Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_MACF1_0065800
Sequence Length
747 nt
GC Content
0.5301
GCGGAAGUGUUUCGAGACACAGUCCACAUGCUGUUGGAGUGGCUUUCUGAAGCAGAGCAAACGCUUCGCUUUCGGGGAGCACUUCCUGAUGACACAGAGGCCCUGCAGUCUCUCAUUGACACCCAUAAGGAAUUCAUGAAGAAAGUAGAAGAAAAGCGAGUGGACGUUAACUCAGCAGUAGCCAUGGGAGAAGUCAUCCUGGCUGUCUGCCACCCCGAUUGCAUCACAACCAUCAAACACUGGAUCACCAUCAUCCGAGCUCGCUUCGAGGAGGUCCUGACAUGGGCUAAGCAGCACCAGCAGCGUCUUGAAACGGCCUUGUCAGAACUGGUGGCUAAUGCUGAGCUCCUGGAAGAACUUCUGGCAUGGAUCCAGUGGGCUGAGACCACCCUCAUUCAGCGGGAUCAGGAGCCAAUCCCGCAGAACAUUGACCGAGUUAAAGCCCUUAUCGCUGAGCAUCAGACAUUUAUGGAGGAGAUGACUCGCAAACAGCCUGACGUGGACCGGGUCACCAAGACAUACAAAAGGAAAAACAUAGAGCCUACUCACGCGCCUUUCAUAGAGAAAUCCCGCAGCGGAGGCAGGAAAUCCCUAAGUCAGCCAACCCCUCCUCCCAUGCCAAUCCUUUCACAGUCUGAAGCAAAAAACCCACGGAUCAACCAGCUUUCUGCCCGCUGGCAGCAGGUGUGGCUGUUAGCACUGGAGCGGCAAAGGAAACUGAAUGAUGCCUUGGAUCGGCUGGAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-235.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -249.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 188.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((.(((((((.(((.....((((((.((((...((((((.(((((((((((.((((....)))).)).)))))))))))))))(((......))).....((((..(((.((((.((...((....))...)))))))))..))))......)))).)))))).....))).((((((((((.(((.(....).))))))))).))))......(((.(........).))))))))))((((.......))))..(((.((((.(.(((..(((((...((((((..((.((....)).))(((((((..(((((.((((((..(((...((.(((((((((((((((((.....(((......)))))))).(((((..(((.....((((((.(((((((.........))))))).)))...)))....)))..)))))........)))).)))).))))....(((.......)))))...))).)))))).)).)))..)))...))))....................))))))(((.(((((.((((.....))))....)).)))))).)))))..)))).)))).)))...)))(((((((...(((.(((((((((.....)))))............((((((..((((((((((((((((((((((.......)))))))))...)).)))).))))....)))..)))).))..)))).))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((..((((({.,.{||,|.((((((.,((({((((((({{(((((((((((.((((....)))).))}}))))))))))))))(((,,,...}}}.,,..((((..(((.((({,((...((....))...)))))))))..))))......||||{|}||,|.,,,{|||.((((((((((.(((,{....}.))))))))).))))......{{{,{...........,,...{(((((((,.,,,,.,|((({(....((((.(((((.((((((({.(((((..((.((....}}.))||||||....})))}}))))).......(((....))))).))))).))))...,}},)).))))))))))))|||(({{.,....}}||{((.(((((((.........))))))).))}...,,..,||||||,.,|||,..},}||{{.},)))).,.....,}|||}.,.}}})))},.}})))},,,,.)}))}).}.})}..,.}))),,......{,.....,...,,{|||.(({.(((({.((((.....))))....)).))))))}}|||....,))},.}}.,,)}..)))(((((((...(((.(((({((((.....))))}............((((((..((((((((((((((((((((((.......)))))))))...)).)))).))))....)))..)))).))..)))).))).)))))))
Back