((.......)))))})||{{(((.((((.((..(((((((..((((((.(((..((.((((((..(((({......))},}}.)))))).)).))).))))))...))))))))).))))...)))...}}}}..}.))))))..))))))))))))))))))))))..{(((,.,((({{{.}|}}.|||{(.......,,|||}}}}||,....}}}}})...})))}))))))))).)))))}......,))))..}|||}}...,,|||}}}}.}}}}||||||||||......{{{{.,.(((({...((((...((((((((..({{.,,(((((((..((((((((........((.(((..(((((,...,((..(((....))).))))))))..))).))....,.))))))))))))))).......)))..))}...))))),,.....,,..(((((...))))).)))))}))}...},.})))||||{(((...((.((((.{.(((.(((((,.,....,,|(((((....))))))))))).)))))))))).)))).)))),,)))))}..,..})}})}))))}}})),))),})},}}}}}...,,.)))}}.,.|||||..{|{......)))})))}))).,
Back