Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0046500

Sequence Length

696 nt

GC Content

0.5144

AUUCCCGAUGGGAAAGGGCCACUGAGGUUACUGUGGCUCGGCAAAGGCAGCUAGAGGAAUCUGCAAGUCAUCUGGCCUGCUUCCAGGCUGCAGAAUCCCAGCUCCGGCCGUGGCUGAUGGAGAAAGAACUGAUGAUGGGAGUGCUGGGGCCCCUGUCUAUUGACCCCAACAUGUUGAAUGCACAAAAGCAACAGGUCCAGUUUAUGCUAAAGGAAUUUGAAGCACGCAGGCAACAGCAUGAGCAACUGAAUGAGGCAGCUCAGGGCAUCCUAACAGGCCCUGGAGAUGUCUCUCUGUCCACCAGCCAAGUACAGAAAGAACUCCAGAGCAUCAAUCAGAAAUGGGUUGAGCUGACUGACAAACUCAACUCCCGUUCCAGCCAAAUUGACCAAGCUAUUGUUAAGAGCACCCAGUACCAGGAACUGCUCCAGGACUUAUCAGAGAAGGUGAGGGCAGUUGGACAACGGCUGAGUGUCCAGUCAGCUAUCAGCACCCAACCAGAGGCUGUAAAGCAGCAAUUGGAAGAGACCAGUGAAAUUCGAUCUGACUUGGAGCAGUUAGACCACGAGGUUAAGGAGGCUCAGACACUGUGCGAUGAACUCUCAGUGCUCAUUGGUGAGCAGUACCUCAAGGAUGAACUGAAGAAGCGUUUGGAGACAGUUGCCCUGCCUCUCCAAGGUUUAGAAGACCUUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-223.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -237.24

Frequency: 0.0000

Diversity: 185.60

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((...))))).(((((((..((....)))))))))((((..(((((((...(((.((((((.........(((((....))))))))))).)))..((....))..((((((.((((...(((........((((.((....((((....))))....)))))).(((((((..(((......((..((((((((((....)))...)).)))))..))......))).)))))))...........((((((.((((((((..........))))).))).))))))))).)))).)))))).............(((((((((.((..((((...((((((((((((((((....(((((....((((((((((....(((((.((....)))))))(((((.((.......))...)))))..(..((((((......))))))..).))))))..)))).)))))...))))))))..)))..))))).......(((((...))))).(((((......))))).........(((((((......)))))))((..(((((.......(((((..((.((.(((.(((....))).))).)).)).)))))...)))))..)).....)))).)).)).)))))))..))))))).)))))((.((((((((...)))))))).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((...))))).(((((((..,,....},)))))))((((..(((((((.{.(((.(((((,........{(((((....))))))))))).)))}.((,,..}},.((((((.((((.,..,,.,,.,{{,((((,((.,,,((({....}}},...,}))))}.{{(((((..(((......((..((((((((((....)))...)),,))))..))......))).))))))).,,........((((((.((((((((..........)))))}})).))))))||}.)))).)))))}.,..,.,......(((((({((.{(..{{{{...{((((((((((((((({{..,((({....((({({{{{(|...{{{{{{,,,{..,||||,.(((({.((.......}}...}}})),.{,.{{{{((.,....)))}))||}.}})))}..}))).})))))),})))))))}.})),,}))),.{{{,..(((((...))))).,||||......||}}|....,||,.|{{|{{|,,,..,))))}}}{|..{{|||...,,..||||{,.{{.((.{{{.{{,...,|)),})}{||,|,.||||}...,}))),.,),},,,)))).)).)).)))))))..))))))).)))))((.((((((({...}))))))).))