Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0045800
Sequence Length
2540 nt
GC Content
0.4839
AUCUGACGGAGAUCCAGUGUGACAUGUCAGAUGUAAACUUGAAGUAUGAGAAACUAGGGGGAGUACUUCAUGAACGCCAGGAAAGCCUUCAGGCUAUCCUCAACAGAAUGGAGGAGGUUCACAAGGAGGCAAACUCUGUGCUGCAGUGGCUGGAAUCAAAAGAGGAAGUCCUGAAAUCCAUGGAUGCCAUGUCAUCUCCAACCAAGACAGAAACAGUGAAAGCCCAAGCUGAAUCUAACAAGGCCUUCCUGGCUGAGUUGGAACAGAAUUCUCCAAAAAUUCAAAAAGUAAAGGAAGCCCUGGCUGGAUUACUGGUGACAUAUCCCAACUCACAGGAAGCAGAAAAUUGGAAGAAAAUUCAGGAAGAACUCAAUUCCCGAUGGGAAAGGGCCACUGAGGUUACUGUGGCUCGGCAAAGGCAGCUAGAGGAAUCUGCAAGUCAUCUGGCCUGCUUCCAGGCUGCAGAAUCCCAGCUCCGGCCGUGGCUGAUGGAGAAAGAACUGAUGAUGGGAGUGCUGGGGCCCCUGUCUAUUGACCCCAACAUGUUGAAUGCACAAAAGCAACAGGUCCAGUUUAUGCUAAAGGAAUUUGAAGCACGCAGGCAACAGCAUGAGCAACUGAAUGAGGCAGCUCAGGGCAUCCUAACAGGCCCUGGAGAUGUCUCUCUGUCCACCAGCCAAGUACAGAAAGAACUCCAGAGCAUCAAUCAGAAAUGGGUUGAGCUGACUGACAAACUCAACUCCCGUUCCAGCCAAAUUGACCAAGCUAUUGUUAAGAGCACCCAGUACCAGGAACUGCUCCAGGACUUAUCAGAGAAGGUGAGGGCAGUUGGACAACGGCUGAGUGUCCAGUCAGCUAUCAGCACCCAACCAGAGGCUGUAAAGCAGCAAUUGGAAGAGACCAGUGAAAUUCGAUCUGACUUGGAGCAGUUAGACCACGAGGUUAAGGAGGCUCAGACACUGUGCGAUGAACUCUCAGUGCUCAUUGGUGAGCAGUACCUCAAGGAUGAACUGAAGAAGCGUUUGGAGACAGUUGCCCUGCCUCUCCAAGGUUUAGAAGACCUUGCAGCCGAUCGCAUUAACAGACUCCAGGCAGCUCUUGCCAGCACCCAGCAGUUCCAGCAAAUGUUUGAUGAGUUGAGGACCUGGUUGGAUGAUAAACAAAGCCAGCAAGCAAAAAACUGCCCAAUUUCUGCAAAAUUGGAGCGGCUACAGUCUCAGCUACAGGAGAAUGAAGAGUUUCAGAAAAGUCUUAAUCAACACAGUGGCUCCUAUGAGGUGAUUGUGGCUGAAGGGGAAUCUCUACUUCUUUCUGUACCUCCUGGAGAAGAGAAAAGGACUCUACAAAACCAGUUGGUUGAGCUCAAAAACCAUUGGGAAGAGCUUAGUAAAAAAACUGCAGACAGACAAUCCAGGCUCAAGGAUUGUAUGCAGAAAGCUCAGAAAUAUCAGUGGCAUGUGGAAGACCUUGUGCCAUGGAUAGAAGAUUGUAAAGCUAAGAUGUCUGAGUUGCGAGUCACUCUGGAUCCAGUGCAGCUAGAGUCCAGUCUCCUAAGAUCAAAGGCUAUGCUGAAUGAGGUGGAGAAGCGCCGCUCCCUGCUGGAAAUAUUGAAUAGUGCUGCUGACAUUCUGAUCAAUUCUUCAGAAGCAGAUGAGGAUGGAAUCCGGGAUGAGAAGGCUGGGAUCAACCAGAACAUGGAUGCUGUUACAGAAGAGCUGCAGGCCAAAACAGGGUCACUCGAAGAAAUGACUCAGAGGCUCAGGGAGUUCCAGGAAAGCUUUAAGAAUAUUGAAAAGAAGGUUGAAGGAGCCAAACACCAACUUGAGAUCUUUGAUGCUCUGGGUUCUCAAGCCUGUAGCAACAAGAACCUGGAGAAGCUAAGAGCUCAACAGGAAGUGCUGCAGGCCCUAGAGCCUCAGGUAGACUAUCUGAGGAACUUUACUCAGGGUCUGGUAGAAGAUGCCCCAGAUGGAUCUGAUGCUUCUCAACUUCUCCACCAAGCUGAGGUCGCCCAGCAAGAGUUCCUCGAAGUUAAGCAAAGAGUGAACAGUGGUUGUGUGAUGAUGGAAAACAAGCUGGAGGGGAUUGGCCAGUUUCACUGCCGGGUCCGAGAGAUGUUCUCUCAAUUGGCAGACCUGGAUGAUGAGCUAGAUGGCAUGGGUGCUAUUGGCAGAGACACUGAUAGCCUCCAGUCCCAAAUCGAGGAUGUCCGGCUAUUCCUUAACAAAAUUCACGUCCUCAAAUUAGACAUAGAGGCCUCUGAAGCAGAGUGUCGACAUAUGCUAGAAGAAGAGGGGACUCUGGAUUUGUUAGGUCUCAAAAGGGAGCUAGAAGCCCUGAACAAACAGUGUGGCAAACUGACAGAGAGGGGGAAAGCUCGUCAGGAACAGCUGGAACUGACACUAGGCCGUGUAGAGGACUUCUACAGGAAAUUGAAAGGACUCAAUGACGCGACCACAGCAGCAGAGGAGGCAGAGGCCCUCCAGUGGGUAGUGGGGACCGAAGUGGAAAUCAUCAACCAACAAUUAGCAGAUUUUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-808.