Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0045300

Sequence Length

1131 nt

GC Content

0.4934

GUUCCAUACUGCCCUCUGUAGGAAGCUCUGUAGGCAGUGUAAACGGAUACCACACCUGCAAAGAUCUGACGGAGAUCCAGUGUGACAUGUCAGAUGUAAACUUGAAGUAUGAGAAACUAGGGGGAGUACUUCAUGAACGCCAGGAAAGCCUUCAGGCUAUCCUCAACAGAAUGGAGGAGGUUCACAAGGAGGCAAACUCUGUGCUGCAGUGGCUGGAAUCAAAAGAGGAAGUCCUGAAAUCCAUGGAUGCCAUGUCAUCUCCAACCAAGACAGAAACAGUGAAAGCCCAAGCUGAAUCUAACAAGGCCUUCCUGGCUGAGUUGGAACAGAAUUCUCCAAAAAUUCAAAAAGUAAAGGAAGCCCUGGCUGGAUUACUGGUGACAUAUCCCAACUCACAGGAAGCAGAAAAUUGGAAGAAAAUUCAGGAAGAACUCAAUUCCCGAUGGGAAAGGGCCACUGAGGUUACUGUGGCUCGGCAAAGGCAGCUAGAGGAAUCUGCAAGUCAUCUGGCCUGCUUCCAGGCUGCAGAAUCCCAGCUCCGGCCGUGGCUGAUGGAGAAAGAACUGAUGAUGGGAGUGCUGGGGCCCCUGUCUAUUGACCCCAACAUGUUGAAUGCACAAAAGCAACAGGUCCAGUUUAUGCUAAAGGAAUUUGAAGCACGCAGGCAACAGCAUGAGCAACUGAAUGAGGCAGCUCAGGGCAUCCUAACAGGCCCUGGAGAUGUCUCUCUGUCCACCAGCCAAGUACAGAAAGAACUCCAGAGCAUCAAUCAGAAAUGGGUUGAGCUGACUGACAAACUCAACUCCCGUUCCAGCCAAAUUGACCAAGCUAUUGUUAAGAGCACCCAGUACCAGGAACUGCUCCAGGACUUAUCAGAGAAGGUGAGGGCAGUUGGACAACGGCUGAGUGUCCAGUCAGCUAUCAGCACCCAACCAGAGGCUGUAAAGCAGCAAUUGGAAGAGACCAGUGAAAUUCGAUCUGACUUGGAGCAGUUAGACCACGAGGUUAAGGAGGCUCAGACACUGUGCGAUGAACUCUCAGUGCUCAUUGGUGAGCAGUACCUCAAGGAUGAACUGAAGAAGCGUUUGGAGACAGUUGCCCUGCCUCUCCAAGGUUUAGAAGACCUUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-350.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -372.13

Frequency: 0.0000

Diversity: 238.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((((((((..(.(.((....))).)..))))))))....)))......))(((((..........(((((..(((.(((((.((((((((((.....((((((((...............))))))))....((((((...(((((((.((((.(((((.........))))))))).....((((.....))))((((((((((((((((..((((..(((....(((((((...(((((...)))))...(((((((((.....(((..((((..........))))..))).....)).(((((((..((((((((........((.(((..((((((....((..(((....))).))))))))..))).))......))))))))))))))).......)))).)))...)))))))....)))..(((((...))))).(((((((..((....)))))))))(((...((.((((.(.(((.((((((.........(((((....))))))))))).)))))))))).))).((((((((((........((((((((((((((..(((((...(........).))))).(((((((..(((......((..((((((((((....)))...)).)))))..))......))).)))))))...........((((((.((((((((..........))))).))).))))))(((((.(.........).)))))....)))))....)))).)))))....((((((((.(........).))))))))))))..))))))..)))))).)))))))))....)))))((.......))((((((((((((.....(((((((((((..(((..(((((.....((((((........)))))).))))).))).)))....(((((...))))).(((((......)))))....)))..))))))))))))))))).((((....))))..)))))))......))).)))......(((((((..(((((..((((......))))..))))))))).))).))))))...))))))))).)))..))))).((((((...)))))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((((((((..(.(.((....}}},)..))))))))....)))......))(((({.{,(((({{{{,,|,{,,,,.},}||.|}}}}})),}...{,((({(({{......,,...{.,,||}|||||,,,,((({(({,.(((({{{.||||.|||{{.......,,}}}}}|||||....((((.....))))((((((((((((((((..((({..(((....(((((((...(((((...)))))...{((((({{{.....(((..((((..........))))..))).....}|.(((((((..((((((((........((.(((..(((((,...,((..(((....))).))))))))..))).))....,.))))))))))))))),......})))},))...)))))))....)))..(((((...))))).(((((((..,,....),)))))))(((...((.((((.(.(((.(((((,........{(((((....))))))))))).)))))))))).))).((((((((((........((((((((((((((.{(((((......,,....).)))),.(((((((..(((......((..((((((((((....)))...)),,))))..))......))).)))))))...........((((((.((((((((..........)))))}})).))))))(((((.,.........).))))).,,.)))))....)))),,))))....((((((((.(........,.))))))))))))..))))))..}))))),}))))))))....)))))((.......))((((((((((((.....(((((,,.((({.{((,.((((({{..,,{,{{,,}}}}}),}),))).)))}).))}.,}|....(((((...))))).(((((......)))))....,}}..))))))))))))))))).((((....))))..}}}}||},...,,}||.}}}.|||,||||||{{||(({,|..||||}..,,,}))},,}}}},,))},.},.}}})}|||||||||},.,.)))..))))}|{(((({...}))))))))))