Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0049700
Sequence Length
1749 nt
GC Content
0.4774
AUGUUUCAGAAAGAACAAGUGGAUCCUCUUCAGAUGAAAUUGCAGCAGGUGAAUGGACUUGGCCAGGGAUUAAUUCAGAGUGCAGGAAAAGACUGUGAUGUACAGGGUUUAGAACAUGACAUGGAAGAGAUCAAUGCUCGAUGGAAUACAUUGAAUAAAAAGGUCGCACAAAGAAUUGCACAGCUACAGGAAGCUUUGUUGCAUUGUGGGAAGUUUCAAGAUGCCUUGGAGCCAUUGCUCAGCUGGUUGGCAGAUACCGAGGAGCUCAUAGCCAAUCAGAAACCUCCAUCUGCUGAGUAUAAAGUGGUGAAAGCACAGAUCCAAGAACAGAAGUUGCUCCAGCGGCUCCUAGAUGAUCGAAAGGCCACAGUAGACAUGCUUCAAGCAGAAGGAGGCAGAAUAGCCCAGUCAGCAGAGCUGGCUGAUAGAGAGAAAAUCACUGGACAGCUGGAGAGUCUUGAAAGUAGAUGGACUGAACUACUCAGUAAGGCAGCAGCCAGGCAAAAACAGCUGGAAGACAUCCUGGUUCUGGCCAAACAGUUCCAUGAGACAGCUGAGCCUAUUUCUGACUUCUUAUCUGUCACAGAGAAAAAGCUUGCUAACUCAGAACCUGUUGGCACUCAGACUGCCAAAAUACAGCAGCAGAUCAUUCGGCACAAGGCUCUGGAAGAAGACAUAGAAAACCAUGCAACAGAUGUGCACCAGGCAGUCAAAAUUGGGCAGUCCCUCUCCUCCCUGACAUCUCCUGCAGAACAGGGUGUGCUGUCAGAAAAGAUAGACUCAUUGCAGGCCCGAUACAGUGAAAUUCAAGACCGCUGUUGUCGGAAGGCAGCCCUACUUGACCAAGCUCUGUCUAAUGCUAGGCUGUUUGGGGAGGAUGAGGUGGAGGUGCUCAACUGGCUGGCUGAGGUUGAGGACAAGCUCAGUUCAGUGUUCGUAAAGGAUUUCAAACAGGAUGUCCUGCACAGGCAGCAUGCUGACCACCUGGCUUUAAAUGAAGAAAUUGUUAAUAGAAAGAAGAAUGUAGAUCAAGCUAUUAAAAAUGGUCAGGCUCUUCUAAAACAAACCACAGGUGAGGAGGUGUUACUUAUCCAGGAAAAACUAGAUGGUAUAAAGACUCGUUACGCAGACAUCACAGUUACUAGCUCCAAGGCCCUCAGAACUUUAGAGCAAGCCCGGCAGCUGGCCACCAAGUUCCAGUCUACUUAUGAGGAACUGACCGGGUGGCUGAGGGAGGUGGAGGAGGAGCUGGCAACCAGUGGAGGACAGUCUCCCACAGGGGAACAGAUACCCCAGUUUCAGCAGAGACAGAAGGAAUUAAAGAAGGAGGUCAUGGAGCACAGGCUGGUGUUGGACACAGUGAAUGAGGUGAGCCGUGCUCUCUUAGAGCUGGUGCCCUGGAGAGCCAGAGAAGGGCUGGAUAAACUUGUGUCCGAUGCUAACGAGCAGUACAAACUAGUCAGUGACACUAUUGGACAAAGGGUGGAUGAAAUUGAUGCUGCUAUUCAGAGAUCACAACAGUAUGAGCAAGCUGCCGAUGCAGAACUAGCUUGGGUUGCUGAAACAAAACGGAAACUGAUGGCUCUGGGUCCAAUUCGCCUGGAACAGGACCAGACCACAGCUCAGCUUCAGGUACAGAAGGCUUUCUCCAUUGACAUUAUUCGACACAAAGAUUCAAUGGAUGAACUCUUCAGUCACCGUAGUGAAAUCUUUGGCACAUGUGGGGAGGAGCAAAAAACUGUAUUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-543.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -576.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 394.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((......)))))..((..(((((((((.(((.........(((((......)))))(((((((((((((((...((((..........(((.((((.(........).)))).))).......((((.....((((((.....)))))).......))))))))...)))))((((((((......)))((((((((((((((.....((((.(((.((((((((((....))))..(((((((((..((...(((...))))).)))))))))...(((((.((((((((((((...(((((.........((((.......((.((((((....)))))).))....)))).....))))).......))))))..)))))).))))).......(((((((((((...))))))))............((.((((((((.(((.(((((..((((........(((((.....)))))..(((....)))((((.....((((((.......((.(((..(((......)))..))).))..)))))).)))).)))).))))).))).))))).))).)).......(((((((.........)))))))....((((((............)))).))....))).))))))))).))))....)))).......))))))))))))))).((((.((((......((((((.((((((((((((((.......