Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0051500
Sequence Length
1683 nt
GC Content
0.4753
GUCGCACAAAGAAUUGCACAGCUACAGGAAGCUUUGUUGCAUUGUGGGAAGUUUCAAGAUGCCUUGGAGCCAUUGCUCAGCUGGUUGGCAGAUACCGAGGAGCUCAUAGCCAAUCAGAAACCUCCAUCUGCUGAGUAUAAAGUGGUGAAAGCACAGAUCCAAGAACAGAAGUUGCUCCAGCGGCUCCUAGAUGAUCGAAAGGCCACAGUAGACAUGCUUCAAGCAGAAGGAGGCAGAAUAGCCCAGUCAGCAGAGCUGGCUGAUAGAGAGAAAAUCACUGGACAGCUGGAGAGUCUUGAAAGUAGAUGGACUGAACUACUCAGUAAGGCAGCAGCCAGGCAAAAACAGCUGGAAGACAUCCUGGUUCUGGCCAAACAGUUCCAUGAGACAGCUGAGCCUAUUUCUGACUUCUUAUCUGUCACAGAGAAAAAGCUUGCUAACUCAGAACCUGUUGGCACUCAGACUGCCAAAAUACAGCAGCAGAUCAUUCGGCACAAGGCUUUAAAUGAAGAAAUUGUUAAUAGAAAGAAGAAUGUAGAUCAAGCUAUUAAAAAUGGUCAGGCUCUUCUAAAACAAACCACAGGUGAGGAGGUGUUACUUAUCCAGGAAAAACUAGAUGGUAUAAAGACUCGUUACGCAGACAUCACAGUUACUAGCUCCAAGGCCCUCAGAACUUUAGAGCAAGCCCGGCAGCUGGCCACCAAGUUCCAGUCUACUUAUGAGGAACUGACCGGGUGGCUGAGGGAGGUGGAGGAGGAGCUGGCAACCAGUGGAGGACAGUCUCCCACAGGGGAACAGAUACCCCAGUUUCAGCAGAGACAGAAGGAAUUAAAGAAGGAGGUCAUGGAGCACAGGCUGGUGUUGGACACAGUGAAUGAGGUGAGCCGUGCUCUCUUAGAGCUGGUGCCCUGGAGAGCCAGAGAAGGGCUGGAUAAACUUGUGUCCGAUGCUAACGAGCAGUACAAACUAGUCAGUGACACUAUUGGACAAAGGGUGGAUGAAAUUGAUGCUGCUAUUCAGAGAUCACAACAGUAUGAGCAAGCUGCCGAUGCAGAACUAGCUUGGGUUGCUGAAACAAAACGGAAACUGAUGGCUCUGGGUCCAAUUCGCCUGGAACAGGACCAGACCACAGCUCAGCUUCAGGUACAGAAGGCUUUCUCCAUUGACAUUAUUCGACACAAAGAUUCAAUGGAUGAACUCUUCAGUCACCGUAGUGAAAUCUUUGGCACAUGUGGGGAGGAGCAAAAAACUGUAUUACAGGAAAAGACAGAGUCUCUAAUACAGCAAUAUGAAGCCAUUAGCCUACUCAAUUCAGAGCGUUAUGCCCGCCUAGAGCGGGCCCAGGUCUUAGUAAACCAGUUUUGGGAAACUUAUGAAGAGCUCAGCCCCUGGAUUGAGGAAACUCGGGCACUAAUAGCACAGUUACCCUCUCCAGCCAUUGAUCAUGAGCAGCUCAGGCAGCAACAAGAGGAAAUGAGGCAAUUAAGGGAAUCUAUUGCUGAACACAAACCUCAUAUUGACAAACUACUAAAGAUAGGCCCACAACUAAAGGAAUUAAACCCUGAGGAAGGGGAAAUGGUGGAAGAAAAAUACCAGAAAGCAGAAAACAUGUAUGCCCAAAUAAAGGAGGAGGUGCGCCAGCGAGCCCUGGCUCUGGAUGAAGCCGUGUCCCAGUCCACACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-487.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -519.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 461.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((((((((..(((........)))....))))).))).(((((((..((((((((....))))))))..(((((((.(((((((((..((...(((...))))).)))))))))...(((((.((((((((((((...(((((.........((((.......((.((((((....)))))).))....)))).....))))).......))))))..)))))).)))))..(((((((.((((((((...))))))))............((.((((((((.(((.(((((..((((........(((((.....)))))..(((....)))((((.....((((((.......((.(((..(((......)))..))).))..)))))).)))).)))).))))).))).))))).))).)).......(((((((.........)))))))....((((((............)))).))..((((((((((.((((....))))..(((.(((((((...((..........))...))))))).))).(((.(((((((((..............((((.(((....((((.(((.((......)).)))))))......))).))))..........(((((.((..(((((...(((((((.............(((((((((....((...