Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0064600
Sequence Length
1631 nt
GC Content
0.5064
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-523.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -554.55
Frequency: 0.0000
Diversity: 488.68
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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