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -856.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 584.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..((....))(((...((((.....))))..)))((((((((...............))))))))(((((.((((((.((((....)))).))))............))..)))))...(((((....(((((((((((.((((.(.(..((......(((((((((...(((((.(..(((((.((((((.(((((((..((((((.(((((...((((...((((((((..(((...(((((((..((((((((........((.(((..((((((....((..(((....))).))))))))..))).))......))))))))))))))).......)))..)))...)))))...........(((((...))))).)))))))))...)).)))).(((.(((...((.((((.(.(((.((((((.........(((((....))))))))))).))))))))))((((.((((((.(((((((.......(((.((((.((....((((....))))....)))))).)))(((((........(((((.(((((((((((((((((...(...((((.......))))...)))))))))).......((((....))))((((((((((.((((((((((((....)))(((((.(.........).))))).(((((.((((((((((((.......((((((((((((((((....(((((....((((((((((....(((((.((....)))))))(((((.((.......))...)))))..(..((((((......))))))..).))))))..)))).)))))...))))))))..)))..))))).......(((((...))))).(((((......))))).......(((((.(.((((..(((((...((..(((((.......(((((..((.((.(((.(((....))).))).)).)).)))))...)))))..))...)))))..(((((.(((((((.......((((((((((.((((((((...))))))))..((.....))...........((..(((((((((..(((((((((((((((((((((.........((((((((((..((((((((.............)))))..........(((((((((((.....))))))).))))...))))))))))).))((((....((((.(((....))).))))..(((.((((((.(((.......))).))))))..))).((.(..((((((((((.(((.(((...(((.((...((((...((((((((...((((....))))((((((.....((...))...))))))..........(((((.....(((((((........))))))).)))))..((((((((..((((.(((((((..((....))..))))))).)))).....................))))))))((..(.((((........))))).))))))))))..))))......))..)))...))).))).))))))))))..).)).)))).))))))).............))))))).(((((((.((...((((((........))))))..))...)))))))......((((......)))).....)).)))))......))))))))).))........((((((..........))))))))))))..))))..)))))))...))))).................((((.....)))).....))))..).))))).)))))))))))))))))...((((((((((.......((((..((.(((...)))))..))))...))))))))))..((((((((((((((...)))))))))..)))))..))))))))).)))..)))))))....)))))))).))))).)))))))))))).).))))).))))))).)))....(((((((...((...))...))).))))..)))))).).)))))).................(((((.(.((((...)))).).)))))((((((...))))))...)))))..).)))))......(((.(((((.((((.((((((((........)))))))).))))((((........)))).(((((((.(((((.....(((((((.((((((...((((.((((..((((((((...))))).)))....)))))))).......))))))..))))))).((((.((((....)))).))))..((((((......)))...)))...........((.(((.....))).))))))).))))))).(((....)))))))).)))))))))))).......(((((......)))))))..).))))).))))).......))))))