Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0060000
Sequence Length
1443 nt
GC Content
0.4581
UUUCAUGAUAAAAUUGAGCCUAUGUUGGAGACACUGGAGAAUCUUUCCUCUCGCCUGCGUAUGCCACCACUGAUCCCUGCUGAAGUAGACAAGAUCAGAGAGUGCAUCAGUGACAAUAAGAGUGCCACCGUGGAGCUAGAAAAACUGCAGCCAUCCUUUGAGGCCUUGAAGCGCCGUGGAGAGGAGCUUAUUGGACGAUCUCAGGGAGCAGACAAGGAUCUGGCUGCAAAAGAAAUCCAGGAUAAAUUGGAUCAAAUGGUAUUCUUCUGGGAGGACAUCAAAGCUCGGGCUGAAGAACGAGAAAUCAAAUUUCUUGAUGUCCUUGAAUUAGCAGAGAAGUUCUGGUAUGACAUGGCAGCUCUCCUGACCACCAUCAAAGACACCCAGGAUAUUGUCCAUGACUUGGAAAGCCCAGGCAUUGAUCCUUCCAUCAUCAAACAACAGGUUGAAGCUGCUGAGACUAUUAAGGAAGAGACAGAUGGUCUGCAUGAAGAGCUGGAGUUUAUUCGGAUCCUUGGAGCAGAUUUGAUUUUUGCCUGUGGAGAAACUGAGAAGCCUGAAGUGAGGAAGAGCAUUGAUGAGAUGAAUAAUGCUUGGGAGAACUUAAACAAAACAUGGAAAGAGAGGCUAGAAAAACUUGAGGAUGCUAUGCAAGCUGCUGUGCAGUAUCAGGACACUCUUCAGGCUAUGUUUGACUGGCUAGAUAACACUGUGAUUAAACUCUGCACCAUGCCCCCUGUUGGCACUGACCUCAAUACUGUUAAAGAUCAGUUAAAUGAAAUGAAGGAGUUCAAAGUAGAAGUUUACCAACAGCAAAUUGAGAUGGAGAAGCUUAAUCACCAGGGUGAACUGAUGUUAAAGAAAGCUACUGAUGAGACGGACAGAGACAUUAUACGAGAACCACUGACAGAACUCAAACACCUCUGGGAGAACCUGGGUGAGAAAAUUGCCCACCGACAGCACAAACUAGAAGGGGCUCUGUUGGCCCUUGGUCAGUUCCAGCAUGCCUUAGAGGAACUAAUGAGUUGGCUGACUCAUACCGAAGAGUUGUUAGAUGCUCAGAGACCAAUAAGUGGAGACCCAAAAGUCAUUGAAGUUGAGCUCGCAAAGCACCAUGUCCUAAAAAAUGAUGUUUUGGCUCAUCAAGCCACAGUGGAAACAGUCAACAAAGCUGGCAAUGAGCUUCUUGAAUCCAGUGCUGGAGAUGAUGCCAGCAGCUUAAGGAGCCGUUUGGAAGCCAUGAACCAAUGCUGGGAGUCAGUGUUACAGAAAACAGAGGAGAGGGAGCAGCAGCUUCAGUCAACUCUGCAGCAGGCCCAGGGCUUCCACAGUGAAAUUGAAGAUUUCCUCUUGGAACUUACUAGAAUGGAGAGCCAGCUUUCUGCAUCUAAGCCCACAGGAGGACUUCCUGAAACUGCUAGGGAACAGCUUGAUACACAUAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-404.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -432.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 375.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((......)).)))(.((((((((.....((.(((..(((..(((((((((....(((((((.(((((((.(((.((((..(.....)..))))..)).).))))))).....((((((((((...((.(((((((....((((.....(((((.((((((...((((.((.......)).))))...))....))))))))))))).......))))))).))......((((((......))))))....))))))))))....(((((((((((..((((..(....)..))))............)))))))))))(((((........))))))))))))....))).....(((((..................))))).....((((((..(((..((((((((((((((.((..(((((((..((((..(((.((.....(((..((((((((............)))))))))))....)).)))..))))..((((.(((..((.(((((.......)))))))..)))....))))....(((......)))........))))).)).)).)))))))))))....)))...)))..))))))..))))))..)))....))).))....)))..(((((((((..(((((.((((((..(((((..(((((((((((((((.........(((((((......(((((...(((((.......(((.((((((((((..((((........))))....))).......((((((.......((((((.(((.((......))...)))..))))))......((((((....(((((((.......(((.(....))).).......))))))).......))).)))...)))))).......(((((......(((((((.(........)))))..)))......)))))(((((((.....)))))))))))))).))))))))...)))))......(((((((....)))))))......((((........)))).....(((.....))).(((......))).((((...(((((...(((((((.(((..........))).))))))))))))))))..)))))))....))))))).(((((((((((((.(((((((((......((((((........))))))..)))))))))))))((((((((.((..(((((((((.....)))))))........(((((..((.(((((....)))))..))..))))).....))..)).)))))))).(((((..((.((((.....)))).))..)))))..........)))))))))..))))...))))...)))))....)))))).)))))..))...)))))))....))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,({......},.)))(.(((({,{,,,.,.((.(((..(((..((((((.,{{(,..((({{(((.((((((.((((,,..})))....)))))).).))))))}})}}.,...,{((((((((..{(,,.{{{{{{.....((((((((((((({{,{,((({{(,((,((...,{{.,,.,)))...)).},.}})))))).,}....})))},,))))))))......((((((......))))))....,}}}}}||||((({(((((((((((.,((((..(....)..))))...........,))))))))))}...,||,|||||...}))))}),},}}.|||}||}}}|{|||................,,)))),...,.((((((..(((..((((((((((((((.((..((({((({{{{{(..(((,({...,{(,({.((,(({{,.{({..{{{,|,||,|||||||,{.{{||.|||{{,,...}}|}}.|||}},|.|||||}},,.}}))),))),.}}),...)),}}.,}|||....,.}}}........))))).)).)).)))))))))))....)))...)))..))))))..))))))..)))....))).))..,.}|,,.(((((((((..(((((.((((((..(((((..(((({((({((((((.........(((((((......((((({,.,.|||....{(((((.((((((((({..((((........))))....))}..{{,,.,,,|||,......{(((((.(((.{,.....,}}.,.)))..))))))..|{.{(((((({..,{((((((.......,{{.{{,.,|}}.|.....,.},)}))}....,,..,,.}}},,.,,,}))...}}}},||||,.....,(((((((.....)))))))....,,,......,,..,((((((,.....)))))))))))))).)))))),},{{||,})|..,,.,((((((,{{.|||||,,......))))}}}}}...))))|,,|.{|,.,...|||.{{{,,,...))).|||{...(((((...(((((((.(((..........))).))))))))))))})}}..)))))))....))))))},|((((((((((((.(((((((((.....,((((((........)))))).,)))))))))))))((((((((.((..((..(((((,,,,{|.,||||.......,||{{{..((.(((((....)))))..))..))))})))))))..)).)))))))).{{{{,..{|,||||.,{{{||||{|,..|},}},|...|,||,)))))))))..,}})...))))...))))),...)))))).)))))..))...))))))).,.,))))).)
Back