((((........))))....))..))).))))))..)))))))...)))))..)))))))(((.((((((((((....)))))....((((........)))).(((((....)))))...............((((((.(((((..(((..((((((.....)).)))).......)))..))))).))))))...)))))))).((((....))))))))))))).)))...)))))).))))((((....))))..........((((((..(((((((........))))).))..))))))...)))))))................))))))).((((....)))).....((((((((((((...........(((.(((((((.(((((.(((..(((.....)))..)))))))))))....)))).))).(((((.(((((.(((.((((((((.(((............))))))))))).))).))))).)).)))...((((..((..((((.....((((((((.........((((((((.(((...........))).)))))))).........((.((((((((.((((((((((.(.(((..((((((.....))))))..((.(((((((...(((....)))...)))....)))).)).)))).)))))))))).......))))..)))).))........))))))))))))..)))))).))))))))))))..(((...((((...((.((((((...........))))))...))....))))...)))........(((....))).)))))))...............)(((.(((..((((.(((((.........((.(((((.............((((..((..........))..))))(((((......))))))))))))...))))).))))..)))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..(((((({{..,{({,.,,,,.,,}..,,))}))},)).{((((((..((((((((....))))))))..{((((((.(((((((((,,,,...{{{..,|}}.,.)))))))))...(((((.((((((((((((...(((((.....,...((((.......{(.((((((....)))))).}}....)))).....)))))..},...})))}}}.}))))).)))))..,,,,,||.((((((((...))))))))..,,.{{,....||.{(({{({(,{{{{{{(((,.{{{{,,,,....(((((.....)))))..(((....))){(({.....({{{((.......{|,(((..(((,,,...|||..}}},||,.}|||}},||}}.||||,|||}},}}..}}))).))),))....,))}||||.|}|,,,,.,|)}}||},.,}.|.||||},......{||{||{|.{{{{((({({{{{,,{{{{....))}}...||,|{{{{{{..,((,,,...,.,,||,..}}}}},,..,)}|||.,||||||||........,,...,(({{.({(,{,,((((,(((.{(......}|.}}}}|||,...,.|||,|||},{.,,,,.,.{((((.{{.{(((((.{{(((((,...{{{{,..,,..{((({{({{{{({{{.||.{(({{(..{{.......},))))))}.},))))})))),)))..,||},}..}},|||{{{..|||{{{{,{,.,..})))),.,.((((........)))).(((((....))))).........,,,,,.,,||||}|,|||}}|{,.,|||||||||{{||{||||.......}|},{||,||{||||}}{,.||}}}})),||||,,,,)}}},,,)})))).)}}..,)}})))}))}}||}},}}}}}}{||,,...}},||{|||,,|||||||..,,..,,)})))})),..})},))))))),}}}...........,,},.))))))}.((((....))))..,,.((((((((((((.,.........{,..(((,(((.((({(((((..(((.....)))..)))))))))))}}}.||||{|,|.(((((.(((((.{((,((((((((.{{{.,,.......,.))})))))))).))).))))).)).)))..,}}}}.{((..((((.....((((((((.,,......((((((((.{({....,,,...,))).)))))))).........(({,,,{(,,,.((((((((((.(.{{,..((((((.....))))))..((.(((({((,..(((....}))...))),,,.)))).)).,)),.))))))))))....,,.,)))..|,,}.}}...}},..))))))))))))..)))..).)))))))))))),}{{{...((((...{{.((((((..{{....,}}))))))...,,....))))...}))........{,,....})).))))))}...............)(((.(((..((((.(((((.........{{.(((((..,,,.......,|{{{.{((..........}}..)}))(((((......))))))))))})...))))).))))..)))...)))
Back