Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0044600

Sequence Length

423 nt

GC Content

0.4610

AGUCUACUAGAUGACUGGGCAAGUAAGGGAACUCUGGUGGAAGAAAUCAAUUGCAAAGGUACUUCUUUAGAAAAUCUCAUCAUGGAAAUCACAGCACCUGAUUCCCAAGGCAAGACAGGUUCCAUACUGCCCUCUGUAGGAAGCUCUGUAGGCAGUGUAAACGGAUACCACACCUGCAAAGAUCUGACGGAGAUCCAGUGUGACAUGUCAGAUGUAAACUUGAAGUAUGAGAAACUAGGGGGAGUACUUCAUGAACGCCAGGAAAGCCUUCAGGCUAUCCUCAACAGAAUGGAGGAGGUUCACAAGGAGGCAAACUCUGUGCUGCAGUGGCUGGAAUCAAAAGAGGAAGUCCUGAAAUCCAUGGAUGCCAUGUCAUCUCCAACCAAGACAGAAACAGUGAAAGCCCAAGCUGAAUCUAACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-106.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -114.81

Frequency: 0.0000

Diversity: 121.02

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((...(((((((..((((.((((..((..(((......)))..))..))))..((((((((((((((....(((((((..((((.(((.......)))))))(((((((.((((.((..(((((((..((((((.(((..((.((((((..(((((......)).))).)))))).)).))).))))))...))))))))).))))...)))...))))..).))))))..))).)))))))))))((((......((((.((((....)))).))))...(((.((((((..(.(((.....))).)...)))))).)))(((.((((....((....))...))))))).....))))..))))..))))))).......))))(((..((((..........))))..)))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((({...(((((((..((({.((((.,((..(((,,,,..}}}..}}..}}}}..{(((((((((((((....(((((({.,((,(((((.......)))))})||{{(((.((((.((..(((((((..((((((.(((..((.((((((..((((,......))},}}.)))))).)).))).))))))...))))))))).))))...)))...}}}}..}.))))))..))))))))))))))},,||..,}}||||,.,{{{|{{.||||.|((((..{,,.,{{|||}|{|{{(,....|}|,}...}})}||.|||{{{,({|(|,,.,,....}}||.}}}))))....,)}})}.))))..)))))))....,..}}})||,..|{{{....,,....))))..)))......