..))))).((.(((.((((...((.....))...))))..))).))......)))))(....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({((,...,|,.,,..,||,|}}}}}))}|..,|.((((((((......,........)))))))),|,{{,{{{{{{.,((({,,.}|}}.||||(.........}}))},)}}},...|||||}...(((({{(((((.{({({(,{..,,....(((....(((((({...(((((...)))))...{{(((({,,..,..(((..((((..........))))..))}..,..,|.(((((((..((((((((........((.(((..(((((,...,((..(((....))).))))))))..))).))....,.))))))))))))))),......)))),,))...)))))))....)))..{((((...))))}.{((((((.,,{....}|))))))),||....))}||}|||},,||||||..(((((((((({..{.((((((((((..{{{{((,,(({(((((.((((({.(((((((.......(((.((((.((....((((....))))....)))))).)))(((({........(((((.(((((((((((((((((.......,,{{..,,...,,,}}...)))))))))..,,...{(((....))))((((((((({.((((((((((((....)))(((((.,.........).))))).(((((.((((((((((((..,,,..((((((((((((((((((..{((((....((((((((((,...{(({{{,{.,..,,))},,(((((.((.......))...)))))..,..((((((......)))))),,).)))))}..)))).))))))),}))))))),.,))..})))}.{{{{..(((((...))))).,||||......}|}||.....,|{,{{{|{{({{{,,{||||,|,{{..{{|||,..,,,,(({{,..{({((,{{,.(((.,,,|||{|}}{||,|}.||||}...,}))),.}),},)))))..||{{{,||{{{{{,|,,,..{{{{||||||.{(((((({...}))))))|,,((,..,,,,..||||,|.,|{{||((((({({{|,(((((({((((((((((((((.........{{((((((({,,(((((({{.,......,..,,))))}..........(((((((((((.....))))))).))))...||}}))))))).}}({{(..,.((((.(((....))).))))..{({.((((((.((({....},))).))))))..))}.((.(..((((((((((.(((.(((...(((.((...((((...((((((((...,{((....))||((((((.....{{...})...)))))),.........(((((.....(((((((........))))))).)))))..{(((((({..((((.(((((((,.((....)).,))))))).)))).............,.......)))))))}{{..{.{{{{,,,.....))))).))))))))))..))))......))..)))...))).))).))))))))))..).)).)))}.))))))).............))))))).((((((({({...((((((........))))))..},,},}))))))......((((......))))....,)),})))),,,..,)}))))))).||,,......((((({.{,...,...))))))}))))},,}})}.|}}}}}},...})|||................,((((...,.)))}...,.,)}},}),)),)),)))))))))))))))))...((((((((((.,.....((((..(,{(((...)))))..))))..,))))))))))..{(((((((((((((...)))))))))..))))}..))))))))).}))..)))))))....)))))))).))))).))}})))))))).}.})))).)|||{(.((((.,..(((((((...{{...}}...))).))))..}.)))).)})}}..,{.....},,)))))})}|||||(({{(((...}))))),},}}}((((((...)))))).....)))).)))))).,..}.)))))))))).((((.((((((((........)))))))).)))){||||....,}.)))}.(((((((.((((({((({(((((((.((((((...((((.((((..((((((((...))))).)))....)))))))}.......))))))..))))))))))||.{{{{....}}||{||....,((((,......|||{..,,,..}}}}.....,|}|||...,,))).}}))))).))))))).||,,{,,|.||{(,((({(({..,|})}}}},,..{{{|{..,..,))}}),},.).,))}}.))}})|..{{{{{{....)}))))).,||{||.{{{{...((....}))...))}}..,))..,.....})))))|,...,
Back