Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0057100
Sequence Length
858 nt
GC Content
0.4732
GAAUUAAAGAAGGAGGUCAUGGAGCACAGGCUGGUGUUGGACACAGUGAAUGAGGUGAGCCGUGCUCUCUUAGAGCUGGUGCCCUGGAGAGCCAGAGAAGGGCUGGAUAAACUUGUGUCCGAUGCUAACGAGCAGUACAAACUAGUCAGUGACACUAUUGGACAAAGGGUGGAUGAAAUUGAUGCUGCUAUUCAGAGAUCACAACAGUAUGAGCAAGCUGCCGAUGCAGAACUAGCUUGGGUUGCUGAAACAAAACGGAAACUGAUGGCUCUGGGUCCAAUUCGCCUGGAACAGGACCAGACCACAGCUCAGCUUCAGGUACAGAAGGCUUUCUCCAUUGACAUUAUUCGACACAAAGAUUCAAUGGAUGAACUCUUCAGUCACCGUAGUGAAAUCUUUGGCACAUGUGGGGAGGAGCAAAAAACUGUAUUACAGGAAAAGACAGAGUCUCUAAUACAGCAAUAUGAAGCCAUUAGCCUACUCAAUUCAGAGCGUUAUGCCCGCCUAGAGCGGGCCCAGGUCUUAGUAAACCAGUUUUGGGAAACUUAUGAAGAGCUCAGCCCCUGGAUUGAGGAAACUCGGGCACUAAUAGCACAGUUACCCUCUCCAGCCAUUGAUCAUGAGCAGCUCAGGCAGCAACAAGAGGAAAUGAGGCAAUUAAGGGAAUCUAUUGCUGAACACAAACCUCAUAUUGACAAACUACUAAAGAUAGGCCCACAACUAAAGGAAUUAAACCCUGAGGAAGGGGAAAUGGUGGAAGAAAAAUACCAGAAAGCAGAAAACAUGUAUGCCCAAAUAAAGGAGGAGGUGCGCCAGCGAGCCCUGGCUCUGGAUGAAGCCGUGUCCCAGUCCACACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-236.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -255.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 149.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..............((.(.(((.((((.(((((((((((((((((((........(.((((.((((((((.((.((....)).)))))))))......).)))).)....)).)))))))))))))....((((((........((((((..(((((((........))))).))..))))))))))))(((((((........(((((((((....((((....)))).....((((((((((((...........(((.(((((((.(((((.(((..(((.....)))..)))))))))))....)))).))).(((((.(((((.(((.((((((((.(((............))))))))))).))).))))).)).)))...((((..((..((((.....((((((((.........((((((((.(((...........))).)))))))).........((.((((((((.((((((((((.(.(((..((((((.....))))))..((.(((((((...(((....)))...)))....)))).)).)))).)))))))))).......))))..)))).))........))))))))))))..)))))).))))))))))))..................((((((...........))))))..........)))))))))........(((....))).(((....((..(((........))).))....)))...(((((.........)))))...............((((..((..........))..))))(((((......))))))))))))..)))))))).)))).))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
...........,..((.(.(((.((((.(((((((((((((((((((...,....(.((((.{(((((({,((.((....)).)))))))))......}.)))).}.,..))}}))))))))))))....(((((({,,,....,((({{..((((,((.....,,.))))}.)),.})))})))))))((((((((.,,....{{(((({{(,...((((....))))..,,.((((((((((((.,.........{,..(((,(((.((({(((((..(((.....)))..)))))))))))}}}.||||{|,|.(((((.(((((.{((,((((((((.{{{.,,.......,.))})))))))).))).))))).)).)))..,}}||.{((..((((.....((((((((.,,......((((((((.{({....,,,...,))).)))))))).........(({,,,{(,,,.((((((((((.(.{{,..((((((.....))))))..((.(((({((,..(((....}))...))),,,.)))).)).,)),.))))))))))....,,.,)))..|,,}.}}...}},..))))))))))))..)))..).)))))))))))),},,....{,{,...{,.((((((..,{....,}})))))).........,)))}}}))).....,,.{{,....})).(((....((..(((........)))..),..,)))...(((((.........)))))....{({.......,||.|,|((.......,}.||.{||||,,,,|,...,}))))))))))))..}))))))).)))).)).,....
Back