Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0057800
Sequence Length
2982 nt
GC Content
0.4571
UAUGAGCAAGCUGCCGAUGCAGAACUAGCUUGGGUUGCUGAAACAAAACGGAAACUGAUGGCUCUGGGUCCAAUUCGCCUGGAACAGGACCAGACCACAGCUCAGCUUCAGGUACAGAAGGCUUUCUCCAUUGACAUUAUUCGACACAAAGAUUCAAUGGAUGAACUCUUCAGUCACCGUAGUGAAAUCUUUGGCACAUGUGGGGAGGAGCAAAAAACUGUAUUACAGGAAAAGACAGAGUCUCUAAUACAGCAAUAUGAAGCCAUUAGCCUACUCAAUUCAGAGCGUUAUGCCCGCCUAGAGCGGGCCCAGGUCUUAGUAAACCAGUUUUGGGAAACUUAUGAAGAGCUCAGCCCCUGGAUUGAGGAAACUCGGGCACUAAUAGCACAGUUACCCUCUCCAGCCAUUGAUCAUGAGCAGCUCAGGCAGCAACAAGAGGAAAUGAGGCAAUUAAGGGAAUCUAUUGCUGAACACAAACCUCAUAUUGACAAACUACUAAAGAUAGGCCCACAACUAAAGGAAUUAAACCCUGAGGAAGGGGAAAUGGUGGAAGAAAAAUACCAGAAAGCAGAAAACAUGUAUGCCCAAAUAAAGGAGGAGGUGCGCCAGCGAGCCCUGGCUCUGGAUGAAGCCGUGUCCCAGUCCACACAGAUUACAGAGUUUCAUGAUAAAAUUGAGCCUAUGUUGGAGACACUGGAGAAUCUUUCCUCUCGCCUGCGUAUGCCACCACUGAUCCCUGCUGAAGUAGACAAGAUCAGAGAGUGCAUCAGUGACAAUAAGAGUGCCACCGUGGAGCUAGAAAAACUGCAGCCAUCCUUUGAGGCCUUGAAGCGCCGUGGAGAGGAGCUUAUUGGACGAUCUCAGGGAGCAGACAAGGAUCUGGCUGCAAAAGAAAUCCAGGAUAAAUUGGAUCAAAUGGUAUUCUUCUGGGAGGACAUCAAAGCUCGGGCUGAAGAACGAGAAAUCAAAUUUCUUGAUGUCCUUGAAUUAGCAGAGAAGUUCUGGUAUGACAUGGCAGCUCUCCUGACCACCAUCAAAGACACCCAGGAUAUUGUCCAUGACUUGGAAAGCCCAGGCAUUGAUCCUUCCAUCAUCAAACAACAGGUUGAAGCUGCUGAGACUAUUAAGGAAGAGACAGAUGGUCUGCAUGAAGAGCUGGAGUUUAUUCGGAUCCUUGGAGCAGAUUUGAUUUUUGCCUGUGGAGAAACUGAGAAGCCUGAAGUGAGGAAGAGCAUUGAUGAGAUGAAUAAUGCUUGGGAGAACUUAAACAAAACAUGGAAAGAGAGGCUAGAAAAACUUGAGGAUGCUAUGCAAGCUGCUGUGCAGUAUCAGGACACUCUUCAGGCUAUGUUUGACUGGCUAGAUAACACUGUGAUUAAACUCUGCACCAUGCCCCCUGUUGGCACUGACCUCAAUACUGUUAAAGAUCAGUUAAAUGAAAUGAAGGAGUUCAAAGUAGAAGUUUACCAACAGCAAAUUGAGAUGGAGAAGCUUAAUCACCAGGGUGAACUGAUGUUAAAGAAAGCUACUGAUGAGACGGACAGAGACAUUAUACGAGAACCACUGACAGAACUCAAACACCUCUGGGAGAACCUGGGUGAGAAAAUUGCCCACCGACAGCACAAACUAGAAGGGGCUCUGUUGGCCCUUGGUCAGUUCCAGCAUGCCUUAGAGGAACUAAUGAGUUGGCUGACUCAUACCGAAGAGUUGUUAGAUGCUCAGAGACCAAUAAGUGGAGACCCAAAAGUCAUUGAAGUUGAGCUCGCAAAGCACCAUGUCCUAAAAAAUGAUGUUUUGGCUCAUCAAGCCACAGUGGAAACAGUCAACAAAGCUGGCAAUGAGCUUCUUGAAUCCAGUGCUGGAGAUGAUGCCAGCAGCUUAAGGAGCCGUUUGGAAGCCAUGAACCAAUGCUGGGAGUCAGUGUUACAGAAAACAGAGGAGAGGGAGCAGCAGCUUCAGUCAACUCUGCAGCAGGCCCAGGGCUUCCACAGUGAAAUUGAAGAUUUCCUCUUGGAACUUACUAGAAUGGAGAGCCAGCUUUCUGCAUCUAAGCCCACAGGAGGACUUCCUGAAACUGCUAGGGAACAGCUUGAUACACAUAUGGAACUCUAUUCCCAGCUGAAAGCCAAGGAAGAGACUUAUAAUCAACUACUUGACAAGGGCAGACUCAUGCUUCUAAGCCGUGACGACUCUGGGUCUGGCUCCAAGACAGAACAGAGUGUAGCACUUUUGGAGCAGAAGUGGCAUGUGGUCAGCAGUAAGAUGGAAGAAAGAAAGUCAAAGCUGGAAGAGGCCCUCAACUUGGCAACAGAAUUCCAGAAUUCCCUACAAGAAUUUAUCAACUGGCUCACUCUAGCAGAGCAGAGUUUAAACAUCGCUUCUCCACCAAGCCUGAUUCUAAAUACUGUCCUUUCCCAGAUAGAAGAGCACAAGGUUUUUGCUAAUGAAGUAAAUGCUCAUCGAGACCAGAUCAUUGAGCUGGAUCAAACUGGGAAUCAAUUAAAGUUCCUUAGCCAAAAGCAGGAUGUUGUUCUGAUCAAGAAUUUGUUGGUGAGCGUGCAGUCUCGAUGGGAGAAGGUUGUCCAGCGAUCUAUUGAAAGAGGGCGAUCACUAGAUGAUGCCAGGAAGCGGGCAAAACAAUUCCAUGAAGCUUGGAAAAAACUGAUUGACUGGCUAGAAGAUGCAGAGAGUCACCUGGACUCAGAACUAGAGAUAUCCAAUGACCCAGACAAAAUUAAACUUCAGCUUUCUAAGCAUAAGGAGUUUCAGAAGACUCUUGGUGGCAAGCAGCCUGUGUAUGAUACCACAAUUAGAACUGGCAGAGCACUGAAAGAAAAGACUUUGCUUCCCGAAGAUAGUCAGAAACUUGACAAUUUCCUAGGAGAAGUCAGAGACAAAUGGGAUACUGUUUGUGGCAAGUCUGUGGAGCGGUGAGCAUGAAUGUCCCCUUCAGGGGUCUAACCGGGAUCCCAAAAGCAAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-845.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -901.86
