Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0065500

Sequence Length

273 nt

GC Content

0.5165

GCGGAAGUGUUUCGAGACACAGUCCACAUGCUGUUGGAGUGGCUUUCUGAAGCAGAGCAAACGCUUCGCUUUCGGGGAGCACUUCCUGAUGACACAGAGGCCCUGCAGUCUCUCAUUGACACCCAUAAGGAAUUCAUGAAGAAAGUAGAAGAAAAGCGAGUGGACGUUAACUCAGCAGUAGCCAUGGGAGAAGUCAUCCUGGCUGUCUGCCACCCCGAUUGCAUCACAACCAUCAAACACUGGAUCACCAUCAUCCGAGCUCGCUUCGAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-80.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -85.22

Frequency: 0.0002

Diversity: 43.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((.(((((((.(((.....((((((.((((...((((((.(((((((((((.((((....)))).)).)))))))))))))))(((......))).....((((..(((.((((.((...((....))...)))))))))..))))......)))).)))))).....))).((((((((((.(((.(....).))))))))).))))......(((.(........).))))))))))((((.......))))....))))(((...)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((.(((((({.(((.....((((((.((((..,(((((,{(((((((((((.((((....)))).))}}))))))))))))))(((......))).....((((..(((.((({,((...((....))...)))))))))..))))......)))).)))))).....))).((((((((((.(((,{....}.))))))))).))))......{{{.{..........,,,}))))))(({{.......}))),..,|}})({{...)))