Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_MACF1_0067800

Sequence Length

282 nt

GC Content

0.5390

GGAAAUCCCUAAGUCAGCCAACCCCUCCUCCCAUGCCAAUCCUUUCACAGUCUGAAGCAAAAAACCCACGGAUCAACCAGCUUUCUGCCCGCUGGCAGCAGGUGUGGCUGUUAGCACUGGAGCGGCAAAGGAAACUGAAUGAUGCCUUGGAUCGGCUGGAGGAGUUUGGGGAUUCUCAGCAGUUGCGGCUGGUCCGUAUUCUGCGCAGCACCGUGAUGGUUCGCGUUGGUGGAGGAUGGAUGGCCUUGGAUGAAUUUUUAGUGAAAAAUGAUCCCUGCCGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-93.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -97.88

Frequency: 0.0004

Diversity: 72.50

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.....(((((...((((.(((((((.((.((((.((((...((((.(((((..(((..........((((((..((((((((((((((((((((((.......)))))))))...)).)))).))))....)))..)))).))..((((((((((.((..(((.(((....))))))..)).))))))))))......))).))).)).)))).)))).)))).)).)))))..)).)))))))))....((((((....))))))..)))((....))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((,..,||((,{(...{(((.{{(((((.((.((((.{({({..((((.(((((..(((..........((((((..((((((((((((((((((((((.......)))))))))...)).)))).))))....)))..)))).))..((((((((((.((..({{{(((....))))))..)).))))))))))},.,,.))).))).)).)))).))}).)))).)).))))).,)).))))},.||{{.,,(((((....))))}).})))||},..))