Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0049500
Sequence Length
1521 nt
GC Content
0.4793
AUGUUUCAGAAAGAACAAGUGGAUCCUCUUCAGAUGAAAUUGCAGCAGGUGAAUGGACUUGGCCAGGGAUUAAUUCAGAGUGCAGGAAAAGACUGUGAUGUACAGGGUUUAGAACAUGACAUGGAAGAGAUCAAUGCUCGAUGGAAUACAUUGAAUAAAAAGGUCGCACAAAGAAUUGCACAGCUACAGGAAGCUUUGUUGCAUUGUGGGAAGUUUCAAGAUGCCUUGGAGCCAUUGCUCAGCUGGUUGGCAGAUACCGAGGAGCUCAUAGCCAAUCAGAAACCUCCAUCUGCUGAGUAUAAAGUGGUGAAAGCACAGAUCCAAGAACAGAAGUUGCUCCAGCGGCUCCUAGAUGAUCGAAAGGCCACAGUAGACAUGCUUCAAGCAGAAGGAGGCAGAAUAGCCCAGUCAGCAGAGCUGGCUGAUAGAGAGAAAAUCACUGGACAGCUGGAGAGUCUUGAAAGUAGAUGGACUGAACUACUCAGUAAGGCAGCAGCCAGGCAAAAACAGCUGGAAGACAUCCUGGUUCUGGCCAAACAGUUCCAUGAGACAGCUGAGCCUAUUUCUGACUUCUUAUCUGUCACAGAGAAAAAGCUUGCUAACUCAGAACCUGUUGGCACUCAGACUGCCAAAAUACAGCAGCAGAUCAUUCGGCACAAGGCUCUGGAAGAAGACAUAGAAAACCAUGCAACAGAUGUGCACCAGGCAGUCAAAAUUGGGCAGUCCCUCUCCUCCCUGACAUCUCCUGCAGAACAGGGUGUGCUGUCAGAAAAGAUAGACUCAUUGCAGGCCCGAUACAGUGAAAUUCAAGACCGCUGUUGUCGGAAGGCAGCCCUACUUGACCAAGCUCUGUCUAAUGCUAGGCUGUUUGGGGAGGAUGAGGUGGAGGUGCUCAACUGGCUGGCUGAGGUUGAGGACAAGCUCAGUUCAGUGUUCGUAAAGGAUUUCAAACAGGAUGUCCUGCACAGGCAGCAUGCUGACCACCUGGCUUUAAAUGAAGAAAUUGUUAAUAGAAAGAAGAAUGUAGAUCAAGCUAUUAAAAAUGGUCAGGCUCUUCUAAAACAAACCACAGGUGAGGAGGUGUUACUUAUCCAGGAAAAACUAGAUGGUAUAAAGACUCGUUACGCAGACAUCACAGUUACUAGCUCCAAGGCCCUCAGAACUUUAGAGCAAGCCCGGCAGCUGGCCACCAAGUUCCAGUCUACUUAUGAGGAACUGACCGGGUGGCUGAGGGAGGUGGAGGAGGAGCUGGCAACCAGUGGAGGACAGUCUCCCACAGGGGAACAGAUACCCCAGUUUCAGCAGAGACAGAAGGAAUUAAAGAAGGAGGUCAUGGAGCACAGGCUGGUGUUGGACACAGUGAAUGAGGUGAGCCGUGCUCUCUUAGAGCUGGUGCCCUGGAGAGCCAGAGAAGGGCUGGAUAAACUUGUGUCCGAUGCUAACGAGCAGUACAAACUAGUCAGUGACACUAUUGGACAAAGGGUGGAUGAAAUUGAUGCUGCUAUUCAGAGAUCACAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-462.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -492.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 420.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((......)))))..((((((.((((((..((((.......(((((......)))))((((((((.....))...((((((((..(..((((..((.......(((((((((((((((.((.....)).))).((((((.....)))))).......(((.(((((...........((((......))))(((((((((((((.....((((.(((.((((((((((....))))..(((((((((..((...(((...))))).)))))))))...(((((.((((((((((((...(((((.........((((.......((.((((((....)))))).))....)))).....))))).......))))))..)))))).))))).......(((((((((((...))))))))............((.((((((((.(((.(((((..((((........(((((.....)))))..(((....)))((((.....((((((.......((.(((..(((......)))..))).))..)))))).)))).)))).))))).))).))))).))).)).......(((((((.........)))))))....((((((............)))).))....))).))))))))).))))....)))).......))))))))).))))))))...((((((...(((((((.((((((((((((((.......(((((((....((((...(((((......))))))))).))))))).(((((((((((...........))))).)))))).((((((((......(((........)))........)))))))))))))))).)))).))...))))))).))))))((((((.(((....))).))))))))).))))).))))......)).))))..).)))))))).(((((....))).)).))))))))))..))))))..................(((((((((((((..((((.......(((.(((((((((..............((((.(((....((((.(((.((......)).)))))))......))).))))..........(((((.((..(((((...(((((((.............(((((((((....((...((((........))))....))..))).))))))..)))))))...)))))..)))))))(((.((((((((((....)))))....((((........)))).(((((....)))))...............((((((.(((((..(((..((((((.....)).)))).......)))..))))).))))))...)))))))).((((....))))))))))))).)))..((((.(((((((((...((((..(((....)))..)).)).....)))))))))..)))).))))...))))).)))).))))...))))....)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((......))))).,((((({,((({{,,.(({,.,,{{..(((((......)))))(((((({{.....}}...((((((((..{..((((.,((,......((,.{{{{{{{||,{,,,.,,{,||..||.((((((.....)))))).......{{{,(({{,......,{{,,((((......)))|(((((((((((((.....((((.{((.((((((..(((..(({{,.((((,(((((((...{.(((,.{{{,..}}}}..,|||...(((((.(((((((((({{...(((((.....,.,.((({.,.....{{.((((((....)))))).}}....)))).....)))})..}....,)))}}|.}))))).))))),......}},((((((((...)))))))).....,,.....||.||||{{{|,||{||{{||,,|,,|,||,.,..(((((.....)))))..(((....))){(((.....{{{{{(.......{|,{||,,(((,,,...|||,,|}},||,.}|||}|,||}}.||||,|||,,,},..}}))).))),))....}}}||||{{|,,,,,,..,)))))),}}).}.)))))).....}))))))}||....,,))).)))))))))}))),....)))).......))))))))),))))))||{{.(((({{...{((((((.((((((((((((((,......(((((({....((((..,(((((......))))))))).))))))).(((((((((((...........)))))},))))).{(((((((,{{,..(((........)))....}.,})))))))))))))))).)))).)),..))))))),))})))|(((((.(((....))).)))))}})}}))))).}}}}.,,,.,),.))))..}.)))))))).(((((....))).)).))))))|,,,..,,,,,...{{,{{..,,,..{(({({.,,{.{{{{{..,,,,......)))))}.}})))))),...,,,.,,.,..((((.(((.,.,((({,(((.((......)).))))))}......))).))))||||.||||,{{(({.,{.((((((.(((((((....(((((,..{..,(((,,({{{((,((.,,.((((((..{{.......},)))))),.,.))})))))}.}}}.,{||,.|,.|,.{{(({...||,||||.,,.,,.)))))),}.((((........)))).(((((....)))))........,)))))...)))))).))))))...}|}||((((((((((((((...,....{.((((.{(((((({,((.((....)).)))))))))......}.)))).}.,..))}})))))))))))},.,.|||{({|,...,,.||{{||..{{({,{{........))))}.}}..,}))}))))))}..,,})})))).,..},.
Back