Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0049600
Sequence Length
1641 nt
GC Content
0.4820
AUGUUUCAGAAAGAACAAGUGGAUCCUCUUCAGAUGAAAUUGCAGCAGGUGAAUGGACUUGGCCAGGGAUUAAUUCAGAGUGCAGGAAAAGACUGUGAUGUACAGGGUUUAGAACAUGACAUGGAAGAGAUCAAUGCUCGAUGGAAUACAUUGAAUAAAAAGGUCGCACAAAGAAUUGCACAGCUACAGGAAGCUUUGUUGCAUUGUGGGAAGUUUCAAGAUGCCUUGGAGCCAUUGCUCAGCUGGUUGGCAGAUACCGAGGAGCUCAUAGCCAAUCAGAAACCUCCAUCUGCUGAGUAUAAAGUGGUGAAAGCACAGAUCCAAGAACAGAAGUUGCUCCAGCGGCUCCUAGAUGAUCGAAAGGCCACAGUAGACAUGCUUCAAGCAGAAGGAGGCAGAAUAGCCCAGUCAGCAGAGCUGGCUGAUAGAGAGAAAAUCACUGGACAGCUGGAGAGUCUUGAAAGUAGAUGGACUGAACUACUCAGUAAGGCAGCAGCCAGGCAAAAACAGCUGGAAGACAUCCUGGUUCUGGCCAAACAGUUCCAUGAGACAGCUGAGCCUAUUUCUGACUUCUUAUCUGUCACAGAGAAAAAGCUUGCUAACUCAGAACCUGUUGGCACUCAGACUGCCAAAAUACAGCAGCAGAUCAUUCGGCACAAGGCUCUGGAAGAAGACAUAGAAAACCAUGCAACAGAUGUGCACCAGGCAGUCAAAAUUGGGCAGUCCCUCUCCUCCCUGACAUCUCCUGCAGAACAGGGUGUGCUGUCAGAAAAGAUAGACUCAUUGCAGGCCCGAUACAGUGAAAUUCAAGACCGCUGUUGUCGGAAGGCAGCCCUACUUGACCAAGCUCUGUCUAAUGCUAGGCUGUUUGGGGAGGAUGAGGUGGAGGUGCUCAACUGGCUGGCUGAGGUUGAGGACAAGCUCAGUUCAGUGUUCGUAAAGGAUUUCAAACAGGAUGUCCUGCACAGGCAGCAUGCUGACCACCUGGCUUUAAAUGAAGAAAUUGUUAAUAGAAAGAAGAAUGUAGAUCAAGCUAUUAAAAAUGGUCAGGCUCUUCUAAAACAAACCACAGGUGAGGAGGUGUUACUUAUCCAGGAAAAACUAGAUGGUAUAAAGACUCGUUACGCAGACAUCACAGUUACUAGCUCCAAGGCCCUCAGAACUUUAGAGCAAGCCCGGCAGCUGGCCACCAAGUUCCAGUCUACUUAUGAGGAACUGACCGGGUGGCUGAGGGAGGUGGAGGAGGAGCUGGCAACCAGUGGAGGACAGUCUCCCACAGGGGAACAGAUACCCCAGUUUCAGCAGAGACAGAAGGAAUUAAAGAAGGAGGUCAUGGAGCACAGGCUGGUGUUGGACACAGUGAAUGAGGUGAGCCGUGCUCUCUUAGAGCUGGUGCCCUGGAGAGCCAGAGAAGGGCUGGAUAAACUUGUGUCCGAUGCUAACGAGCAGUACAAACUAGUCAGUGACACUAUUGGACAAAGGGUGGAUGAAAUUGAUGCUGCUAUUCAGAGAUCACAACAGUAUGAGCAAGCUGCCGAUGCAGAACUAGCUUGGGUUGCUGAAACAAAACGGAAACUGAUGGCUCUGGGUCCAAUUCGCCUGGAACAGGACCAGACCACAGCUCAGCUUCAGGUACAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-505.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -536.39
Frequency: 0.0000
Diversity: 462.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(.((((...........)))).).)((((...((((.(((.(((..(((..(((.((((.(((((((...(((((((((((((.......))))...(((...(((((....(((...)))....)))))..)))((((((.....)))))).......(((.(((((...........((((......))))(((((((((((((.....((((.(((.((((((((((....))))..(((((((((..((...(((...))))).)))))))))...(((((.((((((((((((...(((((.........((((.......((.((((((....)))))).))....)))).....))))).......))))))..)))))).))))).......(((((((((((...))))))))............((.((((((((.(((.(((((..((((........(((((.....)))))..(((....)))((((.....((((((.......((.(((..(((......)))..))).))..)))))).)))).)))).))))).))).))))).))).)).......(((((((.........)))))))....((((((............)))).))....))).))))))))).))))....)))).......))))))))).))))))))