Frequency: 0.0000
Diversity: 776.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((.((((((....))))..)).)))))..(((((..........(((..(((.(((.(((((.(((..(((.....)))..))))))))))).(((((((((((((((((.(((((.(((.((((((((.(((............))))))))))).))).))))).)).))).((((....(((..((((..((((((((((.........((((...))))....((((...))))......((((((((.((..((.((((....((((.(((.....((..(((..((((.((((((((..((.(((((((...(((....)))...)))....)))).))..)))).((((..((((.((((.(.((.......)).)))))..))))))))(((((.....))).)).)))))))).))))).....))).))))....)))).))..))))))))))........))))..............(((....))).)))))).((..(((........)))..)).(((((..((((((..(((......(((((..(((...........)))((.......)).((..((((((..(((((....(((((.....).))))((((((((.............(((.((.((((.........)))).)).)))))).))))).(((((...))))).)))))..)))))).))..(((((((.(((.((((..(.....)..))))..)).).)))))))......(((((((((...((.(((((((....((((.....(((((.((((((...((((.((.......)).))))...))....))))))))))))).......))))))).))......((((((......))))))....))))))))))))))(((((((((((..((((..(....)..))))............)))))))))))....((((((((..((((((((((..((((((((((.(((((..................))))).....((((((..(((..((((((((((((((.((..(((((((..((((..(((.((.....(((..((((((((............)))))))))))....)).)))..))))..((((.(((..((.(((((.......)))))))..)))....))))....(((......)))........))))).)).)).)))))))))))....)))...)))..))))))......(((.................))).....))))))))))..)))))))))).))))....)))).((((((.(.((.((......)))).)))))))))).))))))..)))))(((((.((((((((((..((((........))))....))).......((((((.......((((((.(((.((......))...)))..))))))......((((((....(((((((.......(((.(....))).).......))))))).......))).)))...)))))).......(((((......(((((((.(........)))))..)))......)))))(((((((.....)))))))))))))).))))).))))..)))...))))(((((((....)))))))......((((........)))).....(((.....))).(((......)))..))))))))))))..(((((((.(((..........))).)))))))(((((((...((((((.(((((...((((....((((..((((.(((((((((......((((((........))))))..)))))))))))))((((((((.((..(((((((((.....)))))))........(((((..((.(((((....)))))..))..))))).....))..)).))))))))))))....))))...)))))..(((((..((.((((....(((..((((((((((((((((..((((.(((((.(((.(((((.....((((((((((...(((((.....(((((..((((..(((..(((...)))...)))))))..))))).((((....)))).(((((((((((..((((((.(((..((.((.((((((..((((.........)))).)))))))).)).)))..))))))..)))(((..((((..((.(((..((((..........(((((...((((((...(((........))).......))))))(((((.......))))).......))))).(((((.((...))))))).....))))))).))))))...)))............))))))))((((((...((.(((((.......((((((.....))))))))))).))..((((((.((...)).)))).))...))))))))))).....))))))))))......))))).))).))))).((((....(((((((..(((.(....((((.....))))).)))..)))))))....))))....)))).((((.....))))(((((..(((((.........(((((.......)))))....))).))..)))))....))))))))))))....)))).)))....)))).))..)))))..(((.(((.......(((((((.((((...))))....)))))))........))).)))(((.....)))((((........)))).......((..(((....)))..))......(((((((((((..((((.(((((....))))).))))....)).)))).)))))((((((((....)))))))).......))))))