(((((((....((((...(((((......))))))))).))))))).(((((((((((...........))))).)))))).((((((((......(((........)))........)))))))))))))))).)))).))...)))))))))).))))(((((((((((..((((((.(((((...........(((((.((......)).)))))(((..((((((.((((((((.(((..((((((............(((((((...((..........))...)))))))...((((..(((((((((...((...((.(((((((.(((....((((.(((.((......)).)))))))......))).))))...(((......))).((((((((..(((.(((.........)))...))).)).))))))(((((.((((((..((.......)))))))).....)))))))).))...))...)))))))))....))))((((.(((...))).)))).((((........)))).(((((....)))))........)))))).))).))))....(((....)))(((((((((((((((........(.((((.((((((((.((.((....)).)))))))))......).)))).)....)).)))))))))))))....((((((........((((((..(((((((........))))).))..))))))))))))......................)))).))))))..))).))))))))))).....(((........)))...(((.(((.(((((.(((..(((.....)))..))))))))))))))))))))))))).....(((((.(((.((((((((.(((............))))))))))).))).)))))..((((....)))))))))))))).))).)))))))))(((......)))....)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((......)))))..((..(((((((((.(((.........(((((......)))))((((((((((.,{((...((((.,......,{({({,,,{.|}.,|||,....},|,||,,.,,,,,{,{(..,,.((((((.....)))))).......|||}|||}...,,,,|||{{{(((......))){(((((((((((((.....((((.{((.((((((..(((..{({{,.((((,(((((((...,.(((,.{{{,..}))},.,|||...(((((.(((((((((({{...(((((.....,...((((.......{{.((((((....)))))).}}....)))).....)))})..}....,)))}}|.}))))).))))),......}},((((((((...)))))))).....,,.....||.||||{{{|,||{|{{{||,,|,,|||,,.,..(((((.....)))))..(((....))){(((.....{{{{{(.......{|,{||,,(((,,,...|||,,|}},||,.}|||}|,||}}.||||,|||,,,},..}}))).))),))....})}||||{,|,,,,,,..})))))),}}).}.)))))).....}))))))}||....,,))).)))))))))}))),....)))).......))))))))),|||||.((((.((((......((((((.((((((((((((((,......(((((({....((((..,(((((......))))))))).))))))).(((((((((((...........)))))},))))).{(((((((,{{,..(((........)))....}.,})))))))))))))))).)))).)),..)))))))))).))))(((((((((((..((((((.(((((...........(((((.((......)).)))))(((..((((((.((((((((.(((..((((({.........{{.(({{(((...((,,......,,||...}}}}}},..,}||||,,|{||||||...,,...,,...,((((.(((....((({{(((.((......)).)))))))......))).))))...{,{....,,|||.((.,(((((...((((({{........,|...{({{{|{||}|||{{,||,{(({{(,,{{,.,....}.))}}))).)}})))}})))})))...)))})}}))))))),...,,.(((({((....}))})))).((((........)))).(((((....)))))........}))))).))).)))),...{{{....)}|(((((((((((((((...,....(.((((.{(((((({,((.((....)).)))))))))......}.)))).}.,..))}})))))))))))),...(((((({,,,....,((({{..((((,((.....,,.))))}.)),.})))})))))))....................,,)))).))))))..))).))))))))))).{({.{{{........)}}..,|((.(((.((({({(((..(((.....)))..)))))))))))))}))))))))))),,,},((({|.||{,((((((((.{{{.,,.......,.))})))))))).))},))))).,|(((....)))))))))))))).))).))))))))),|,.....,|||...,)),
Back