...((((((...(((((((.((((((((((((((.......(((((((....((((...(((((......))))))))).))))))).(((((((((((...........))))).)))))).((((((((......(((........)))........)))))))))))))))).)))).))...))))))).))))))((((((.(((....))).))))))(((((.(((((..(((((.((......)).)))))(((..((((((.((((((((.(((..((((((............(((((((...((..........))...)))))))...((((..(((((((((...((...((.(((((((.(((....((((.(((.((......)).)))))))......))).))))...(((......))).((((((((..(((.(((.........)))...))).)).))))))(((((.((((((..((.......)))))))).....)))))))).))...))...)))))))))....))))((((.(((...))).)))).((((........)))).(((((....)))))........)))))).))).))))....(((....)))(((((((((((((((........(.((((.((((((((.((.((....)).)))))))))......).)))).)....)).)))))))))))))....((((((........((((((..(((((((........))))).))..))))))))))))......................)))).))))))..))).....((((.......)))).......))))).)))))..))))))))).....)).)))))..)))).)))...))).)))))).))))......))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(.((((...........)))).}.)((((...((((.(((.(((..(((..(((.((((.(((((((,,.{((({{{(({(({.....,,{(|({{{{{.||.||||,....},|}}}}|,|,,,,|,||..|,.((((((.....)))))).......||||{{{{,......{{{{{((((......)))|(((((((((((((.....((((.{((.((((((..(((..{({{,.((((,(((((((...,.(((,.{{{,..|}}},.||||...(((((.(((((({{{{{{...(((((.....|.,.{{({,,,....,{.((((((..,,})}}}}.}}.,..}})).....)))})..,....,)))|||.,))))).))))|,......}}}((((((((...)))))))).....,,.....||.||||{{{|,|||||{{||,,|,,||||},,,,(((((.....)))))..(((....))){(({.....{{{{{(.......{|,{||,,(((,,,...|||,,|}},||,.}|||}|,||}}.||||,|||,,,,,..}}))).))),))....}))||||{,|,,,,,,.,})))))),}}).},)))))}.....}})))))}||....,,))).)))))))))}))),....)))).......}))))))))}))))))||{{.((((,,...{((((((.((((((((((((((,......(((((({....((((..,(((((......))))))))).))))))).(((((((((((...........)))))},))))).{(((((((,{{,..(((........)))....}.,})))))))))))))))).)))).)),..)))))))})),)))|(((((.(((....))).)))))|{{{{{,{{{{{..{{({(.((...,,,}}.})))|{{|,.((((((.(((({(((.(((,.(((((,........,{{.(((((((...((.,........||...}}}}}},.,,}}|||||||||||||....,...,,...,((((.(((....((({{(((.((......)).)))))))......))).))))...{{{....|||||.{{.,(((((.,,(((((,,.......,,,...{({{{|{{|||{{{{,||.{(({{(,,{{.......}.)))}))}.),})))}))))})))..,)}}})}}))))))},...,,.(((({({....}))})))).((((........)))).(((((....)))))........}))))).))).)))).,,,|||....)}|(((((((((((((((...,....(.((((.{(((((({,((.((....)).)))))))))......}.)))).}.,..))}})))))))))))),...(((((({,,,....,((({{..((((,((.....,,.))))}.)),.})))})))))))..........,.........,,)))).))))))..)))}},,}|||}}}},|||,|||.......,))),.}))},,|))))))})),...,}}.)))))..)))).)))..,))).)))))).))))......))))
Back