...)))))))......(.((((....)))).)....)))..)))....)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,{..((...{{||..,})|||..{{.((((((((((((.,.........{,..(((,(((.((({(((((..(((.....)))..)))))))))))}}}.||||{|||.(((((.(((((.{((,((((((((.{{{.,,.......,.))})))))))).))).))))).)).)))..,}}|}.{((..((((.....((((((((.,,......((((((({.{({....,,{...}))),))))))))......,..(({.,,{(,,..((((((((((.(.{{,..((((((.....))))))..((.(((({((,..(((....}))...))),,,.)))).)).,))},))))))))))....,|.,)))..,,,,.}}..,))}..))))))))))))..)))..).)))))))))))).}{{{...((((...{{.((((((..{,,...,}}))))))...,,....))))...}}}........,......|||.,......||..(((........))).,}((((((({..(((((.........))))}....,{,.....{{{{{,{{{({.......{|,{(.{(({({({{({{((,...{||||,,,,||,,})},{{{||,{{({....,,||||||{..|||||||........,)}),}}.))))})}))),)}|(({{...}})))})))|||{||}},|{||{.((((((({,((.((((..|.....,..)))).,}).).))))))).....{(((((((((...{{.,{{,,{,....,((((((({((((({{,{{(({{{({((,((...,,,.}}.})))...)).,,.}})))))),,}.,..}})},},))))))))......((((((......)))))),...}))))))))}.((((((((..((((.(((.(((((......((((((({...}))))))),((((,({(,..{(.(((({..,||}||.}|,..,}{|{|{{,,,}.))).,,,...}}},.},,,.,|||}}|}}..{{{{,....))),.))))).))).))))))))))))..((((.((,,(((((((..((((((.((((((((..,.......,.))))))))((.{(.(((((((((((((({({((.((.(((((,,,,,.{{({({{({.{((((((.....,(((,.{{(({.{{{{......((((((((.(......}.))))))))......})))...{(((((((.{......{(({........,,,..((.((((.(((.((((.((.((.((((((..(((((((((({(((.(((((.(((((((({,......,,((((((((.((((.(({{{,,....{((((((.{{{{{,{({,..((({.......,}}}}....}}}..{,,,,,|.|||,..,..}}}})}}.}}))))).....}).}.)).))}}).))))))}|(((((({..,(((((((.......,{{.{{,.,|}}.|.....,.}})}))}...,,,..,,.,}},,,,..,}},..}}}}|}}||,....,,(((((((.....))))))),,..,{{......|,...,{{{{{,,.,,,))))))))))))))}}.))))))))){{{.,...,},(((((((....)))))))...))))))}}))).)))))))).)).{((.....|||.(((......))).,,....,,,)))).))).)))))).,},)))......}.))))))))}))},}},..)))))).).}}}.)))))}..{(((((((((((.(((((((({.....,((((((........)))))),,)))))))))))))((((((((.((..((..(((((,,,,{|.,||||.......,|{(((..((.(((((....)))))..))..))))})))))))..)).)))))))),{{{{{.,{{.{,{|,|||{||||,|}..}},}},|....,,|.)))))))}(((((((((.{((({.(((((.(((.(((((.....((((((((((...(((((.....{{{({..{(((.,(((..(((...)))...))))}))..})}}}.{(({....,))}.{((((((((((..((((((,(((..(({,,.((((((..((((.,,...,,.)))).)))))),,.,)}),)},))))))..)))(((.{((((..((,{({..((((...........,{{....((((((,..(((........)))..,....)))))){((((.......))))).....,,|}|||{.{{{{.,,.}})},})))}....))))))).}})))),}.)))............)))))))}((((((...((.(((((.......((((((.....))))))))))).)),,{{((((.{(...)}.)))).))...)))))))}}}}.....))))))))))......))))).))).))))).{(({....{{{((((,,{{({{.(..({((,,,{{|}|,.,|},..))}})}}}}},)))).,..)}))},|||,,,,.}},|(((,(..,,|,|}},......(((((.......)))))....}}}.}}..}})))}...)))))))))({(((....,)}))).......,.....))))).)).)).}}......)))))))))))))).}}.))...((((((({....})))))))))))))...)))))))))).)))).............,|}}||{.},,}}}..,,....,.(((((((((((..((((.(((({....})))).)))),...)).)))).))))){(((((((....))))))))})).,}))))))}.)))))}.))})}..,,)))))))).(((((((.....)))))))....}.....}
Back